Identification of new spectral signatures associated with dengue virus infected sera

Journal of Raman Spectroscopy

Volumn 48, Issue 5, 2017, Pages 705-710

  Amin, Ayyaz ^a   Ghouri, Nimrah ^a   Ali, Safdar ^c   Ahmed, M ^b   Saleem, M ^b   Qazi, Javaria ^a  

^a QUAID I AZAM UNIVERSITY   (Pakistan)

^b NATIONAL INSTITUTE OF LASERS AND OPTRONICS NILOP   (Pakistan)

^c NONE   (Pakistan)

Author keywords

Dengue virus infection; Optical diagnosis; Partial least square regression (PLSR); Raman spectroscopy

Indexed keywords

AMIDES; AMINO ACIDS; DISCRIMINANT ANALYSIS; INFRARED DEVICES; LASER EXCITATION; LIPIDS; PRINCIPAL COMPONENT ANALYSIS; RAMAN SCATTERING; SPECTRUM ANALYSIS; STRETCHING; VIBRATION ANALYSIS; VIRUSES;

DENGUE VIRUS; DENGUE VIRUS INFECTION; LINEAR DISCRIMINANT ANALYZE; OPTICAL DIAGNOSIS; OPTICAL DIAGNOSTIC TOOLS; PARTIAL LEAST SQUARE REGRESSION; RAMAN BANDS; SPECTRAL SIGNATURE; VIRUS INFECTION;

RAMAN SPECTROSCOPY;

EID: 85032303038     PISSN: 03770486     EISSN: 10974555     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jrs.5110     Document Type: Article

References (50)

