Label-Free MicroRNA Detection Based on Fluorescence Quenching of Gold Nanoparticles with a Competitive Hybridization

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 21, 2015, Pages 10822-10829

  Wang, Wei ^a   Kong, Tao ^a   Zhang, Dong ^a   Zhang, Jinan ^b   Cheng, Guosheng ^a  

^a SUZHOU INSTITUTE OF NANO TECH AND NANO BIONICS   (China)

^b Bona Tianyuan Biotech LLC   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EFFICIENCY; FLUORESCENCE; GOLD; NANOPARTICLES; RNA;

BIOLOGICAL PROCESS; BIOLOGICAL SAMPLES; COMPETITIVE HYBRIDIZATION; EFFICIENT DETECTION; FLUORESCENCE QUENCHING; MICRORNA DETECTIONS; NUCLEOTIDE SEQUENCES; QUENCHING EFFICIENCY;

QUENCHING;

GOLD; MICRORNA; NANOPARTICLE;

BIOASSAY; CHEMISTRY; FLUORESCENCE; HUMAN; LIMIT OF DETECTION; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; PROCEDURES; STAINING;

BIOLOGICAL ASSAY; FLUORESCENCE; GOLD; HUMANS; LIMIT OF DETECTION; MICRORNAS; NANOPARTICLES; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; STAINING AND LABELING;

EID: 84946398238     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.5b01930     Document Type: Article

References (53)

