Complex modeling: A strategy and software program for combining multiple information sources to solve ill posed structure and nanostructure inverse problems

Acta Crystallographica Section A: Foundations and Advances

Volumn 71, Issue , 2015, Pages 562-568

  Juhás, Pavol ^a   Farrow, Christopher L ^b   Yang, Xiaohao ^b   Knox, Kevin R ^a   Billinge, Simon J L ^a,b  

^a BROOKHAVEN NATIONAL LABORATORY   (United States)

^b Department of Earth and Environmental Sciences   (United States)

Author keywords

complex modeling; nanostructure analysis; Python software framework

Indexed keywords

EID: 84946714137     PISSN: None     EISSN: 20532733     Source Type: Journal    
DOI: 10.1107/S2053273315014473     Document Type: Article

References (40)

1. Armatas, G. S. & Kanatzidis, M. G. (2006). Science, 313, 817-820
2. Beecher, A. N., Yang, X., Palmer, J. H., LaGrassa, A. L., Juhas, P, Billinge, S. J. L. & Owen, J. S. (2014). J. Am. Chem. Soc. 136, 10645-10653
3. Billinge, S. J. L. (2010). Physics, 3, 25
4. Billinge, S. J. L. & Levin, I. (2007). Science, 316, 561-565
5. Biswas, K., He, J., Blum, I. D., Wu, C., Hogan, T. P., Seidman, D. N., Dravid, V. P. & Kanatzidis, M. G. (2012). Nature (London), 489, 414-418
6. Choi, J. J., Yang, X., Norman, Z. M., Billinge, S. J. L. & Owen, J. S. (2014). Nano Lett. 14, 127-133
7. Cliffe, M. J., Dove, M. T., Drabold, D. A. & Goodwin, A. L. (2010). Phys. Rev. Lett. 104, 125501
8. Dagotto, E., Burgy, J. & Moreo, A. (2003). Solid State Commun. 126, 9-22
9. Doan-Nguyen, V. V. T., Kimber, S. A. J., Pontoni, D., Reifsnyder Hickey, D., Diroll, B. T., Yang, X., Miglierini, M., Murray, C. B. & Billinge, S. J. L. (2014). ACS Nano, 8, 6163-6170
10. Dreele, R. V. (2013). GSAS-II. Crystallography data analysis software. https://subversion.xor.aps.anl.gov/trac/pyGSAS
11. Farrow, C. L., Bediako, D. K., Surendranath, Y., Nocera, D. G. & Billinge, S. J. L. (2013). J. Am. Chem. Soc. 135, 6403-6406
12. Farrow, C. L. & Billinge, S. J. L. (2009). Acta Cryst. A65, 232-239
13. Farrow, C. L., Juhas, P., Liu, J., Bryndin, D., Bozin, E. S., Bloch, J., Proffen, T. & Billinge, S. J. L. (2007). J. Phys. Condens. Matter, 19, 335219
14. Farrow, C., Shi, C., Juhas, P., Peng, X. & Billinge, S. J. L. (2014). J. Appl. Cryst. 47, 561-565
15. Favre-Nicolin, V. & Cerny, R. (2002). J. Appl. Cryst. 35, 734-743
16. Ghidiu, M., Naguib, M., Shi, C., Mashtalir, O., Pan, L., Zhang, B., Yang, J., Gogotsi, Y., Billinge, S. J. L. & Barsoum, M. W. (2014). Chem. Commun. 50, 9517-9520
17. Grosse-Kunstleve, R. W., Sauter, N. K., Moriarty, N. W. & Adams, P. D. (2002). J. Appl. Cryst. 35, 126-136
18. Horn, R. A. & Johnson, C. R. (1990). Matrix Analysis. Cambridge University Press
