Single lipid vesicle assay for characterizing single-enzyme kinetics of phospholipid hydrolysis in a complex biological fluid

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 38, 2013, Pages 14151-14158

  Tabaei, Seyed R ^a   Rabe, Michael ^a   Zetterberg, Henrik ^b,c   Zhdanov, Vladimir P ^a,d   Höök, Fredrik ^a  

^a CHALMERS UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Sweden)

^b UNIVERSITY OF GOTHENBURG   (Sweden)

^c UNIVERSITY COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

^d BORESKOV INSTITUTE OF CATALYSIS   (Russian Federation)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALZHEIMER'S DISEASE; BIOLOGICAL FLUIDS; CEREBRO SPINAL FLUIDS; ENSEMBLE AVERAGING; ENZYMATIC ACTIVITIES; ENZYME CONCENTRATIONS; LIMIT OF DETECTION; RELATIVE CONCENTRATION;

ASSAYS; CEREBROSPINAL FLUID; ENZYME ACTIVITY; HYDROLYSIS; PHOSPHOLIPIDS; SENSITIVITY ANALYSIS;

ENZYME KINETICS;

PHOSPHOLIPASE A2; PHOSPHOLIPID; SECRETORY PHOSPHOLIPASE A2;

ALZHEIMER DISEASE; ARTICLE; CEREBROSPINAL FLUID; CONCENTRATION (PARAMETERS); ENZYME ACTIVITY; ENZYME ANALYSIS; ENZYME KINETICS; HYDROLYSIS; LIMIT OF DETECTION; LIPID VESICLE;

ALZHEIMER DISEASE; BIOCATALYSIS; CASE-CONTROL STUDIES; FLUORESCENT DYES; HUMANS; HYDROLYSIS; KINETICS; LIMIT OF DETECTION; MICROSCOPY, FLUORESCENCE; PHOSPHOLIPASES A2, SECRETORY; PHOSPHOLIPIDS;

EID: 84884833348     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja4046313     Document Type: Article

References (47)

