Glycan microarrays: New angles and new strategies

Analyst

Volumn 139, Issue 11, 2014, Pages 2650-2657

  Donczo, Boglarka ^a   Kerekgyarto, Janos ^a   Szurmai, Zoltan ^a   Guttman, Andras ^a,b  

^a UNIVERSITY OF DEBRECEN   (Hungary)

^b UNIVERSITY OF PANNONIA   (Hungary)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

POLYSACCHARIDE;

CHEMISTRY; COMMUNICABLE DISEASE; HUMAN; PATHOPHYSIOLOGY;

COMMUNICABLE DISEASES; HUMANS; POLYSACCHARIDES;

EID: 84899822806     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3an02289g     Document Type: Review

References (64)

1. C. D. Rillahan, A. Antonopoulos, C. T. Lefort, R. Sonon, P. Azadi, K. Ley, A. Dell, S. M. Haslam, J. C. Paulson, Nat. Chem. Biol., 2012, 8, 661-668
2. A. Varki and J. B. Lowe, in Essentials of Glycobiology, ed. A. Varki, R. D. Cummings, J. D. Esko, H. H. Freeze, P. Stanley, C. R. Bertozzi, G. W. Hart and M. E. Etzler, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor (NY), 2010/03/20 edn., 2nd edn. 2009, doi: NBK1897 [bookaccession], ch. 6
3. M. Doherty, J. Bones, N. McLoughlin, J. E. Telford, B. Harmon, M. R. Defelippis, P. M. Rudd, Anal. Biochem., 2013, 442, 10-18
4. N. Bionda, P. Cudic, Methods Mol. Biol., 2013, 1081, 151-165
5. T. Yue, B. B. Haab, Clin. Lab. Med., 2009, 29, 15-29
6. C. D. Rillahan, J. C. Paulson, Annu. Rev. Biochem., 2011, 80, 797-823
7. S. V. Bennun, K. J. Yarema, M. J. Betenbaugh, F. J. Krambeck, PLoS Comput. Biol., 2013, 9, e1002813
8. D. M. Ratner, E. W. Adams, J. Su, B. R. O’Keefe, M. Mrksich, P. H. Seeberger, ChemBioChem, 2004, 5, 379-382
9. J. Heimburg-Molinaro, X. Song, D. F. Smith and R. D. Cummings, Current Protocols in Protein Science, 2011, ch. 12, unit12 10
10. M. J. Heller, Annu. Rev. Biomed. Eng., 2002, 4, 129-153
11. S. R. Stowell, C. M. Arthur, M. Dias-Baruffi, L. C. Rodrigues, J. P. Gourdine, J. Heimburg-Molinaro, T. Ju, R. J. Molinaro, C. Rivera-Marrero, B. Xia, D. F. Smith, R. D. Cummings, Nat. Med., 2010, 16, 295-301
12. S. Park, M. R. Lee, I. Shin, Bioconjugate Chem., 2009, 20, 155-162
13. A. R. de Boer, C. H. Hokke, A. M. Deelder, M. Wuhrer, Anal. Chem., 2007, 79, 8107-8113
14. H. Wang, Y. Zhang, X. Yuan, Y. Chen, M. Yan, Bioconjugate Chem., 2011, 22, 26-32
15. M. D. Disney, P. H. Seeberger, Chem. Biol., 2004, 11, 1701-1707
16. T. Horlacher, P. H. Seeberger, Chem. Soc. Rev., 2008, 37, 1414-1422
17. S. Park, I. Shin, Angew. Chem., Int. Ed., 2002, 41, 3180-3182
18. B. T. Houseman, M. Mrksich, Chem. Biol., 2002, 9, 443-454
