Enzymatic breakdown of biomass: Enzyme active sites, immobilization, and biofuel production

Green Chemistry

Volumn 16, Issue 11, 2014, Pages 4615-4626

  Dutta, Saikat ^a   Wu, Kevin C W ^a  

^a NATIONAL TAIWAN UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84908128601     PISSN: 14639262     EISSN: 14639270     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4gc01405g     Document Type: Review

References (61)

1. I. Gelfand R. Sahajpal X. Zhang R. C. Izaurralde K. L. Gross G. P. Robertson Nature 2013 493 514 517
2. E. A. Bayer J. P. Belaich Y. Shoham R. Lamed Annu. Rev. Microbiol. 2004 58 521 554
3. A. L. Demain M. Newcomb J. H. D. Wu Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2005 69 124 154
4. J. Lehtio J. Sugiyama M. Gustavsson L. Fransson M. Linder T. T. Teeri Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 484 489
5. Z. Schnepp Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 2 15
6. M. E. Himmel Science 2007 315 804 807
7. C. J. Yoeman Y. Han D. Dodd C. M. Schroeder R. I. Mackie I. K. Cann Adv. Appl. Microbiol. 2010 70 1 55
8. E. A. Bayer L. J. W. Shimon Y. Shoham R. Lamed J. Struct. Biol. 1998 124 221
9. M. E. Himmel et al., in Fuels and Chemicals from Biomass, ed., B. C. Saha, and, J. Woodward, vol. 666 of American Chemical Society Symposium Series, ACS, Washington, DC, 1997, pp. 2-45
10. M. G. Resch B. S. Donohoe J. O. Baker S. R. Decker E. A. Bayer G. T. Beckham M. E. Himmel Energy Environ. Sci. 2013 6 1858 1867
11. R. Brunecky M. Alhuhta Q. Xu B. S. Donohow M. F. Crowley I. A. Kataeva S.-J. Yang M. G. Resch M. W. W. Adams V. V. L. Lunin M. E. Himmel Y. J. Bomble Science 2013 342 1513 1516
12. G. Vaaje-Kolstad B. Westereng S. J. Horn Z. Liu H. Zhai M. Sørlie V. G. H. Eijsink Science 2010 330 219 222
13. Y. Nishiyama P. Langan H. Chanzy J. Am. Chem. Soc. 2002 124 9074
14. J. F. Matthews C. E. Skopec P. E. Mason P. Zuccato R. W. Torget J. Sugiyama M. E. Himmel J. W. Brady Carbohydr. Res. 2006 341 138
15. D. M. Alonso S. G. Wettstein J. A. Dumesic Chem. Soc. Rev. 2012 41 8075 8098
16. S. Y. Ding M. E. Himmel J. Agric. Food Chem. 2006 54 597
17. S. Yoshida D. S. Park B. Bae R. Mackie I. K. O. Caan S. K. Nair Biochemistry 2011 50 3369 3375
18. A. Berlin Science 2013 342 1454 1456
19. P. V. Harris D. Welner K. C. McFarland E. R, J.-C. N. Poulsen K. Brown R. Salbo H. Ding E. Vlasenko S. Merino F. Xu J. Cherry S. Larsen L. L. Leggio Biochemistry 2010 49 3305 3316
20. G. Davies B. Henrissat Structure 1995 3 853 859
21. M. Holmquist Curr. Protein Pept. Sci. 2000 1 209 235
22. A. Aden, Biochemical production of ethanol from corn stover: 2007 state of technology model, National Renewable Energy Laboratory, 2008
23. G. R. Hemsworth Curr. Opin. Struct. Biol. 2013 23 660 668
24. S. J. Horn G. Vaaje-Kolstad B. Westereng V. G. Eijsink Biotechnol. Biofuels 2012 5 45
25. S. Fushinobu Nat. Chem. Biol. 2014 10 88 89
26. G. R. Hemsworth B. Henrissat G. J. Davies P. H. Walton Nat. Chem. Biol. 2014 10 122 126
27. T. T. Teeri Biochem. Soc. Trans. 1998 26 173 178
28. S.-Y. Ding Science 2012 338 1055 1060