1. S. Ray, P. J. Reddy, R. Jain, K. Gollapalli, A. Moiyadi, S. Srivastava, Proteomics 2011, 11, 2139.
2. K. Kong, C. Kendall, N. Stone, I. Notinghe, Adv. Drug Deliv. Rev. 2015, 89, 121.
3. S. Li, L. Li, Q. Zeng, Y. Zhang, Z. Guo, Z. Liu, M. Jin, C. Su, L. Lin, J. Xu, S. Liu, Sci. Rep. 2015, 5, 9582.
4. A. Sharma, S. Sharma, A. Zarrow, R. A. Schwartz, W. C. Lambert, Indian J. Dermatol. Venereol. 2016, 61, 1.
5. M. Bilal, M. Saleem, S. T. Amanat, H. A. Shakoor, R. Rashid, A. Mahmood, M. Ahmed, J. Biomed. Opt. 2015, 20, 017002.
6. Y. Clement, Q. Liu, J. Biomed. Opt. 2012, 17, 0170051.
7. S. Firdous, M. Ahmed, A. Rehman, M. Nawaz, S. Anwar, S. Murtaza, Laser Phys. Lett. 2012, 9, 317.
8. A. Shahzad, S. Firdous, Laser Phys. Lett. 2015, 12, 076001.
9. L. Sitole, F. Steffens, D. Meyer, Curr. Metabolomics. 2015, 3, 65.
10. S. Bhatt, P. W. Gething, O. J. Brady, J. P. Messina, A. W. Farlow, C. L. Moyes, J. M. Drake, J. M. Brownstein, J. S. Hoen, A. G. Sankoh, M. F. Myers, Nature 2013, 496, 504.
11. O. J. Brady, P. W. Gething, S. Bhatt, J. P. Messina, J. S. Brownstein, A. G. Hoen, C. L. Moyes, A. W. Farlow, T. W. Scott, I. H. Simon, PLoS Negl. Trop. Dis. 2012, 6, 1760.
12. S. Q. Zaman, E. Roshan, A. Mahmood, S. Mahmood, Pak Armed Forces. Med J. 2016, 66, 16.
13. -1441.
14. M. Saleem, M. Bilal, S. Anwar, A. Rehman, M. Ahmed, Laser Phys. Lett. 2013, 10, 035602.
15. L. H. Chen, M. E. Wilson, Dengue Bull. 2005, 29, 18.
16. J. L. Pichardo-Molina, C. Frausto-Reyes, O. Barbosa-García, R. Huerta-Franco, J. L. González-Trujillo, C. A. Ramírez-Alvarado, G. Gutiérrez-Juárez, C. Medina-Gutiérrez, Lasers Med. Sci. 2007, 22, 229.
17. Knief P (2010) PhD Thesis Dublin Institute of Technology.
18. Knief P, 2011, web link: www.biospk.de.
19. H. J. Byrne, P. Knief, M. E. Keating, F. Bonnier, Chem. Soc. Rev. 2016.
20. S. R. Panikkanvalappil, M. James, S. M. Hira, J. Mobley, T. Jilling, N. Ambalavanan, M. A. El-Sayed, J. Am. Chem. Soc. 2016.
21. S. Khan, R. Ullah, M. Saleem, M. Bilal, R. Rashid, I. Khan, A. Mahmood, M. Nawaz, Optik 2016, 127, 2086.
22. W. Wang, J. Zhao, M. Short, H. Zeng, J. Biophotonics 2015, 8, 527.
23. S. O. L. Janus, K. S. Malek, M. G. Glogowska, T. Walski, M. Komorowska, W. Witkiewicz, C. Pezowicz, M. Kobielarz, S. Szotek, Acta Bioeng. Biomech. 2012, 14, 101.
24. A. V. Lichtenstein, S. M. Hovsep, L. D. Tomei, S. R. Umansky, Ann. N. Y. Acad. Sci. 2001, 945, 249.
25. K. S. Myint, T. P. Endy, D. Mongkolsirichaikul, C. Manomuth, S. Kalayanarooj, D. W. Vaughn, A. Nisalak, S. Green, A. L. Rothman, F. A. Ennis, D. H. Libraty, J. Infect. Dis. 2006, 194, 607.
26. D. V. John, Y. S. Lin, G. C. Perng, J. Biomed. Sci. 2015, 22, 1.
27. T. T. N. Ha, N. T. Huy, L. A. Murao, N. T. P. Lan, T. T. Thuy, H. M. Tuan, C. T. P. Nga, V. V. Tuong, T. Van Dat, M. Kikuchi, M. Yasunami, PLoS One 2011, 6, e25969
28. I. Choi, Y. S. Huh, D. Erickson, Microfluid. Nanofluid. 2012, 12, 669.
29. S. R. Panikkanvalappil, S. M. Hira, M. A. El-Sayed, Chem. Sci. 2016, 7, 1133.
30. L. Cui, Y. H. Lee, Y. Kumar, F. Xu, K. Lu, E. E. Ooi, S. R. Tannenbaum, C. N. Ong, PLoS Negl. Trop. Dis. 2013, 7, e2373
31. R. Takhampunya, R. Padmanabhan, S. Ubol, J. Gen. Virol. 2006, 87, 3003.
32. S. G. Demos, A. J. Vogel, A. H. Gandjbakhche, J. Mammary Gland, Biol. Neoplasia. 2006, 11, 165.
33. H. C. Chiu, H. Hannemann, K. J. Heesom, D. A. Matthews, A. D. Davidson, PLoS One 2014, 9, e93305
34. A. P. Kaplan, K. Joseph, M. Silverberg, J. Allergy, Clin. Immunol. 2002, 109, 195.
35. S. Ray, R. Srivastava, K. Tripathi, V. Vaibhav, S. Patankar, S. Srivastava, OMICS 2012, 16, 527.
36. X. F. Tan, S. Wu, S. Li, Z. Chen, F. Chen, Virol. J. 2011, 8, 1.
37. G. Li, H. Yang, Y. Xu, Z. Zhang, Sci. China Ser. C Life Sci. 2002, 45, 405.
38. L. M. Almond, J. Hutchings, G. Lloyd, H. Barr, N. Shepherd, J. Day, O. Stevens, S. Sanders, M. Wadley, N. Stone, C. Kendall, Gastrointest. Endosc. 2014, 79, 37.
39. J. de Jesús Martinez-Barraganand, R. M. Del Angel, J. Virol. 2001, 75, 7827.
40. E. Navarro-Sanchez, R. Altmeyer, A. Mara, O. Schwartz, F. Fieschi, J. L. Virelizier, F. Arenzana-Seisdedos, and P. Despre’s, EMBO Rep. 2003.
41. H. H. Biswas, A. Gordon, A. Nuñez, M. A. Perez, A. Balmaseda, E. Harris, PLoS Negl. Trop. Dis. 2015, 9, e0003904
42. Z. Movasaghi, S. Rehman, I. U. Rehman, Appl. Spectrosc. Rev. 2007, 42, 493.
43. M. E. Darvin, I. Gersonde, H. Albrecht, M. Meinke, W. Sterry, J. Lademann, Laser Phys. Lett. 2006, 3, 463.
44. S. Ali, A. Majid and A. Khan, Amino Acids 2014, 46, 977.
45. L. Su, Y. F. Sun, Y. Chen, P. Chen, A. G. Shen, X. H. Wang, J. Jia, Y. F. Zhao, X. D. Zhou, J. M. Hu, Laser Phys. 2012, 22, 311.
46. F. A. Rey, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003, 100, 6901.
47. D. K. Agrawal, P. Tandon, U. C. Chaturvedi, A. Kumar, J. Gen. Virol. 1978, 40, 408.
48. G. N. Milligan, V. V. Sarathy, E. Infante, L. Li, G. A. Campbell, P. R. Beatty, E. Harris, A. D. Barrett, N. Bourne, PLoS One 2015, 10, e0125476
49. S. Khadka, A. D. Vangeloff, C. Zhang, P. Siddavatam, N. S. Heaton, L. Wang, R. Sengupta, S. Sahasrabudh, G. Randall, M. Gribskov, R. J. Kuhn, R. Perera, D. J. LaCount, Mol. Cell. Proteomics 2011, 10, 012187.
50. C. Krafft, L. Neudert, T. Simat, R. Salzer, Spectrochim. Acta, Part A 2005, 61, 1535.