A comparison of advanced monte carlo methods for open systems: CFCMC vs CBMC

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 10, Issue 3, 2014, Pages 942-952

  Torres Knoop, Ariana ^a   Balaji, Sayee Prasaad ^b   Vlugt, Thijs J H ^b   Dubbeldam, David ^a  

^a UNIVERSITY OF AMSTERDAM   (Netherlands)

^b DELFT UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84896293873     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct4009766     Document Type: Article

References (65)

1. Allen, M. P. and Tildesley, D. J. Computer Simulation of Liquids; Clarendon Press: Oxford, 1987.
2. Frenkel, D. and Smit, B. Understanding Molecular Simulation, 2 nd ed.; Academic Press: London, 2002.
3. Dubbeldam, D.; Torres-Knoop, A.; Walton, K. S. Mol. Simul. 2013, 39:14-15, 1253-1292
4. Siepmann, J. I.; Frenkel, D. Mol. Phys. 1992, 75, 59-70
5. Rosenbluth, M. N.; Rosenbluth, A. W. J. Chem. Phys. 1955, 23, 356-359
6. Shi, W.; Maginn, E. J. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 1451-1463
7. Shi, W.; Maginn, E. J. J. Comput. Chem. 2008, 29, 2520-2530
8. Rosch, T. W.; Maginn, E. J. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 269-279
9. Dubbeldam, D.; Calero, S.; Ellis, D. E.; Snurr, R. Q. RASPA 1.0: Molecular Software Package for Adsorption and Diffusion in Flexible Nanoporous Materials, 1.0-alpha ed.; Northwestern University: Evanston, IL, 2013.
10. Harris, J.; Rice, S. A. J. Chem. Phys. 1988, 88, 1298-1307
11. Siepmann, J. I. Mol. Phys. 1990, 70, 1145-1158
12. Frenkel, D.; Mooij, G. C. A. M.; Smit, B. J. Phys.: Condens. Matter 1992, 4, 3053-3076
13. de Pablo, J. J.; Suter, M.; Suter, U. W. J. Chem. Phys. 1992, 96, 2395-2403
14. Laso, M.; de Pablo, J. J.; Suter, U. W. J. Phys.: Condens. Matter 1992, 97, 2817-2819
15. de Pablo, J. J.; Siepmann, J. I.; McDonald, I. R. Mol. Phys. 1992, 75, 255-259
16. Panagiotopoulos, A. Z. Int. J. Thermophys. 1989, 10, 447-457
17. de Pablo, J. J.; Prausnitz, J. M. Fluid Phase Equilib. 1989, 53, 177-189
18. Panagiotopoulos, A. Z. In Observation, Prediction and Simulation of Phase Transitions in Complex Fluids; Baus, M.; Rull, L.R.; Ryckaert, J. P., Eds.; Vol. NATO ASI Series C; Kluwer Academic: The Netherlands, 1995; Vol. 460, pp 463-501.
19. Martin, M. G.; Siepmann, J. I. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 8921-8924
20. Martin, M. G.; Siepmann, J. I. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 4508-4517
21. Chen, B.; Siepmann, J. I. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 5370-5379
22. Macedonia, M. D.; Maginn, E. J. Mol. Phys. 1999, 96, 1375-1390
23. Vlugt, T. J. H.; Krishna, R.; Smit, B. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 1102-1118
24. Vlugt, T. J. H.; Martin, M. G.; Smit, B.; Siepmann, J. I.; Krishna, R. Mol. Phys. 1998, 94, 727-733
25. Vlugt, T. J. H. Mol. Simulat. 1999, 23, 63-78
26. Consta, S.; Vlugt, T. J. H.; Hoeth, J. Wichers; Smit, B.; Frenkel, D. Mol. Phys. 1999, 97, 1243-1254
27. Deem, M. W.; Bader, J. S. Mol. Phys. 1996, 87, 12451260
28. Wick, C. D.; Siepmann, J. I. Macromolecules 2000, 33, 7207-7218
29. Uhlherr, A. Macromolecules 2000, 33, 13511360
30. Shah, J. K.; Maginn, E. J. J. Chem. Phys. 2011, 135, Artn. 134121
31. Jakobtorweihen, S.; Lowe, C. P.; Keil, F. J.; Smit, B. J. Chem. Phys. 2006, 124, 154706