29. K. Igarashi J. Biol. Chem. 2009 284 36186 36190
30. K. Igarashi Science 2011 333 1279 1282
31. E. Betzig Science 2006 313 1642 1645
32. K. Igarashi Nat. Chem. Biol. 2013 9 350 351
33. J. Fan M. De Bruyn V. L. Budarin M. J. Gronnow P. S. Shuttleworth S. Breeden D. J. Macquarrie J. H. Clark J. Am. Chem. Soc. 2013 135 11728 11731
34. J. M. Fox P. Jess R. B. Jambusaria G. M. Moo J. Liphardt D. S. Clark H. W. Blanch Nat. Chem. Biol. 2013 9 356 361
35. S. L. Hirsh M. M. M. Bilek N. J. Nosworthy A. Kondyurin C. G. dos Remedios D. R. McKenzie Langmuir 2010 26 14380 14388
36. C. M. Phillips W. T. Beeson J. H. Cate M. A. Marletta ACS Chem. Biol. 2011 6 1399 1406
37. R. P. Chandra R. Bura W. E. Mabee A. Berlin X. Pan J. N. Saddler Biofuels 2007 108 67 93
38. D. L. Watson D. B. Wilson L. P. Walker Appl. Biochem. Biotechnol. 2002 101 97 111
39. J. Fan M. De Bruyn V. L. Budarin M. J. Gronnow P. S. Shuttleworth S. Breeden D. J. Macquarrie J. H. Clark J. Am. Chem. Soc. 2013 135 11728 11731
40. D. N. Tran K. J. Balkus ACS Catal. 2011 1 956 968
41. H. H. P. Yiu P. A. Wright J. Mater. Chem. 2005 15 3690 3700
42. S. L. Hirsh M. M. M. Bilek N. J. Nosworthy A. Kondyurin C. G. dos Remedios D. R. McKenzie Langmuir 2010 26 14380 14388
43. A. Popat S. B. Hartono F. Stahr J. Liu S. Z. Qiao G. Q. Lu Nanoscale 2011 3 2801 2818
44. M. Hartmann D. Jung J. Mater. Chem. 2010 20 844 857
45. Y. Zhang J. Li D. Han H. Zhang P. Liu C. Li Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008 365 609
46. R. H. Y. Chang J. Jang K. C. W. Wu Green Chem. 2011 13 2844 2850
47. Y.-C. Lee C.-T. Chen Y.-T. Chiu K. C.-W. Wu ChemCatChem 2013 5 2153 2157
48. A. Takimoto T. Shiomi K. Ino T. Tsunoda A. Kawai F. Mizukami K. Sakaguchi Microporous Mesoporous Mater. 2008 116 601 606
49. S. B. Hartono S. Z. Qiao J. Liu K. Jack B. P. Ladewig Z. P. Hao G. Q. M. Lu J. Phys. Chem. C 2010 114 8353 8362
50. L. C. Sang M. O. Coppens Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 6689
51. S. P. Chundawat G. T. Beckham M. E. Himmel B. E. Dale Annu. Rev. Chem. Biomol. Eng. 2011 2 121 145
52. B. W. McLean J. Biol. Chem. 2002 277 50245 50254
53. A. B. Boraston D. N. Bolam H. J. Gilbert G. J. Davies Biochem. J. 2004 382 769 781
54. S. V. Ranganathan S. L. Narasimhan K. Muthukumar Bioresour. Technol. 2008 99 3975 3981
55. N. Dizge B. Keskinler Biomass Bioenergy 2008 32 1274 1278
56. Y. Zeng S. Zhao S. Yang S.-Y. Ding Curr. Opin. Biotechnol. 2014 27 38 45
57. D. Klein-Marcuschamber P. Oleskowicz-Popiel B. A. Simmons H. W. Blanch Biotechnol. Bioeng. 2012 109 1083 1087
58. P. V. Harris F. Xu N. E. Kreel C. Kang S. Fukuyama Curr. Opin. Chem. Biol. 2014 19 162 170
59. K. L. Meibom X. B. Li A. T. Nielsen C.-Y. Wu S. Roseman G. K. Schoolnik Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 2524 2529
60. C. You H. Chen S. Myung N. Sathitsuksanoh H. Ma X. Zhang J. Y. Li Y.-H. Zhang Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013 110 7182 7187
61. J. Rocha-Martin B. de las Rivas R. Muñoz J. M. Guisan F. Lopez-Gallego ChemCatChem 2012 4 1279 1288