Comparative modeling of CAFASP2 competition

Chem-Bio Informatics Journal

Volumn 1, Issue 4, 2001, Pages 136-148

  Iwadate, Mitsuo ^a   Ebisawa, Kazuyoshi ^a   Umeyama, Hideaki ^a  

^a KITASATO UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

CAFASP2; Comparative Modeling; Protein Structure Prediction

Indexed keywords

EID: 0000682333     PISSN: 13476297     EISSN: 13470442     Source Type: Journal    
DOI: 10.1273/cbij.1.136     Document Type: Article

References (22)

1. J. M. Bujnicki, A. Elofsson, D. Fischer, and L. Rychlewski, Bioinformatics, 17, 750-751 (2001).
2. D. Fischer, Proteins, Suppl, in press (2001).
3. A. A. Schaffer, L. Aravind, T. L. Madden, S. Shavirin, J. L. Spouge, Y. I. Wolf, E. V. Koonin, and S. F. Altschul, Nucleic Acids Res., 29, 2994-3005 (2001).
4. K. Ogata and H. Umeyama, J. Mol. Graph. Model., 18, 258-272, 305-306 (2000).
5. P. A. Bates and M. J. Sternberg, Proteins, 37, 47-54 (1999).
6. S. G. Oliver, Nature, 379, 597-600 (1996).
7. C. A. Orengo, D. T. Jones, and J. M. Thornton, Nature, 372, 631-634 (1994).
8. B. Dujon, Trends Genet., 12, 263-270 (1996).
9. E. V. Koonin and A. R. Mushegian, Curr. Opin. Genet. Dev., 6, 757-762 (1996).
10. G. L. Miklos and G. M. Rubin, Cell, 86, 521-529 (1996).
11. D. Fischer, C. Barret, K. Bryson, A. Elofsson, A. Godzik, D. Jones, K. J. Karplus, L. A. Kelley, R. M. Maccallum, K. Pawowski, B. Rost, L. Rychlewski, and M. Sternberg, Proteins, Suppl, 209-217 (1999).
12. J. Moult, T. Hubbard, S. H. Bryant, K. Fidelis, and J. T. Pedersen, Proteins, Suppl, 2-6 (1997).
13. J. Moult, T. Hubbard, K. Fidelis, and J. T. Pedersen, Proteins, Suppl, 2-6 (1999).
14. E. E. Lattman, Proteins, 44, 399 (2001).
15. J. De Vlieg, R. M. Scheek, W. F. Van Gunsteren, H. J. Berendsen, R. Kaptein, and J. Thomason, Proteins, 3, 209-218 (1988).
16. R. Sanchez and A. Sali, Proteins, Suppl, 50-58 (1997).
17. W. R. Pearson and D. J. Lipman, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 85, 2444-2448 (1988).
18. W. C. Barker, J. S. Garavelli, Z. Hou, H. Huang, R. S. Ledley, P. B. Mcgarvey, H. W. Mewes, B. C. Orcutt, F. Pfeiffer, A. Tsugita, C. R. Vinayaka, C. Xiao, L. S. Yeh, and C. Wu, Nucleic Acids Res., 29, 29-32 (2001).
19. S. F. Altschul, W. Gish, W. Miller, E. W. Myers, and D. J. Lipman, J. Mol. Biol., 215, 403-410 (1990).
20. H. M. Berman, T. N. Bhat, P. E. Bourne, Z. Feng, G. Gilliland, H. Weissig, and J. Westbrook, Nat. Struct. Biol., 7 Suppl, 957-959 (2000).
21. H. M. Berman, J. Westbrook, Z. Feng, G. Gilliland, T. N. Bhat, H. Weissig, I. N. Shindyalov, and P. E. Bourne, Nucleic Acids Res., 28, 235-242 (2000).
22. N. Siew, A. Elofsson, L. Rychlewski, and D. Fischer, Bioinformatics, 16, 776-785 (2000).