19. Hsu, K. F., Loo, S., Guo, F., Chen, W., Dyck, J. S., Uher, C., Hogan, T., Polychroniadis, E. K. & Kanatzidis, M. G. (2004). Science, 303, 818-821
20. Jacques, S. D. M., Di Michiel, M., Kimber, S. A. J., Yang, X., Cernik, R. J., Beale, A. M. & Billinge, S. J. L. (2013). Nat. Commun. 4, 2536
21. Jensen, K. M. O., Christensen, M., Juhas, P., Tyrsted, C., Bøjesen, E. D., Lock, N., Billinge, S. J. L. & Iversen, B. B. (2012). J. Am. Chem. Soc. 134, 6785-6792
22. Juhas, P., Cherba, D. M., Duxbury, P. M., Punch, W. F. & Billinge, S. J. L. (2006). Nature (London), 440, 655-658
23. Lin, H., Bozin, E. S., Billinge, S. J. L., Quarez, E. & Kanatzidis, M. G. (2005). Phys. Rev. B, 72, 174113
24. McGinley, C., Riedler, M., Moller, T., Borchert, H., Haubold, S., Haase, M. & Weller, H. (2002). Phys. Rev. B, 65, 245308
25. Mozharivskyj, Y., Pecharsky, A. O., Bud'ko, S. & Miller, G. J. (2004). Chem. Mater. 16, 1580-1589
26. Neuberger, T., Schopf, B., Hofmann, H., Hofmann, M. & von Rechenberg, B. (2005). J. Magn. Magn. Mater. 293, 483-496
27. Prill, D., Juhas, P., Schmidt, M. U. & Billinge, S. J. L. (2015). J. Appl. Cryst. 48, 171-178
28. Proffen, T. & Billinge, S. J. L. (1999). J. Appl. Cryst. 32, 572-575
29. Rodriguez-Carvajal, J. & Gonzalez-Platas, J. (2003). IUCr Comput. Commun. Newsl. 1, 50-58
30. Rolison, D. R., Long, J. W., Lytle, J. C., Fischer, A. E., Rhodes, C. P., McEvoy, T. M., Bourg, M. E. & Lubers, A. M. (2009). Chem. Soc. Rev. 38, 226-252
31. Shi, C., Beidaghi, M., Naguib, M., Mashtalir, O., Gogotsi, Y. & Billinge, S. J. L. (2014). Phys. Rev. Lett. 112, 125501
32. Steigerwald, M. L. & Brus, L. E. (1989). Annu. Rev. Mater. Sci. 19, 471-495
33. Stucky, G., Sakamoto, Y., Kaneda, M., Terasaki, O., Zhao, D. Y., Kim, J. M., Shin, H. J. & Ryoo, R. (2000). Nature (London), 408, 449-453
34. Sun, Y.-P., Li, X., Cao, J., Zhang, W. & Wang, H. P. (2006). Adv. Colloid Interface Sci. 120, 47-56
35. Tyrsted, C., Ørnsbjerg Jensen, K. M., Bøjesen, E. D., Lock, N., Christensen, M., Billinge, S. J. L. & Brummerstedt Iversen, B. (2012). Angew. Chem. Int. Ed. 51, 9030-9033
36. Yang, X., Masadeh, A. S., McBride, J. R., Bozin, E. S., Rosenthal, S. J. & Billinge, S. J. L. (2013). Phys. Chem. Chem. Phys. 15, 8480-8486
37. Young, D. (2001). Computational Chemistry: a Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems. New York: Wiley-Interscience
38. Zhang, H. Z., Gilbert, B., Huang, F. & Banfield, J. F. (2003). Nature (London), 424, 1025-1029
39. Zhu, M., Farrow, C. L., Post, J. E., Livi, K. J. T., Billinge, S. J. L., Ginder-Vogel, M. & Sparks, D. L. (2012). Geochim. Cosmochim. Acta, 81, 39-55
40. Zhu, M., Northrup, P., Shi, C., Billinge, S. J. L., Sparks, D. L. & Waychunas, G. A. (2014). Environ. Sci. Technol. Lett. 1, 97-101