Molecular phenotypic profiling of a Saccharomyces cerevisiae strain at the single-cell level

Analyst

Volumn 139, Issue 22, 2014, Pages 5709-5717

  Schmidt, A Mareike ^a   Fagerer, Stephan R ^a   Jefimovs, Konstantins ^b   Buettner, Florian ^c   Marro, Christian ^a   Siringil, Erdem C ^b   Boehlen, Karl L ^b   Pabst, Martin ^a   Ibáñez, Alfredo J ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b SWISS FEDERAL LABORATORIES FOR MATERIALS SCIENCE AND TECHNOLOGY   (Switzerland)

^c INSTITUTE OF EPIDEMIOLOGY   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CYTOLOGY; MASS SPECTROMETRY; REPRODUCIBILITY; SACCHAROMYCES CEREVISIAE;

REPRODUCIBILITY OF RESULTS; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 84907978322     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4an01119h     Document Type: Article

References (27)

1. R. Zenobi, Science, 2013, 342, 6163.
2. A. Svatos, Anal. Chem. 2011, 83, 5037-5044.
3. M. Heinemann, R. Zenobi, Curr. Opin. Biotechnol. 2011, 22, 26-31.
4. S. J. Altschuler, L. F. Wu, Cell, 2010, 141, 559-563.
5. A. Raj, A. van Oudenaarden, Cell, 2008, 35, 216-226.
6. S. V. Avery, Nat. Rev. Microbiol. 2006, 4, 8, 577-587.
7. N. Q. Balaban, J. Merrin, R. Chait, L. Kowalik, S. Leibler, Science, 2004, 305, 1622-1625.
8. A. J. Ibáñez, S. R. Fagerer, A. M. Schmidt, P. L. Urban, K. Jefimovs, P. Geiger, R. Dechant, M. Heinemann, R. Zenobi, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110, 22, 8790-8794.
9. S. R. Fagerer, T. Schmid, A. J. Ibáñez, M. Pabst, R. Steinhoff, K. Jefimovs, P. L. Urban, R. Zenobi, Analyst, 2013, 138, 6732-6736.
10. P. L. Urban, A. M. Schmidt, S. R. Fagerer, A. Amantonico, A. Ibañez, K. Jefimovs, M. Heinemann, R. Zenobi, Mol. BioSyst. 2011, 7, 10, 2837-2840.
11. P. L. Urban, K. Jefimovs, A. Amantonico, S. R. Fagerer, T. Schmid, S. Mädler, J. Puigmarti-Luis, N. Goedecke, R. Zenobi, Lab Chip, 2010, 10, 23, 3206-3209.
12. A. M. Schmidt, PhD thesis, ETH Zürich, 2013.
13. K. Elbing, C. Larsson, R. M. Bill, E. Albers, J. L. Snoep, E. Boles, S. Hohmann, L. Gustafsson, Appl. Environ. Microbiol. 2004, 70, 5323-5330.
14. T. Fuhrer, D. Heer, B. Begemann, N. Zamboni, Anal. Chem. 2011, 83, 18, 7074-7080.
15. D. Yukihira, D. Miura, Y. Fujimura, Y. Umemura, S. Yamaguchi, S. Funatsu, M. Yamazaki, T. Ohta, H. Inoue, M. Shindo, H. Wariishi, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2014, 25, 1, 1-5.
16. S. R. Fagerer, S. Nielsen, A. Ibáñez, R. Zenobi, Eur. J. Mass Spectrom. 2013, 19, 39-47.
17. R. L. Vermillion-Salsbury, D. M. Hercules, Rapid Commun. Mass Spectrom. 2002, 16, 1575-1581.
18. M. Pabst, S. R. Fagerer, R. Köhling, S. K. Küster, R. Steinhoff, M. Badertscher, F. Wahl, P. S. Dittrich, K. Jefimovs, R. Zenobi, Anal. Chem. 2013, 85, 20, 9771-9776.
19. J. H. van Heerden, M. T. Wortel, F. J. Bruggeman, J. J. Heijnen, Y. J. Bollen, R. Planqué, J. Hulshof, T. G. O'Toole, S. A. Wahl, B. Teusink, Science, 2014, 343, 6174, 987.
20. D. A. Elias, S. L. Tollaksen, D. W. Kennedy, H. M. Mottaz, C. S. Giometti, J. S. McLean, E. A. Hill, G. E. Pinchuk, M. S. Lipton, J. K. Fredrickson, Y. A. Gorby, Arch. Microbiol. 2008, 189, 4, 313-324.
21. M. R. Mashego, K. Rumbold, M. De Mey, E. Vandamme, W. Soetaert, J. J. Heijnen, Biotechnol. Lett. 2007, 29, 1, 1-16.
22. N. C. Duarte, B. Ø. Palsson, P. Fu, BMC Genomics, 2004, 5, 63, 10.1186/1471-2164-5-6.
23. A. Amantonico, P. L. Urban, S. R. Fagerer, R. M. Balabin, R. Zenobi, Anal. Chem. 2010, 82, 7394-7400.
24. R. Dechant, S. Saad, A. Ibáñez, M. Peter, Mol. Cell, 2014, 55, 1-13.
25. D. H. Huberts, B. Niebel, M. Heinemann, FEMS Yeast Res. 2012, 12, 2, 118-128.
26. H. Pelicano, D. S. Martin, R. H. Xu, P. Huang, Oncogene, 2006, 25, 4633-4646.
27. N. M. Grüning, M. Rinnerthaler, K. Bluemlein, M. Mülleder, M. M. Wamelink, H. Lehrach, C. Jakobs, M. Breitenbach, M. Ralser, Cell Metab. 2011, 14, 3, 415-427.