1. Ringe, D.; Petsko, G. A. Science 2008, 320, 1428
2. Rotman, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1961, 47, 1981
3. Gorris, H. H.; Walt, D. R. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 3880
4. English, B. P.; Min, W.; van Oijen, A. M.; Lee, K. T.; Luo, G. B.; Sun, H. Y.; Cherayil, B. J.; Kou, S. C.; Xie, X. S. Nat. Chem. Biol. 2006, 2, 87
5. Rissin, D. M.; Kan, C. W.; Campbell, T. G.; Howes, S. C.; Fournier, D. R.; Song, L.; Piech, T.; Patel, P. P.; Chang, L.; Rivnak, A. J.; Ferrell, E. P.; Randall, J. D.; Provuncher, G. K.; Walt, D. R.; Duffy, D. C. Nat. Biotechnol. 2010, 28, 595
6. Li, Z.; Hayman, R. B.; Walt, D. R. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 12622
7. Rocha, S.; Hutchison, J. A.; Peneva, K.; Herrmann, A.; Muellen, K.; Skjot, M.; Jorgensen, C. I.; Svendsen, A.; De Schryver, F. C.; Hofkens, J.; Uji-I, H. ChemPhysChem 2009, 10, 151
8. Gudmand, M.; Rocha, S.; Hatzakis, N. S.; Peneva, K.; Mullen, K.; Stamou, D.; Uji-I, H.; Hofkens, J.; Bjornholm, T.; Heimburg, T. Biophys. J. 2010, 98, 1873
9. Verger, R.; Mieras, M. C. E.; Dehaas, G. H. J. Biol. Chem. 1973, 248, 4023
10. Scott, D. L.; White, S. P.; Otwinowski, Z.; Yuan, W.; Gelb, M. H.; Sigler, P. B. Science 1990, 250, 1541
11. Dennis, E. A.; Cao, J.; Hsu, Y. H.; Magrioti, V.; Kokotos, G. Chem. Rev. 2011, 111, 6130
12. Verheij, H. M.; Slotboom, A. J.; Dehaas, G. H. Rev. Physiol., Biochem. Pharmacol. 1981, 91, 91
13. Balsinde, J.; Balboa, M. A.; Insel, P. A.; Dennis, E. A. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 1999, 39, 175
14. Murakami, M.; Nakatani, Y.; Atsumi, G.; Inoue, K.; Kudo, I. Crit. Rev. Immunol. 1997, 17, 225
15. Harwig, S. S. L.; Tan, L.; Qu, X. D.; Cho, Y.; Eisenhauer, P. B.; Lehrer, R. I. J. Clin. Invest. 1995, 95, 603
16. Nevalainen, T. J.; Graham, G. G.; Scott, K. F. Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Biol. Lipids 2008, 1781, 1
17. Yamashita, S.; Yamashita, J.; Sakamoto, K.; Inada, K.; Nakashima, Y.; Murata, K.; Saishoji, T.; Nomura, K.; Ogawa, M. Cancer 1993, 71, 3058
18. Park, J. B.; Lee, C. S.; Jang, J. H.; Ghim, J.; Kim, Y. J.; You, S.; Hwang, D.; Suh, P. G.; Ryu, S. H. Nat. Rev. Cancer 2012, 12, 782
19. Nevalainen, T. J. Am. J. Surg. 2007, 194, S28
20. Oei, H. H. S.; van der Meer, I. M.; Hofman, A.; Koudstaal, P. J.; Stijnen, T.; Breteler, M. M. B.; Witteman, J. C. M. Circulation 2005, 111, 570
21. Vasan, R. S. Circulation 2006, 113, 2335
22. Sun, G. Y.; Shelat, P. B.; Jensen, M. B.; He, Y.; Sun, A. Y.; Simonyi, A. Neuromol. Med. 2010, 12, 133
23. Gattaz, W. F.; Hubner, C. V.; Nevalainen, T. J.; Thuren, T.; Kinnunen, P. K. J. Biol. Psychiatry 1990, 28, 495
24. Chalbot, S.; Zetterberg, H.; Blennow, K.; Fladby, T.; Grundke-Iqbal, I.; Iqbal, K. Clin. Chem. 2009, 55, 2171
25. Smesny, S.; Stein, S.; Willhardt, I.; Lasch, J.; Sauer, H. J. Neural Transm. 2008, 115, 1173
26. Magrioti, V.; Kokotos, G. Expert Opin. Ther. Pat. 2010, 20, 1
27. Reid, R. C. Curr. Med. Chem. 2005, 12, 3011
28. Sakamoto, K.; Arakawa, H.; Yamashita, S. I.; Mizuta, H.; Takaki, K.; Ogawa, M. Res. Commun. Chem. Pathol. Pharmacol. 1992, 76, 279
29. Eskola, J. U.; Nevalainen, T. J.; Lovgren, T. N. E. Clin. Chem. 1983, 29, 1777
30. Radvanyi, F.; Jordan, L.; Russomarie, F.; Bon, C. Anal. Biochem. 1989, 177, 103
31. Thuren, T.; Virtanen, J. A.; Lalla, M.; Kinnunen, P. K. J. Clin. Chem. 1985, 31, 714
32. Rotticci, D.; Norin, T.; Hult, K.; Martinelle, M. Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Biol. Lipids 2000, 1483, 132
33. Kini, R. M. Toxicon 2003, 42, 827
34. Gregory, A.; Westaway, S. K.; Holm, I. E.; Kotzbauer, P. T.; Hogarth, P.; Sonek, S.; Coryell, J. C.; Nguyen, T. M.; Nardocci, N.; Zorzi, G.; Rodriguez, D.; Desguerre, I.; Bertini, E.; Simonati, A.; Levinson, B.; Dias, C.; Barbot, C.; Carrilho, I.; Santos, M.; Malik, I.; Gitschier, J.; Hayflick, S. J. Neurology 2008, 71, 1402
35. Chalbot, S.; Zetterberg, H.; Blennow, K.; Fladby, T.; Grundke-Iqbal, I.; Iqbal, K. Neurosci. Lett. 2010, 478, 179
36. Mouritsen, O. G.; Andresen, T. L.; Halperin, A.; Hansen, P. L.; Jakobsen, A. F.; Jensen, U. B.; Jensen, M. O.; Jorgensen, K.; Kaasgaard, T.; Leidy, C.; Simonsen, A. C.; Peters, G. H.; Weiss, M. J. Phys.: Condens. Matter 2006, 18, S1293
37. Berg, O. G.; Gelb, M. H.; Tsai, M. D.; Jain, M. K. Chem. Rev. 2001, 101, 2613
38. Zhdanov, V. P.; Hook, F. Biophys. Chem. 2012, 170, 17
39. Aili, D.; Mager, M.; Roche, D.; Stevens, M. M. Nano Lett. 2011, 11, 1401
40. Berg, O. G.; Yu, B. Z.; Rogers, J.; Jain, M. K. Biochemistry 1991, 30, 7283
41. Stahelin, R. V.; Cho, W. H. Biochemistry 2001, 40, 4672
42. Jain, M. K.; Egmond, M. R.; Verheij, H. M.; Apitzcastro, R.; Dijkman, R.; Dehaas, G. H. Biochim. Biophys. Acta 1982, 688, 341
43. Kunding, A. H.; Mortensen, M. W.; Christensen, S. M.; Bhatia, V. K.; Makarov, I.; Metzler, R.; Stamou, D. Biophys. J. 2011, 101, 2693
44. Hatzakis, N. S.; Bhatia, V. K.; Larsen, J.; Madsen, K. L.; Bolinger, P. Y.; Kunding, A. H.; Castillo, J.; Gether, U.; Hedegard, P.; Stamou, D. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 835
45. Duggleby, R. G. Enzyme Kinet. Mech. 1995, D249, 61
46. Nevalainen, T. J.; Kortesuo, P. T.; Rintala, E.; Marki, F. Clin. Chem. 1992, 38, 1824
47. Hansson, O.; Zetterberg, H.; Buchhave, P.; Londos, E.; Blennow, K.; Minthon, L. Lancet Neurol. 2006, 5, 228