Hybridization chain reaction amplification of microRNA detection with a tetrahedral DNA nanostructure-based electrochemical biosensor

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 4, 2014, Pages 2124-2130

  Ge, Zhilei ^a   Lin, Meihua ^a   Wang, Ping ^b   Pei, Hao ^a   Yan, Juan ^b   Shi, Jiye ^c   Huang, Qing ^a   He, Dannong ^b   Fan, Chunhai ^a   Zuo, Xiaolei ^a  

^a SHANGHAI INSTITUTE OF APPLIED PHYSICS   (China)

^b SHANGHAI JIAO TONG UNIVERSITY   (China)

^c UCB PHARMA   (Belgium)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; MICRORNA; NANOMATERIAL;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CHEMISTRY; ELECTROCHEMICAL ANALYSIS; GENETIC PROCEDURES; METHODOLOGY; MOLECULAR GENETICS; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; PROTEIN QUATERNARY STRUCTURE; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE;

AMINO ACID SEQUENCE; BIOSENSING TECHNIQUES; DNA; ELECTROCHEMICAL TECHNIQUES; MICRORNAS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NANOSTRUCTURES; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; PROTEIN STRUCTURE, QUATERNARY; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY;

EID: 84894231307     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac4037262     Document Type: Article

References (50)