1. Schwarzenbach, H.; Hoon, D. S. B.; Pantel, K. Nat. Rev. Cancer 2011, 11, 426-437 10.1038/nrc3066
2. Kato, M.; Slack, F. J. Biol. Cell 2008, 100, 71-81 10.1042/BC20070078
3. Liu, N.; Olson, E. N. Dev. Cell 2010, 18, 510-525 10.1016/j.devcel.2010.03.010
4. Hizir, M. S.; Balcioglu, M.; Rana, M.; Robertson, N. M.; Yigit, M. V. ACS Appl. Mater. Interfaces 2014, 6, 14772-14778 10.1021/am504190a
5. Jung, M.; Schaefer, A.; Steiner, I.; Kempkensteffen, C.; Stephan, C.; Erbersdobler, A.; Jung, K. Clin. Chem. 2010, 56, 998-1006 10.1373/clinchem.2009.141580
6. Li, Y.; Kowdley, K. V. Genomics, Proteomics Bioinf. 2012, 10, 246-253 10.1016/j.gpb.2012.07.005
7. Guay, C.; Regazzi, R. Nat. Rev. Endocrinol. 2013, 9, 513-521 10.1038/nrendo.2013.86
8. Yan, L. X.; Huang, X. F.; Shao, Q.; Huang, M. Y.; Deng, L.; Wu, Q. L.; Zeng, Y. X.; Shao, J. Y. RNA 2008, 14, 2348-2360 10.1261/rna.1034808
9. Boyerinas, B.; Park, S. M.; Hau, A.; Murmann, A. E.; Peter, M. E. Endocr.-Relat. Cancer 2010, 17, F19-F36 10.1677/ERC-09-0184
10. Pritchard, C. C.; Cheng, H. H.; Tewari, M. Nat. Rev. Genet. 2012, 13, 358-369 10.1038/nrg3198
11. Smith, S. M.; Murray, D. W. Methods Mol. Biol. 2012, 823, 119-138 10.1007/978-1-60327-216-2-9
12. Munafo, D. B.; Robb, G. B. RNA 2010, 16, 2537-2552 10.1261/rna.2242610
13. Shen, Y.; Zheng, K. X.; Duan, D.; Jiang, L.; Li, J. Anal. Chem. 2012, 84, 6361-6365 10.1021/ac301360z
14. Wen, Y.; Pei, H.; Shen, Y.; Xi, J.; Lin, M.; Lu, N.; Shen, X.; Li, J.; Fan, C. Sci. Rep. 2012, 2, 867 10.1038/srep00867
15. Labib, M.; Khan, N.; Ghobadloo, S. M.; Cheng, J.; Pezacki, J. P.; Berezovski, M. V. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 3027-3038 10.1021/ja308216z
16. Wanunu, M.; Dadosh, T.; Ray, V.; Jin, J.; McReynolds, L.; Drndic, M. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 807-814 10.1038/nnano.2010.202
17. Sipova, H.; Zhang, S.; Dudley, A. M.; Galas, D.; Wang, K.; Homola, J. Anal. Chem. 2010, 82, 10110-10115 10.1021/ac102131s
18. Zhang, G. J.; Chua, J. H.; Chee, R. E.; Agarwal, A.; Wong, S. M. Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 2504-2508 10.1016/j.bios.2008.12.035
19. Lu, N.; Gao, A.; Dai, P.; Song, S.; Fan, C.; Wang, Y.; Li, T. Small 2014, 10, 2022-2028 10.1002/smll.201302990
20. Driskell, J. D.; Seto, A. G.; Jones, L. P.; Jokela, S.; Dluhy, R. A.; Zhao, Y. P.; Tripp, R. A. Biosens. Bioelectron. 2008, 24, 917-922 10.1016/j.bios.2008.07.060
21. Driskell, J. D.; Tripp, R. A. Chem. Commun. 2010, 46, 3298-3300 10.1039/c002059a
22. Baker, M. B.; Bao, G.; Searles, C. D. Nucleic Acids Res. 2012, 40 (2) e13 10.1093/nar/gkr1016
23. Lin, X.; Zhang, C.; Huang, Y.; Zhu, Z.; Chen, X.; Yang, C. J. Chem. Commun. 2013, 49, 7243-7245 10.1039/c3cc43224f
24. Duan, D.; Zheng, K. X.; Shen, Y.; Cao, R.; Jiang, L.; Lu, Z.; Yan, X.; Li, J. Nucleic Acids Res. 2011, 39, e154 10.1093/nar/gkr774
25. Zhang, Y.; Gao, A. H.; Liu, B.; Sheng, W.; Tan, C.; Yuan, M.; Wang, S. J. Environ. Sci. Health, Part B 2013, 48, 1-8 10.1080/03601234.2012.716667
26. Wang, J.; Yi, X.; Tang, H.; Han, H.; Wu, M.; Zhou, F. Anal. Chem. 2012, 84, 6400-6406 10.1021/ac203368h
27. Yao, L.; Wang, Y.; Xu, S. Chem. Commun. 2013, 49, 5183-5185 10.1039/c3cc40830b
28. Dubertret, B.; Calame, M.; Libchaber, A. J. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 365-370 10.1038/86762
29. Swierczewska, M.; Lee, S.; Chen, X. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 9929-9941 10.1039/c0cp02967j
