Simultaneous Determination of Multiple Intracellular Primary Metabolites by Ultrahigh Performance Liquid Chromatography Coupled with a Q Exactive HF Mass Spectrometer

Analytical Chemistry

Volumn 88, Issue 19, 2016, Pages 9647-9653

  Qiu, Nannan ^a   Wu, Di ^a,b   Cui, Xia ^a   Li, Guoliang ^a,d   Fan, Sai ^c   Chen, Dawei ^a   Zhao, Yunfeng ^a   Wu, Yongning ^a  

^a CHINA NATIONAL CENTER FOR FOOD SAFETY RISK ASSESSMENT   (China)

^b XIAMEN UNIVERSITY   (China)

^c CHINESE CENTER FOR DISEASE CONTROL AND PREVENTION   (China)

^d QUFU NORMAL UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; BIOCHEMISTRY; BIOMOLECULES; BIOSYNTHESIS; CHROMATOGRAPHY; ELECTROSPRAY IONIZATION; ISOMERS; METABOLITES; PLANTS (BOTANY); REMOVAL;

ACCURATE QUANTIFICATIONS; BIOSYNTHESIS PATHWAYS; CORRELATION COEFFICIENT; METABOLIC PATHWAYS; PRIMARY METABOLITE; SIMULTANEOUS DETERMINATIONS; TRICARBOXYLIC ACID CYCLE; ULTRA-HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHIES;

LIQUID CHROMATOGRAPHY;

PHOSPHOGLYCERATE MUTASE; PHOSPHOGLYCERATE MUTASE 1, HUMAN;

HEP-G2 CELL LINE; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; HUMAN; MASS SPECTROMETRY; METABOLISM;

CHROMATOGRAPHY, HIGH PRESSURE LIQUID; HEP G2 CELLS; HUMANS; MASS SPECTROMETRY; PHOSPHOGLYCERATE MUTASE;

EID: 84989963465     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.6b02417     Document Type: Article

References (35)

