Comprehensive density functional theory study on the mechanism of activation of the nonapeptide hormone oxytocin by metal ions

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 3, 2010, Pages 1417-1423

  Xu, Xuee ^a   Yu, Wenbo ^a   Huang, Zhijian ^a   Lin, Zijing ^a,b  

^a UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY OF CHINA   (China)

^b UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY OF CHINA   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CALCIUM; METAL IONS; METALS; TRACE ANALYSIS; ZINC;

BASIS SET SUPERPOSITION ERRORS; BIVALENT METAL IONS; DIVALENT METAL ION; ELECTRONIC ENERGIES; FREE ENERGY CHANGE; MINIMAL EFFECTS; MONOVALENT METAL ION; PHYSIOLOGICAL FUNCTIONS; RELEVANT REACTIONS; THEORETICAL CALCULATIONS; THERMOCHEMICAL PROPERTIES; VIBRATIONAL FREQUENCIES;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EID: 84962377263     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp907436p     Document Type: Article

References (51)

1. Gimpl, G.; Fahrenholz, F. Physiol. Rev. 2001, 81, 629-683.
2. Winslow, J. T.; Hastings, N.; Carter, C. S.; Harbaugh, C. R.; Insel, T. R. Nature 1993, 365, 545-548.
3. Barberis, C.; Mouillac, B.; Durroux, T. J. Endocrinol. 1998, 156, 223-229.
4. Vigneaud, V. D.; Ressler, C.; Trippett, S. J. Biol. Chem. 1953, 205, 949-957.
5. Kimura, T.; Tanizawa, O.; Mori, K.; Browenstein, M. J.; Okayama, H. Nature 1992, 356, 526-529.
6. Postina, R.; Kojro, E.; Fahrenholz, F. J. Biol. Chem. 1996, 271, 31593-31601.
7. Fanelli, F.; Barbier, P.; Zanchetta, D.; De Benedetti, P. G.; Chini, B. Mol. Pharmacol. 1999, 56, 214-225.
8. Lodyga-Chruscinska, E.; Micera, G.; Sanna, D.; Olczak, J.; Zabrocki, J.; Kozlowski, H.; Chruscinski, L. J. Inorg. Biochem. 1999, 76, 1-11.
9. Gouet, P.; Fabry, B.; Guillet, V.; Birek, C.; Mourey, L.; Kahn, D.; Samama, J. P. Structure 1999, 7, 1517-1526.
10. Kalafatis, M.; Egan, J. O.; Van't Veer, C.; Cawthern, K. M.; Mann, K. G. Crit. Rev. Eukaryotic Gene Expression 1997, 7, 241-280.
11. Liu, D.; Seuthe, A. B.; Ehrler, O. T.; Zhang, X.; Wyttenbach, T.; Hsu, J. F.; Bowers, M. T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 2024-2025.
12. Soloff, M. S.; Swartz, T. L. J. Biol. Chem. 1973, 248, 6471-6478.
13. Pearlmutter, A. F.; Soloff, M. S. J. Biol. Chem. 1979, 254, 3899-3906.
14. Liwo, A.; Tempczyk, A.; Oldziey, S.; Shenderovich, M. D.; Hruby, V. J.; Talluri, S.; Ciarkowski, J.; Kasprzykowski, F.; Lankiewicz, L.; Grzonka, Z. Biopolymers. 1996, 38, 157-175.
15. Wei, H.; Luo, X.; Wu, Y.; Yao, Y.; Guo, Z.; Zhu, L. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 2000, 10, 4196-4200.
16. Wyttenbach, T.; Liu, D.; Bowers, M. T. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 5993-6000.
17. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-793.
18. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1372-1377.
19. Yu, W.; Liang, L.; Lin, Z.; Ling, S.; Haranczyk, M.; Gutowski, M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 589-600.
20. Miura, M.; Aoki, Y.; Champagne, B. J. Chem. Phys. 2007, 127, 084103-1-16.
21. Anderson, J. A.; Tschumper, G. S. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 7268-7271.
22. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 415-432.
23. Amin, E. A.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 75-85.
24. Sorkin, A.; Truhlar, D. G.; Amin, E. A. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 1254-1265.
25. Yu, W.; Xu, X.; Li, H.; Pang, R.; Fang, K.; Lin, Z. J. Comput. Chem. 2009, 30, 2105-2121.
26. Simon, S.; Duran, M.; Dannenberg, J. J. J. Chem. Phys. 1996, 105, 11024-11301.
27. Boys, S. F.; Bernardi, F. Mol. Phys. 1970, 19, 553-566.
28. Claverie, P.; Daudey, J. P; Langlet, J.; Pallman, B.; Piazzola, D.; Huron, M. J. J. Phys. Chem. 1978, 82, 405-418.
29. Beveridge, D. L.; Schnuelle, G. W. J. Phys. Chem. 1974, 78, 2064-2069.
30. Chen, M.; Lin, Z. J. Chem. Phys. 2007, 127, 154314-154324.
31. Leng, Y.; Zhang, M.; Song, C.; Chen, M.; Lin, Z. Theochem-J. Mol. Struct. 2008, 858, 52-65.
32. Pliego, J. R, Jr.; Riveras, J. M. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 7241-7247.
33. Pliego, J. R., Jr.; Riveros, J. M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 7434-7439.
34. Cao, Z.; Lin, M.; Zhang, Q.; Mo, Y. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4277-4282.
35. Stewart, J. J. P. J. Comput. Chem. 1989, 10, 209-220.
36. Stewart, J. J. P. J. Comput. Chem. 1989, 10, 221-264.
37. Miertus, S.; Scrocco, E.; Tomasi, J. Chem. Phys. 1981, 55, 117-129.
38. Miertus, S.; Tomasi, J. Chem. Phys. 1982, 65, 239-245.
39. Cossi, M.; Barone, V.; Cammi, R.; Tomasi, J. Chem. Phys. Lett. 1996, 255, 327-335.
40. Tawa, G. J.; Topol, I. A.; Burt, S. K.; Caldwell, R. A.; Rashin, A. A. J. Chem. Phys. 1998, 109, 4852-4863.
41. NIST Chemistry WebBook, http://webbook.nist.gov/chemistry
42. Tunon, I.; Rinaldi, D.; Ruiz-Lopez, M. F.; Rivail, J. L. J. Phys. Chem. 1995, 99, 3798-3805.
43. Bryantsev, V. S.; Diallo, M. S.; Goddard, W. A., III J. Phys. Chem. B 2008, 112, 9709-9719.
44. Cao, Z.; Balasubramanian, K. J. Chem. Phys. 2005, 123, 114309-114320.
45. Tommaso, D. D.; Leeuw, N. H. D. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 6965-6975.
46. Tissandier, M. D.; Cowen, K. A.; Feng, W.; Gundlach, E.; Cohen, M. H.; Earhart, A. D.; Coe, J. V.; Tuttle, T. R. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 7787-7794.
47. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malicj, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision B.04; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
48. Urry, D. W.; Ohnishi, M.; Walter, R Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1970, 66, 111-116.
49. Maksic, Z. B.; Kovacevic, B. Chem. Phys. Lett. 1999, 307, 497-504.
50. Ling, S.; Yu, W.; Huang, Z.; Lin, Z.; Haranczyk, M.; Gutowski, M J. Phys. Chem. A 2006, 110, 12282-12291.
51. Hunter, E. P. L.; Lias, S. G. J. Phys. Chem. Ref. Data 1998, 27, 413-656.