19. E. Mercey, R. Sadir, E. Maillart, A. Roget, F. Baleux, H. Lortat-Jacob, T. Livache, Anal. Chem., 2008, 80, 3476-3482
20. M. R. Lee, I. Shin, Angew. Chem., Int. Ed., 2005, 44, 2881-2884
21. M. R. Lee, S. Park, I. Shin, Methods Mol. Biol., 2012, 808, 103-116
22. S. Park, M. R. Lee, I. Shin, Chem. Commun., 2008, 4389-4399 doi: 10.1039/b806699j
23. X. Wang, E. Matei, A. M. Gronenborn, O. Ramstrom, M. Yan, Anal. Chem., 2012, 84, 4248-4252
24. F. J. Alvarez, J. B. Konopka, Mol. Biol. Cell, 2007, 18, 965-975
25. O. Oyelaran, J. C. Gildersleeve, Curr. Opin. Chem. Biol., 2009, 13, 406-413
26. X. Song, Y. Lasanajak, B. Xia, D. F. Smith, R. D. Cummings, ACS Chem. Biol., 2009, 4, 741-750
27. O. Bohorov, H. Andersson-Sand, J. Hoffmann, O. Blixt, Glycobiology, 2006, 16, 21C-27C
28. P. Xia, J. Okumura, P. Yan, M. Xie, S. Wu, M. Zhuang, J. Zheng, C. Zhang, M. Zhang, M. Kato, G. Cai, T. Yamamoto, PLoS One, 2013, 8, e76483
29. H. Leffler, S. H. Barondes, J. Biol. Chem., 1986, 261, 10119-10126
30. X. Song, B. Xia, S. R. Stowell, Y. Lasanajak, D. F. Smith, R. D. Cummings, Chem. Biol., 2009, 16, 36-47
31. T. Feizi, W. Chai, Nat. Rev. Mol. Cell Biol., 2004, 5, 582-588
32. Y. Liu, R. A. Childs, A. S. Palma, M. A. Campanero-Rhodes, M. S. Stoll, W. Chai, T. Feizi, Methods Mol. Biol., 2012, 808, 117-136
33. L. Kong, J. H. Lee, K. J. Doores, C. D. Murin, J. P. Julien, R. McBride, Y. Liu, A. Marozsan, A. Cupo, P. J. Klasse, S. Hoffenberg, M. Caulfield, C. R. King, Y. Hua, K. M. Le, R. Khayat, M. C. Deller, T. Clayton, H. Tien, T. Feizi, R. W. Sanders, J. C. Paulson, J. P. Moore, R. L. Stanfield, D. R. Burton, A. B. Ward, I. A. Wilson, Nat. Struct. Mol. Biol., 2013, 20, 796-803
34. X. Song, J. Heimburg-Molinaro, N. M. Dahms, D. F. Smith, R. D. Cummings, Methods Mol. Biol., 2012, 808, 137-148
35. B. J. Hooper, D. P. O’Hare, Aviat., Space Environ. Med., 2013, 84, 803-813
36. T. Pochechueva, F. Jacob, D. R. Goldstein, M. E. Huflejt, A. Chinarev, R. Caduff, D. Fink, N. Hacker, N. V. Bovin, V. Heinzelmann-Schwarz, Glycoconjugate J., 2011, 28, 507-517
37. R. Govindarajan, J. Duraiyan, K. Kaliyappan, M. Palanisamy, J. Pharm. BioAllied Sci., 2012, 4, S310-S312
38. N. Razi, A. Varki, Glycobiology, 1999, 9, 1225-1234
39. M. E. Taylor, K. Drickamer, Glycobiology, 2009, 19, 1155-1162
40. Y. Zhang, Q. Li, L. G. Rodriguez, J. C. Gildersleeve, J. Am. Chem. Soc., 2010, 132, 9653-9662
41. T. Schallus, C. Jaeckh, K. Feher, A. S. Palma, Y. Liu, J. C. Simpson, M. Mackeen, G. Stier, T. J. Gibson, T. Feizi, T. Pieler, C. Muhle-Goll, Mol. Biol. Cell, 2008, 19, 3404-3414