1. Fiehn, O.; Kopka, J.; Dörmann, P.; Altmann, T.; Trethewey, R. N.; Willmitzer, L. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 1157-1161 10.1038/81137
2. Blow, N. Nature 2008, 455, 697-700 10.1038/455697a
3. Spratlin, J. L.; Serkova, N. J.; Eckhardt, S. G. Clin. Cancer Res. 2009, 15, 431-440 10.1158/1078-0432.CCR-08-1059
4. Griffiths, W. J.; Koal, T.; Wang, Y.; Kohl, M.; Enot, D. P.; Deigner, H. P. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5426-5445 10.1002/anie.200905579
5. Ye, G.; Liu, Y.; Yin, P.; Zeng, Z.; Huang, Q.; Kong, H.; Lu, X.; Zhong, L.; Zhang, Z.; Xu, G. J. Proteome Res. 2014, 13, 1994-2004 10.1021/pr4011298
6. Büscher, J. M.; Czernik, D.; Ewald, J. C.; Sauer, U.; Zamboni, N. Anal. Chem. 2009, 81, 2135-2143 10.1021/ac8022857
7. Kuehnbaum, N. L.; Britz-McKibbin, P. Chem. Rev. 2013, 113, 2437-2468 10.1021/cr300484s
8. Hirayama, A.; Kami, K.; Sugimoto, M.; Sugawara, M.; Toki, N.; Onozuka, H.; Kinoshita, T.; Saito, N.; Ochiai, A.; Tomita, M.; Esumi, H.; Soga, T. Cancer Res. 2009, 69, 4918-4925 10.1158/0008-5472.CAN-08-4806
9. O'Hagan, S.; Dunn, W. B.; Knowles, J. D.; Broadhurst, D.; Williams, R.; Ashworth, J. J.; Cameron, M.; Kell, D. B. Anal. Chem. 2007, 79, 464-476 10.1021/ac061443+
10. Nordstrom, A.; O'Maille, G.; Qin, C.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2006, 78, 3289-3295 10.1021/ac060245f
11. Hu, S.; Wang, J.; Ji, E. H.; Christison, T.; Lopez, L.; Huang, Y. Anal. Chem. 2015, 87, 6371-6379 10.1021/acs.analchem.5b01350
12. Theodoridis, G.; Gika, H. G.; Wilson, I. D. TrAC, Trends Anal. Chem. 2008, 27, 251-260 10.1016/j.trac.2008.01.008
13. Vuckovic, D. Anal. Bioanal. Chem. 2012, 403, 1523-1548 10.1007/s00216-012-6039-y
14. Luo, B.; Groenke, K.; Takors, R.; Wandrey, C.; Oldiges, M. J. Chromatogr. A 2007, 1147, 153-164 10.1016/j.chroma.2007.02.034
15. Zhao, L.; Liu, L.; Wang, S.; Zhang, Y.; Yu, L.; Ding, Y. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2007, 133, 771-782 10.1007/s00432-007-0222-0
16. Evans, M. J.; Morris, G. M.; Wu, J.; Olson, A. J.; Sorensen, E. J.; Cravatt, B. F. Mol. BioSyst. 2007, 3, 495-506 10.1039/b705113a
17. Cortesi, L.; Barchetti, A.; Matteis, E. D.; Rossi, E.; Casa, L. D.; Marcheselli, L.; Tazzioli, G.; Lazzaretti, M. G.; Ficarra, G.; Federico, M.; Iannone, A. J. Proteome Res. 2009, 8, 4916-4933 10.1021/pr900239h
18. Evans, M. J.; Morris, G. M.; Wu, J.; Olson, A. J.; Sorensen, E. J.; Cravatt, B. F. Mol. BioSyst. 2007, 3, 495-506 10.1039/b705113a
19. Chen, G.; Gharib, T. G.; Wang, H.; Huang, C. C.; Kuick, R.; Thomas, D. G.; Shedden, K. A.; Misek, D. E.; Taylor, J. G.; Giordano, T. J.; Kardia, S. R.; Lannettoni, M. D.; Yee, J.; Hogg, P. J.; Orringer, M. B.; Hanash, S. M.; Beer, D. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003, 100, 13537-13542 10.1073/pnas.2233850100
20. Cortesi, L.; Barchetti, A.; Matteis, E. D.; Rossi, E.; Casa, L. D.; Marcheselli, L.; Tazzioli, G.; Lazzaretti, M. G.; Ficarra, G.; Federico, M.; Iannone, A. J. Proteome. Res. 2009, 8, 4916-4933 10.1021/pr900239h
21. Ren, F.; Wu, H.; Lei, Y.; Zhang, H.; Liu, R.; Zhao, Y.; Chen, X.; Zeng, D.; Tong, A.; Chen, L.; Wei, Y.; Huang, C. Mol. Cancer 2010, 9, 81 10.1186/1476-4598-9-81
22. Zhao, L.; Liu, L.; Wang, S.; Zhang, Y.; Yu, L.; Ding, Y. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2007, 133, 771-782 10.1007/s00432-007-0222-0
23. Ahmad, S. S.; Glatzle, J.; Bajaeifer, K.; Bühler, S.; Lehmann, T.; Königsrainer, I.; Vollmer, J. P.; Sipos, B.; Ahmad, S. S.; Northoff, H.; Königsrainer, A.; Zieker, D. Int. J. Oncol. 2013, 43, 586-590 10.3892/ijo.2013.1971
24. Lorenz, M. A.; Burant, C. F.; Kennedy, R. T. Anal. Chem. 2011, 83, 3406-3414 10.1021/ac103313x
25. Maddocks, O. D. K.; Berkers, C. R.; Mason, S. M.; Zheng, L.; Blyth, K.; Gottlieb, E.; Vousden, K. H. Nature 2013, 493, 542-546 10.1038/nature11743
26. Chen, D.; Zhao, Y.; Miao, H.; Wu, Y. Mol. Cancer. J. Chromatogr. A 2014, 1374, 268-272 10.1016/j.chroma.2014.11.070
27. Tufi, S.; Lamoree, M.; Boer, J. D.; Leonards, P. J. Chromatogr. A 2015, 1395, 79-87 10.1016/j.chroma.2015.03.056
28. Kumar, P.; Rúbies, A.; Centrich, F.; Granados, M.; Cortés-Francisco, N.; Caixach, J.; Companyó, R. Anal. Chim. Acta 2013, 780, 65-73 10.1016/j.aca.2013.04.017
29. Frenich, A. G.; Romero-Gonzalez, R.; Gómez-Pérez, M. L.; Vidal, J. L. M. J. Chromatogr. A 2011, 1218, 4349-4356 10.1016/j.chroma.2011.05.005
30. Li, H.; Chen, D.; Miao, H.; Zhao, Y.; Shen, J.; Wu, Y. J. Chromatogr. A 2015, 1410, 99-109 10.1016/j.chroma.2015.07.080
31. Li, C.; Xiao, Z.; Chen, Z.; Zhang, X.; Li, J.; Wu, X.; Li, X.; Yi, H.; Li, M.; Zhu, G.; Liang, S. Proteomics 2006, 6, 547-558 10.1002/pmic.200500256
32. Shen, J.; Wang, W.; Wu, J.; Feng, B.; Chen, W.; Wang, M.; Tang, J.; Wang, F.; Cheng, F.; Pu, L.; Tang, Q.; Wang, X.; Li, X. PLoS One 2012, 7, e47476 10.1371/journal.pone.0047476
33. Lei, Y.; Huang, K.; Gao, C.; Lau, Q. C.; Pan, H.; Xie, K.; Li, J.; Liu, R.; Zhang, T.; Xie, N.; Nai, H. S.; Wu, H.; Dong, Q.; Zhao, X.; Nice, E. C.; Huang, C.; Wei, Y. Mol. Cell. Proteomics 2011, 10, M110.005397 10.1074/mcp.M110.005397
34. Evans, M. J.; Saghatelian, A.; Sorensen, E. J.; Cravatt, B. F. Nat. Biotechnol. 2005, 23, 1303-1307 10.1038/nbt1149
35. Buescher, J. M.; Moco, S.; Sauer, U.; Zamboni, N. Anal. Chem. 2010, 82, 4403-4412 10.1021/ac100101d