Identification of modes of interactions between 9-aminoacridine hydrochloride hydrate and serum proteins by low and high resolution spectroscopy and molecular modeling

RSC Advances

Volumn 6, Issue 58, 2016, Pages 53454-53468

  Mitra, Piyali ^a   Pal, Uttam ^b   Chandra Maiti, Nakul ^b   Ghosh, Anirban ^c   Bhunia, Anirban ^c   Basu, Samita ^a  

^a SAHA INSTITUTE OF NUCLEAR PHYSICS   (India)

^b INDIAN INSTITUTE OF CHEMICAL BIOLOGY   (India)

^c BOSE INSTITUTE   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING ENERGY; BINS; BODY FLUIDS; DICHROISM; ENERGY TRANSFER; EXCITED STATES; GROUND STATE; HYDRATES; HYDRATION; LIGANDS; MOLECULAR MODELING; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PHOTOLYSIS; SPECTROSCOPIC ANALYSIS; STOICHIOMETRY; THERMOANALYSIS;

CIRCULAR DICHROISM SPECTRA; EXCITED-STATE PROTON TRANSFER; HIGH-RESOLUTION SPECTROSCOPY; IDENTIFICATION OF MODES; PHOTO-INDUCED ELECTRON TRANSFER; RESONANCE ENERGY TRANSFER; SATURATION-TRANSFER DIFFERENCES; THERMO DYNAMIC ANALYSIS;

PROTEINS;

EID: 84973355666     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c6ra04140j     Document Type: Article

References (73)