42. J. Hirabayashi, J. Biochem., 2008, 144, 139-147
43. L. Krishnamoorthy, L. K. Mahal, ACS Chem. Biol., 2009, 4, 715-732
44. D. L. Meany, L. Hackler Jr, H. Zhang, D. W. Chan, J. Proteome Res., 2011, 10, 1425-1431
45. S. E. Pontow, V. Kery, P. D. Stahl, Int. Rev. Cytol., 1992, 137B, 221-244
46. D. J. Vigerust, S. Vick, V. L. Shepherd, BMC Immunol., 2012, 13, 51
47. J. L. de Paz, D. Spillmann, P. H. Seeberger, Chem. Commun., 2006, 3116-3118 doi: 10.1039/b605318a
48. C. T. Campbell, S. R. Llewellyn, T. Damberg, I. L. Morgan, M. Robert-Guroff, J. C. Gildersleeve, PLoS One, 2013, 8, e75302
49. K. Srinivasan, R. Raman, A. Jayaraman, K. Viswanathan, R. Sasisekharan, PLoS One, 2013, 8, e59550
50. S. Park, J. C. Gildersleeve, O. Blixt, I. Shin, Chem. Soc. Rev., 2013, 42, 4310-4326
51. O. Blixt, S. Head, T. Mondala, C. Scanlan, M. E. Huflejt, R. Alvarez, M. C. Bryan, F. Fazio, D. Calarese, J. Stevens, N. Razi, D. J. Stevens, J. J. Skehel, I. van Die, D. R. Burton, I. A. Wilson, R. Cummings, N. Bovin, C. H. Wong, J. C. Paulson, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2004, 101, 17033-17038
52. S. T. Reddy, N. M. Dahms, Protein Expression Purif., 2002, 26, 290-300
53. E. H. Aarntzen, I. J. de Vries, J. H. Goertz, M. Beldhuis-Valkis, H. M. Brouwers, M. W. van de Rakt, R. G. van der Molen, C. J. Punt, G. J. Adema, P. J. Tacken, I. Joosten, J. F. Jacobs, Cancer Immunol. Immunother., 2012, 61, 2003-2011
54. O. Oyelaran, J. C. Gildersleeve, Proteomics: Clin. Appl., 2010, 4, 285-294
55. Z. Yin, X. Huang, J. Carbohydr. Chem., 2012, 31, 143-186
56. D. L. Lamm, J. I. Dehaven, D. R. Riggs, Eur. Urol., 2000, 37, Suppl. 3, 41-44
57. T. P. Smith, S. L. Kennedy, M. Fleshner, J. Appl. Physiol., 2004, 97, 491-498
58. X. Zhou, C. Turchi, D. Wang, J. Proteome Res., 2009, 8, 5031-5040
59. C. H. Lawrie, T. Marafioti, C. S. Hatton, S. Dirnhofer, G. Roncador, P. Went, A. Tzankov, S. A. Pileri, K. Pulford, A. H. Banham, Int. J. Cancer, 2006, 118, 3161-3166
60. O. J. Plante, E. R. Palmacci, P. H. Seeberger, Science, 2001, 291, 1523-1527
61. J. L. de Paz, C. Noti, P. H. Seeberger, J. Am. Chem. Soc., 2006, 128, 2766-2767
62. C. Noti, J. L. de Paz, L. Polito, P. H. Seeberger, Chemistry, 2006, 12, 8664-8686
63. F. Kamena, M. Tamborrini, X. Liu, Y. U. Kwon, F. Thompson, G. Pluschke, P. H. Seeberger, Nat. Chem. Biol., 2008, 4, 238-240
64. A. Quintas-Cardama, Y. H. Qiu, S. M. Post, Y. Zhang, C. J. Creighton, J. Cortes, S. M. Kornblau, Cancer, 2012, 118, 5283-5292