30. Yang, R.; Jin, J.; Chen, Y.; Shao, N.; Kang, H.; Xiao, Z.; Tang, Z.; Wu, Y.; Zhu, Z.; Tan, W. H. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 8351-8358 10.1021/ja800604z
31. Li, S.; Aphale, A. N.; Macwan, I. G.; Patra, P. K.; Gonzalez, W. G.; Miksovska, J.; Leblanc, R. M. ACS Appl. Mater. Interfaces 2012, 4, 7069-7075 10.1021/am302704a
32. Li, F.; Pei, H.; Wang, L.; Lu, J.; Gao, J.; Jiang, B.; Zhao, X.; Fan, C. Adv. Funct. Mater. 2013, 23, 4140-4148 10.1002/adfm.201203816
33. Su, S.; Wei, X.; Zhong, Y.; Guo, Y.; Su, Y.; Huang, Q.; Lee, S. T.; Fan, C.; He, Y. ACS Nano 2012, 6, 2582-2590 10.1021/nn2050449
34. Wang, Q.; Wang, W.; Lei, J.; Xu, N.; Gao, F.; Ju, H. Anal. Chem. 2013, 85, 12182-12188 10.1021/ac403646n
35. Chen, P. C.; Mwakwari, S. C.; Oyelere, A. K. Nanotechnol. Sci. Appl. 2008, 1, 45-66 10.2147/NSA.S3707
36. Ji, X.; Song, X.; Li, J.; Bai, Y.; Yang, W.; Peng, X. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 13939-13948 10.1021/ja074447k
37. Jana, M. R.; Gearheart, L.; Murphy, C. J. Langmuir 2001, 17, 6782-6786 10.1021/la0104323
38. Sun, J.; Xianyu, Y.; Jiang, X. Chem. Soc. Rev. 2014, 43, 6239-6253 10.1039/C4CS00125G
39. Hitzbleck, M.; Delamarche, E. Chem. Soc. Rev. 2013, 42, 8494-8516 10.1039/c3cs60118h
40. Xia, F.; Zuo, X. L.; Yang, R. Q.; Xiao, Y.; Kang, D.; Vallee-Belisle, A.; Gong, X.; Yuen, J. D.; Hsu, B. B. Y.; Heeger, A. J.; Plaxco, K. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010, 107, 10837-10841 10.1073/pnas.1005632107
41. Hsu, C. Y.; Huang, J. W.; Lin, K. J. Chem. Commun. 2011, 47, 872-874 10.1039/C0CC04168H
42. Lebanony, D.; Benjamin, H.; Gilad, S.; Ezagouri, M.; Dov, A.; Ashkenazi, K.; Gefen, N.; Izraeli, S.; Rechavi, G.; Pass, H.; Nonaka, D.; Li, J.; Spector, Y.; Rosenfeld, N.; Chajut, A.; Cohen, D.; Aharonov, R.; Mansukhani, M. J. Clin. Oncol. 2009, 27, 2030-2037 10.1200/JCO.2008.19.4134
43. Rabinowits, G.; Gerçel-Taylor, C.; Day, J. M.; Taylor, D. D.; Kloecker, G. H. Clin. Lung Cancer 2009, 10, 42-46 10.3816/CLC.2009.n.006
44. Xu, Z.; Xu, L.; Liz-Marzan, L. M.; Ma, W.; Kotov, N. A.; Wang, L.; Kuang, H.; Xu, C. Adv. Opt. Mater. 2013, 1, 626-630 10.1002/adom.201300148
45. Frens, G. Nature, Phys. Sci. 1973, 241, 20-22 10.1038/physci241020a0
46. Liu, J.; Lu, Y. Nat. Protoc. 2006, 1, 246-252 10.1038/nprot.2006.38
47. Dulkeith, E.; Morteani, A. C.; Niedereichholz, T.; Klar, T. A.; Feldmann, J.; Levi, S. A.; van Veggel, F. C.; Reinhoudt, D. N.; Möller, M.; Gittins, D. I. Phys. Rev. Lett. 2002, 89 (20) 203002 10.1103/PhysRevLett.89.203002
48. Song, S.; Liang, Z.; Zhang, J.; Wang, L.; Li, G.; Fan, C. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 8670-8674 10.1002/anie.200901887
49. Mayilo, S.; Kloster, M. A.; Wunderlich, M.; Lutich, A.; Klar, T. A.; Nichtl, A.; Kürzinger, K.; Stefani, F. D.; Feldmann, J. Nano Lett. 2009, 9, 4558-4563 10.1021/nl903178n
50. Kumar, B. R.; Basheer, N. S.; George, S. D.; Kurian, A. 3rd International Conference on Photonics 2012, 3, 149-153 10.1109/ICP.2012.6379869
51. Tabakman, S. M.; Lau, L.; Robinson, J. T.; Price, J.; Sherlock, S. P.; Wang, H.; Zhang, B.; Chen, Z.; Tangsombatvisit, S.; Jarrell, J. A.; Utz, P. J.; Dai, H. Nat. Commun. 2011, 2, 466 10.1038/ncomms1477
52. Lakowicz, J. R. Anal. Biochem. 2005, 337, 171-194 10.1016/j.ab.2004.11.026
53. Mertens, H.; Koenderink, A. F.; Polman, A. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 2007, 76, 115123 10.1103/PhysRevB.76.115123