1. Lu, J.; Getz, G.; Miska, E. A.; Alvarez-Saavedra, E.; Lamb, J.; Peck, D.; Sweet-Cordero, A.; Ebet, B. L.; Mak, R. H.; Ferrando, A. A.; Downing, J. R.; Jacks, T.; Horvitz, H. R.; Golub, T. R. Nature 2005, 435, 834
2. Pritchard, C. C.; Cheng, H. H.; Tewari, M. Nat. Rev. Genet. 2012, 13, 358
3. Bartel, D. P. Cell 2004, 116, 281
4. Lewis, B. P.; Shih, I. H.; Jones-Rhoades, M. W.; Bartel, D. P.; Burge, C. B. Cell 2003, 115, 787
5. Mitchell, P. S.; Parkin, R. K.; Kroh, E. M.; Fritz, B. R.; Wyman, S. K.; Pogosova-Agadjanyan, E. L.; Peterson, A.; Noteboom, J.; O'Briant, K. C.; Allen, A.; Lin, D. W.; Urban, N.; Drescher, C. W.; Knudsen, B. S.; Stirewalt, D. L.; Gentleman, R.; Vessella, R. L.; Nelson, P. S.; Martin, D. B.; Tewari, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 10513
6. Song, M. Y.; Pan, K. F.; Su, H. J.; Zhang, L.; Ma, J. L.; Li, J. Y.; Yuasa, Y.; Kang, D.; Kim, Y. S.; You, W. C. PLoS One 2012, 7 e33608
7. Wen, Y. L.; Pei, H.; Shen, Y.; Xi, J. J.; Lin, M. H.; Lu, N.; Shen, X. Z.; Li, J.; Fan, C. H. Sci. Rep. 2012, 2 867
8. Yang, L.; Liu, C.; Ren, W.; Li, Z. ACS Appl. Mater. Interfaces 2012, 4, 6450
9. Duan, R. X.; Zuo, X. L.; Wang, S. T.; Quan, X. Y.; Chen, D. L.; Chen, Z. F.; Jiang, L.; Fan, C. H.; Xia, F. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 4604
10. Koshiol, J.; Wang, E.; Zhao, Y. D.; Marincola, F.; Landi, M. T. Cancer Epidemiol., Biomarkers Prev. 2010, 19, 907
11. Leshkowitz, D.; Horn-Saban, S.; Parmet, Y.; Feldmesser, E. RNA 2013, 19, 527
12. Harcourt, E. M.; Kool, E. T. Nucleic Acids Res. 2012, 40, e65
13. Pelossof, G.; Tel-Vered, R.; Elbaz, J.; Willner, I. Anal. Chem. 2010, 82, 4396
14. Lu, N.; Pei, H.; Ge, Z. L.; Simmons, C. R.; Yan, H.; Fan, C. H. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 13148
15. Slinker, J. D.; Muren, N. B.; Renfrew, S. E.; Barton, J. K. Nat. Chem. 2011, 3, 228
16. Pei, H.; Lu, N.; Wen, Y. L.; Song, S. P.; Liu, Y.; Yan, H.; Fan, C. H. Adv. Mater. 2010, 22, 4754
17. Wen, Y. L.; Pei, H.; Wan, Y.; Su, Y.; Huang, Q.; Song, S. P.; Fan, C. H. Anal. Chem. 2011, 83, 7418
18. Xia, F.; White, R. J.; Zuo, X. L.; Patterson, A.; Xiao, Y.; Kang, D.; Gong, X.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 14346
19. Liu, G.; Wan, Y.; Gau, V.; Zhang, J.; Wang, L.; Song, S.; Fan, C. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 6820
20. Soleymani, L.; Fang, Z. C.; Lam, B.; Bin, X. M.; Vasilyeva, E.; Ross, A. J.; Sargent, E. H.; Kelley, S. O. ACS Nano 2011, 5, 3360
21. Slinker, J. D.; Muren, N. B.; Gorodetsky, A. A.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 2769
22. Bin, X. M.; Sargent, E. H.; Kelley, S. O. Anal. Chem. 2010, 82, 5928
23. Farjami, E.; Clima, L.; Gothelf, K.; Ferapontova, E. E. Anal. Chem. 2011, 83, 1594
24. Xia, F.; Zuo, X. L.; Yang, R. Q.; Xiao, Y.; Kang, D.; Vallee-Belisle, A.; Gong, X.; Heeger, A. J.; Plaxco, K. W. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1252
25. Ferapontova, E. E.; Gothelf, K. V. Electroanalysis 2009, 21, 1261
26. Xiang, Y.; Lu, Y. Anal. Chem. 2012, 84, 4174
27. Soleymani, L.; Fang, Z. C.; Sargent, E. H.; Kelley, S. O. Nat. Nanotechnol. 2009, 4, 844
28. Pei, H.; Wan, Y.; Li, J.; Hu, H. Y.; Su, Y.; Huang, Q.; Fan, C. H. Chem. Commun. 2011, 47, 6254
29. Ferapontova, E. E.; Olsen, E. M.; Gothelf, K. V. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4256
30. Farjami, E.; Campos, R.; Nielsen, J. S.; Gothelf, K. V.; Kjems, J.; Ferapontova, E. E. Anal. Chem. 2013, 85, 121
31. Liu, X. Q.; Niazov-Elkan, A.; Wang, F. A.; Willner, I. Nano Lett. 2013, 13, 219
32. Wu, J.; Campuzano, S.; Halford, C.; Haake, D. A.; Wang, J. Anal. Chem. 2010, 82, 8830
33. Xiang, Y.; Lu, Y. Nat. Chem. 2011, 3, 697
34. Opdahl, A.; Petrovykh, D. Y.; Kimura-Suda, H.; Tarlov, M. J.; Whitman, L. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 9
35. Fu, J. L.; Liu, M. H.; Liu, Y.; Yan, H. Acc. Chem. Res. 2012, 45, 1215
36. Pinheiro, A. V.; Nangreave, J.; Jiang, S. X.; Yan, H.; Liu, Y. ACS Nano 2012, 6, 5521
37. Jiang, Y. N.; Liu, N. N.; Guo, W.; Xia, F.; Jiang, L. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 15395
38. Liu, N. N.; Jiang, Y. N.; Zhou, Y. H.; Xia, F.; Guo, W.; Jiang, L. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 2007
39. Takeuchi, T.; Matile, S. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 18048
40. Zhu, G. Z.; Zhang, S. F.; Song, E. Q.; Zheng, J.; Hu, R.; Fang, X. H.; Tan, W. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 5490
41. Huang, F. J.; You, M. X.; Han, D.; Xiong, X. L.; Liang, H. J.; Tan, W. H. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 7967
42. Zhang, B.; Liu, B. Q.; Tang, D. P.; Niessner, R.; Chen, G. N.; Knopp, D. Anal. Chem. 2012, 84, 5392
43. Choi, J.; Love, K. R.; Gong, Y.; Gierahn, T. M.; Love, J. C. Anal. Chem. 2011, 83, 6890
44. Chen, Y.; Xu, J.; Su, J.; Xiang, Y.; Yuan, R.; Chai, Y. Anal. Chem. 2012, 84, 7750
45. Choi, H. M. T.; Chang, J. Y.; Trinh, L. A.; Padilla, J. E.; Fraser, S. E.; Pierce, N. A. Nat. Biotechnol. 2010, 28, 1208
46. Huang, J.; Wu, Y. R.; Chen, Y.; Zhu, Z.; Yang, X. H.; Yang, C. J.; Wang, K. M.; Tan, W. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 401
47. Zheng, J.; Zhu, G. Z.; Li, Y. H.; Li, C. M.; You, M. X.; Chen, T.; Song, E. Q.; Yang, R. H.; Tan, W. H. ACS Nano 2013, 7, 6545
48. Dirks, R. M.; Pierce, N. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 15275
49. Lao, R. J.; Song, S. P.; Wu, H. P.; Wang, L. H.; Zhang, Z. Z.; He, L.; Fan, C. H. Anal. Chem. 2005, 77, 6475
50. Zhang, J.; Lao, R. J.; Song, S. P.; Yan, Z. Y.; Fan, C. H. Anal. Chem. 2008, 80, 9029