TracMass 2-A modular suite of tools for processing chromatography-full scan mass spectrometry data

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 7, 2014, Pages 3435-3442

  Tengstrand, Erik ^a   Lindberg, Johan ^b,c   Åberg, K Magnus ^a  

^a STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

^b Analytical Proof Sweden AB   (Sweden)

^c ASTRAZENECA R AND D   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALGORITHMS; DATA PROCESSING; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR BIOLOGY;

ANALYTE CONCENTRATION; BIOLOGICAL SAMPLES; CHROMATOGRAPHIC SEPARATIONS; LEARNING CURVES; MASS SPECTROMETRY DATA; PARAMETER SETTING; PEAK INTENSITY; PROCESSING STEPS;

PIPELINE PROCESSING SYSTEMS;

ALGORITHM; COMPUTER GRAPHICS; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; PROCEDURES;

ALGORITHMS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; COMPUTER GRAPHICS; MASS SPECTROMETRY;

EID: 84897534849     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac403905h     Document Type: Article

References (24)

1. Lommen, A.; Kools, H. Metabolomics 2012, 8, 719-726
2. Smith, C.; Want, E.; O'Maille, G.; Abagyan, R.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2006, 78, 779-787
3. Tautenhahn, R.; Patti, G. J.; Rinehart, D.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2012, 84, 5035-5039
4. Pluskal, T.; Castillo, S.; Villar-Briones, A.; Oresic, M. BMC Bioinf. 2010, 11 395
5. Katajamaa, M.; Orešič, M. J.Chromatogr. A 2007, 1158, 318-328
6. Ullsten, S.; Danielsson, R.; Bäckström, D.; Sjöberg, P.; Bergquist, J. J. Chromatogr. A 2006, 1117, 87-93
7. Jonsson, P.; Johansson, E. S.; Wuolikainen, A.; Lindberg, J.; Schuppe-Koistinen, I.; Kusano, M.; Sjöström, M.; Trygg, J.; Moritz, T.; Antti, H. J. Proteome Res. 2006, 5, 1407-1414
8. Shen, H.; Grung, B.; Kvalheim, O. M.; Eide, I. Anal. Chim. Acta 2001, 446, 311-326
9. Tautenhahn, R.; Bottcher, C.; Neumann, S. BMC Bioinf. 2008, 9, 504
10. Åberg, K. M.; Torgrip, R. J. O.; Kolmert, J.; Schuppe-Koistinen, I.; Lindberg, J. J. Chromatogr.A 2008, 1192, 139-146
11. Stolt, R.; Torgrip, R. J. O.; Lindberg, J.; Csenki, L.; Kolmert, J.; Schuppe-Koistinen, I.; Jacobsson, S. P. Anal. Chem. 2006, 78, 975-983
12. Zhang, J.; Gonzalez, E.; Hestilow, T.; Haskins, W.; Huang, Y. Curr.Genomics 2009, 10, 388-401
13. Danielsson, R.; Bylund, D.; Markides, K. E. Anal. Chim. Acta 2002, 454, 167-184
14. Bloemberg, T. G.; Gerretzen, J.; Lunshof, A.; Wehrens, R.; Buydens, L. M. C. Anal. Chim. Acta 2013, 781, 14-32
15. Prince, J. T.; Marcotte, E. M. Anal. Chem. 2006, 78, 6140-6152
16. Åberg, K. M.; Alm, E.; Torgrip, R. O. Anal. Bioanal. Chem. 2009, 394, 151-162
17. Csenki, L.; Alm, E.; Torgrip, R. O.; Åberg, K. M.; Nord, L.; Schuppe-Koistinen, I.; Lindberg, J. Anal. Bioanal. Chem. 2007, 389, 875-885
18. Alm, E.; Torgrip, R. O.; Åberg, K. M.; Schuppe-Koistinen, I.; Lindberg, J. Anal. Bioanal. Chem. 2009, 395, 213-223
19. Eilers, P. H. C.; Marx, B. D. Stat. Sci. 1996, 11, 89-102
20. Alm, E.; Slagbrand, T.; Åberg, K. M.; Wahlström, E.; Gustafsson, I.; Lindberg, J. Anal. Bioanal. Chem. 2012, 403, 443-455
21. Lange, E.; Tautenhahn, R.; Neumann, S.; Gröpl, C. BMC Bioinf. 2008, 9 375
22. Duran, A. L.; Yang, J.; Wang, L.; Sumner, L. W. BMC Bioinf. 2003, 19, 2283-2293
23. Eilers, P. H. C. Anal. Chem. 2003, 76, 404-411
24. Tengstrand, E.; Rosén, J.; Hellenäs, K.-E.; Åberg, K. M. Anal. Bioanal. Chem. 2013, 405, 1237-1243