32. Martin, M. G.; Frischknecht, A. L. Mol. Phys. 2006, 104, 2439-2456
33. Martsinovski, A. P.; Lyubartsev, A. A.; Shevkunov, S. V.; Vorontsov-Velyaminov, P. N. J. Chem. Phys. 1992, 96, 1776-1783
34. Escobedo, F. A.; de Pablo, J. J. J. Chem. Phys. 1996, 105, 4391-4394
35. Duane, S.; Kennedy, A. D.; Pendleton, B. J.; Roweth, D. Phys. Lett. B 1987, 195, 216-222
36. Chempath, S.; Clark, L. A.; Snurr, R. Q. J. Chem. Phys. 2003, 118, 7635-7643
37. Wang, F.; Landau, D. P. Phys. Rev. E 2001, 64, 056101
38. Wang, F.; Landau, D. P. Phys. Rev. Lett. 2001, 86, 2050-2053
39. Vlugt, T. J. H.; Schenk, M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 12757-12763
40. June, R. L.; Bell, A. T.; Theodorou, D. N. J. Phys. Chem. 1990, 94, 8232-8240
41. Snurr, R. Q.; June, R. L.; Bell, A. T.; Theodorou, D. N. Mol. Simulat. 1991, 8, 73-92
42. Schultz, M. Spline Analysis; Prentice Hall: Englewood Cliffs, NJ, 1973.
43. Lekien, F.; Marsden, J. Int. J. Numer. Methods Eng. 2005, 63, 455-471
44. Press, W. H.; Flannery, B. P.; Teukolsky, S. A.; Vetterling, W. T. Numerical Recipes in C; Cambridge University Press: New York, 1988.
45. Vlugt, T. J. H.; Garcia-Perez, E.; Dubbeldam, D.; Ban, S.; Calero, S. J. Chem. Theory. Comput. 2008, 4, 1107-1118
46. Maesen, T. L. M.; Beerdsen, E.; Calero, S.; Dubbeldam, D.; Smit, B. J. Catal. 2006, 237, 278-290
47. Smit, B.; Maesen, T. L. M. Nature 1995, 374, 42-44
48. Dubbeldam, D.; Krishna, R.; Calero, S.; Yazaydin, A. O. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 1186711871
49. Herm, Z. R.; Wiers, B. M.; Mason, J. A.; van Baten, J. M.; Hudson, M. R.; Zajdel, P.; Brown, C. M.; Masciocchi, N.; Krishna, R.; Long, J. R. Science 2013, 340, 960-964
50. Mayo, S. L.; Olafson, B. D.; Goddard, W. A. J. Phys. Chem. 1990, 94, 8897-8909
51. Rappé, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A.; Skiff, W. M. J. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024-10035
52. Martin, M. G.; Siepmann, J. I. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2569-2577
53. Lorentz, H. A. Ann. Phys. 1881, 12, 127-136
54. Berthelot, D. C. R. Hebd. Sceances Acad. Sci. 1898, 126, 1703-1855
55. Peng, X.; Cheng, X.; Cao, D. J. Mater. Chem. 2011, 21, 11259-11270
56. Wu, H.; Zhou, W.; Yildirim, T. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 4995-5000
57. Yazaydin, A. O.; Snurr, R. Q.; Park, T. H.; Koh, K.; Liu, J.; LeVan, M. D.; Benin, A. I.; Jakubczak, P.; Lanuza, M.; Galloway, D. B.; Low, J. J.; Willis, R. R. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 18198-18199
58. Campana, C.; Mussard, B.; Woo, T. K. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 2866-2878
59. Potoff, J. J.; Siepmann, J. I. AIChE J. 2001, 47, 1676-1682
60. Herm, Z. R.; Krishna, R.; Long, J. R. Microporous Mesoporous Mater. 2012, 151, 481-487
61. Castillo, J. M.; Vlugt, T. J. H.; Calero, S. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 20869-20874
62. Santos, K. A. O.; Dantas Neto, M. C. P. A. A. A.; Moura; Castro Dantas, T. N. Braz. J. Pet. Gas 2011, 5, 255-268
63. Fyfe, C. A.; Gies, H.; Kokotailo, G. T.; Marler, B.; Cox, D. E. J. Phys. Chem. 1990, 94, 3718-3721
64. Jorgensen, W. L.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 16571660
65. Qiao, Z.; Torres-Knoop, A.; Fairen-Jimenez, D.; Dubbeldam, D.; Zhoua, J.; Snurr, R. Q. AIChE 2013, accepted