1. W. R. Harris Coord. Chem. Rev. 1996 149 347 365
2. P. B. Kandagal S. Ashoka J. Seetharamappa S. M. T. Shaikh Y. Jadegoud O. B. Ijare J. Pharm. Biomed. Anal. 2006 41 393 399
3. S. M. T. Shaikh J. Seetharamappa S. Ashoka P. B. Kandagal Dyes Pigm. 2007 73 211 216
4. J. L. Irvin E. M. Irvin J. Biol. Chem. 1952 196 651 668
5. Y. J. Hu Y. Liu R. M. Zhao J. X. Dong S. S. Qu J. Photochem. Photobiol., A 2006 179 324 329
6. Y. Q. Wang H. M. Zhang G. C. Zhang W. H. Tao S. H. Tang J. Mol. Struct. 2007 830 40 45
7. Y. Q. Wang H. M. Zhang G. C. Zhang W. H. Tao Z. H. Fei Z. T. Liu J. Pharm. Biomed. Anal. 2007 43 1869 1875
8. A. Sułkowska J. Mol. Struct. 2002 614 227 232
9. K. Aidas J. M. H. Olsen J. Kongsted H. Ågren J. Phys. Chem. B 2013 117 2069 2080
10. A. Ray B. Koley Seth U. Pal S. Basu Spectrochim. Acta, Part A 2012 92 164 174
11. B. Chakraborty S. Basu J. Lumin. 2009 129 34 39
12. B. Chakraborty A. Singha Roy S. Dasgupta S. Basu J. Phys. Chem. A 2010 114 13313 13325
13. M. Banerjee U. Pal A. Subudhhi A. Chakrabarti S. Basu J. Photochem. Photobiol., B 2012 108 23 33
14. P. Mitra M. Banerjee S. Biswas S. Basu J. Photochem. Photobiol., B 2013 121 46 56
15. X. M. He D. C. Carter Nature 1992 358 209 215
16. D. C. Carter X. M. He Science 1990 249 302 303
17. D. C. Carter J. X. Ho Adv. Protein Chem. 1994 45 153 203
18. M. Dockal D. C. Carter F. Ruker J. Biol. Chem. 2000 275 3042 3050
19. D. Charbonneau M. Beauregard H. A. Tajmir-Riahi J. Phys. Chem. B 2009 113 1777 1784
20. M. D. Topal Biochemistry 1984 23 2367 2372
21. D. O. Jordan L. N. Sansom Biopolymers 1971 10 399 410
22. C. Rehn U. Pindur Monatsh. Chem. 1996 127 645 658
23. E. L. Loechler J. King Biochemistry 1986 25 5858 5864
24. T. Bentin P. E. Nielsen J. Am. Chem. Soc. 2003 125 6378 6379
25. A. I. Kononov J. Phys. Chem. B 2001 105 535 541
26. W. E. Lee W. G. Galley Biophys. J. 1988 54 627 635
27. Y. F. Long C. Z. Huang Y. F. Li J. Phys. Chem. B 2007 111 4535 4538
28. Y. A. Hannun R. M. Bell J. Biol. Chem. 1988 263 5124 5131
29. G. P. Sachdev A. D. Brownstein J. S. Fruton J. Biol. Chem. 1974 249 420 427
30. S. I. Bae R. Zhao R. M. Snapka Biochem. Pharmacol. 2008 76 1653 1668
31. E. L. Loechler J. King Biochemistry 1986 25 5858 5864
32. H. Schmidt A. Al-Ibrahim U. L. B. Dietzel L. Biker Photochem. Photobiol. 1981 33 127 130
33. S. Grzesiek H. Otto N. A. Dencher Biophys. J. 1989 55 1101 1109
34. P. Gangola N. B. Joshi D. D. Pant Chem. Phys. Lett. 1981 80 418 421
35. D. D. Pant G. C. Joshi H. B. Tripathi Pramana-Journal of Physics 1986 27 161 170
36. A. Murza S. Alvarez-Méndez S. Sanchez-Cortes J. V. García-Ramos Biopolymers 2003 72 174 184
37. A. Murza S. Sánchez-Cortés J. V. García-Ramos J. M. Guisan C. Alfonso G. Rivas Biochemistry 2000 39 10557 10565
38. A. Murza S. Sánchez-Cortés J. V. García-Ramos Biospectroscopy 1998 4 327 339
39. P. Mitra B. Chakraborty D. Bhattacharyya S. Basu J. Phys. Chem. A 2013 117 1428 1438
40. P. Mitra B. Chakraborty S. Basu J. Lumin. 2014 149 221 230
41. P. Mitra B. Chakraborty S. Basu Chem. Phys. Lett. 2014 610-611 108 114
42. P. Mitra P. K. Chakraborty P. Saha P. Ray S. Basu Int. J. Pharm. 2014 473 636 643
43. J. R. Lakowicz, Principles of Fluorescence Spectroscopy, Plenum Press, New York, 2006
44. T. K. Maiti K. S. Ghosh A. Samanta S. Dasgupta J. Photochem. Photobiol., A 2008 194 297 307
45. T. Imoto L. S. Forster J. A. Rupley F. Tanaka Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1971 69 1151 1155
46. M. Mondal A. Chakrabarti FEBS Lett. 2002 532 396 400
47. J. Min X. Meng-Xia Z. Dong L. Yuan L. Xiao-Yu C. Xing J. Mol. Struct. 2004 692 71 80
48. S. Banerjee S. Dutta Choudhury S. Dasgupta S. Basu J. Lumin. 2008 128 437 444
49. T. Barri T. Trtić-Petrović M. Karlsson J. Åke Jönsson J. Pharm. Biomed. Anal. 2008 48 49 56
50. K. Kitamura H. Mano Y. Shimamoto Y. Tadokoro K. Tsuruta S. Kitagawa Fresenius. J. Anal. Chem. 1997 358 509 513
51. J. A. Goodrich and J. F. Kugel, Binding and kinetics for Molecular Biologist, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 2007
52. H. Gao L. Lei J. Liu Q. Kong X. Chen Z. Hu J. Photochem. Photobiol., A 2004 167 213 221
53. R. J. Read P. D. Adams W. B. Arendall A. T. Brunger P. Emsley R. P. Joosten G. J. Kleywegt E. B. Krissinel T. Lütteke Z. Otwinowski A. Perrakis J. S. Richardson W. H. Sheffler J. L. Smith I. J. Tickle G. Vriend P. H. Zwart Structure 2011 19 1395 1412
54. C. Azuara E. Lindahl P. Koehl H. Orland M. Delarue Nucleic Acids Res. 2006 34 W38 W42
55. J. Yu Y. Zhou I. Tanaka M. Yao Bioinformatics 2010 26 46 52
56. N. R. Voss M. Gerstein Nucleic Acids Res. 2010 38 W555 W562
57. O. Trott A. J. Olson J. Comput. Chem. 2010 31 455 461
58. M. Gerstein Acta Crystallogr., Sect. A: Found. Crystallogr. 1992 48 271 276
59. M. Mayer B. Meyer Angew. Chem., Int. Ed. 1999 38 1784 1788
60. V. Banerjee R. K. Kar A. Datta K. Parthasarathi S. Chatterjee K. P. Das A. Bhunia PLoS One 2013 8 72318
61. A. Bhunia S. Bhattacharjya S. Chatterjee Drug Discovery Today 2012 17 505 513
62. U. Kragh-Hansen Pharmacol. Rev. 1981 33 17 33
63. B. Valeur and J. C. Brochon, New Trends in Fluorescence Spectroscopy, Springer, Berlin, 2001
64. G. M. Morris D. S. Goodsell R. S. Halliday R. Huey W. E. Hart R. K. Belew A. J. Olson J. Comput. Chem. 1998 19 1639 1662
65. M. Belletete M. Lachapelle G. Durocher J. Phys. Chem. 1990 94 7642 7648
66. D. Bose D. Sarkar N. Chattopadhyay Photochem. Photobiol. 2010 86 538 544
67. J. Gonzalez-Jimenez M. Cortijo J. Protein Chem. 2002 21 75 79
68. D. V. Bent E. Hayon J. Am. Chem. Soc. 1975 97 2612 2619
69. D. Creed Photochem. Photobiol. 1984 39 537 562
70. T. Uematsu T. Waki T. Torimoto S. Kuwabata J. Phys. Chem. C 2009 113 21621
71. A. Harriman J. Phys. Chem. 1987 91 6102 6104
72. A. J. Ryan J. Ghuman P. A. Zunszain C.-W. Chung S. Curry J. Struct. Biol. 2011 174 84 91
73. M. Mayer B. Meyer J. Am. Chem. Soc. 2001 123 6108 6117