Monomer distributions and intrachain collisions of a polymer confined to a channel

Macromolecules

Volumn 46, Issue 16, 2013, Pages 6644-6650

  Werner, E ^a   Westerlund, F ^b   Tegenfeldt, J O ^c   Mehlig, B ^a  

^a UNIVERSITY OF GOTHENBURG   (Sweden)

^b CHALMERS UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Sweden)

^c LUND UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COLLISION PROBABILITY; CROSS-SECTIONAL DISTRIBUTION; DNA CONFORMATIONS; FREELY JOINTED CHAINS; NANOFLUIDIC CHANNEL; SELF-AVOIDANCE; SELF-AVOIDING POLYMERS; SPATIAL POSITIONS;

MEAN FIELD THEORY; MONOMERS; MONTE CARLO METHODS; POLYMERS;

CONFORMATIONS;

EID: 84883235752     PISSN: 00249297     EISSN: 15205835     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ma400464c     Document Type: Article

References (33)

1. Tegenfeldt, J. O.; Prinz, C.; Cao, H.; Chou, S.; Reisner, W. W.; Riehn, R.; Wang, Y. M.; Cox, E. C.; Sturm, J. C.; Silberzan, P.; Austin, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 10979-10983
2. Reisner, W.; Morton, K. J.; Riehn, R.; Wang, Y. M.; Yu, Z. N.; Rosen, M.; Sturm, J. C.; Chou, S. Y.; Frey, E.; Austin, R. H. Phys. Rev. Lett. 2005, 94, 196101
3. Reisner, W.; Larsen, N. B.; Silahtaroglu, A.; Kristensen, A.; Tommerup, N.; Tegenfeldt, J. O.; Flyvbjerg, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010, 107, 13294-13299
4. Nyberg, L. K.; Persson, F.; Berg, J.; Bergström, J.; Fransson, E.; Olsson, L.; Persson, M.; StaÌŠlnacke, A.; Wigenius, J.; Tegenfeldt, J. O.; Westerlund, F. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2012, 417, 404-408
5. Lam, E. T.; Hastie, A.; Lin, C.; Ehrlich, D.; Das, S. K.; Austin, M. D.; Deshpande, P.; Cao, H.; Nagarajan, N.; Xiao, M.; Kwok, P.-Y. Nat. Biotechnol. 2012, 30, 771-776
6. Wang, Y. M.; Tegenfeldt, J. O.; Reisner, W.; Riehn, R.; Guan, X. J.; Guo, L.; Golding, I.; Cox, E. C.; Sturm, J.; Austin, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 9796-9801
7. Riehn, R.; Lu, M. C.; Wang, Y. M.; Lim, S. F.; Cox, E. C.; Austin, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 10012-10016
8. Persson, F.; Fritzsche, J.; Mir, K. U.; Modesti, M.; Westerlund, F.; Tegenfeldt, J. O. Nano Lett. 2012, 12, 2260-2265
9. Reisner, W.; Larsen, N. B.; Flyvbjerg, H.; Tegenfeldt, J. O.; Kristensen, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106, 79-84
10. Reisner, W.; Beech, J. P.; Larsen, N. B.; Flyvbjerg, H.; Kristensen, A.; Tegenfeldt, J. O. Phys. Rev. Lett. 2007, 99, 058302
11. Metzler, R.; Reisner, W.; Riehn, R.; Austin, R.; Tegenfeldt, J. O.; Sokolov, I. M. Europhys. Lett. 2006, 76, 696-702
12. Balducci, A.; Mao, P.; Han, J. Y.; Doyle, P. S. Macromolecules 2006, 39, 6273-6281
13. Zhou, H.-X.; Rivas, G.; Minton, A. P. Annu. Rev. Biophys. 2008, 37, 375-397
14. Marenduzzo, D.; Micheletti, C.; Orlandini, E. J. Phys.: Condens. Matter 2010, 22, 283102
15. Jun, S.; Mulder, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103, 12388-12393
16. Persson, F.; Westerlund, F.; Tegenfeldt, J. O.; Kristensen, A. Small 2009, 5, 190-193
17. Werner, E.; Persson, F.; Westerlund, F.; Tegenfeldt, J. O.; Mehlig, B. Phys. Rev. E 2012, 86, 041802
18. Li, G.-W.; Berg, O. G.; Elf, J. Nat. Phys. 2009, 5, 294-297
19. Bar, M.; Bar-Ziv, R. H. Nano Lett. 2009, 9, 4462-4466
20. McCalla, S. E.; Luryi, A. L.; Tripathi, A. Langmuir 2009, 25, 6168-6175
21. Baumann, C. G.; Bloomfield, V. A.; Smith, S. B.; Bustamante, C.; Wang, M. D.; Block, S. M. Biophys. J. 2000, 78, 1965-1978
22. DiMarzio, E. A. J. Chem. Phys. 1965, 42, 2101-2106
23. Casassa, E. F. J. Polym. Sci., Part B: Polym. Lett. 1967, 5, 773-778
24. Stein, D.; van der Heyden, F. H. J.; Koopmans, W. J. A.; Dekker, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103, 15853-15858
25. Freed, K. F.; Dudowicz, J.; Stukalin, E. B.; Douglas, J. F. J. Chem. Phys. 2010, 133, 094901
26. Ramirez-Hernandez, A.; Detcheverry, F. A.; de Pablo, J. J. J. Chem. Phys. 2010, 133, 064905
27. de Gennes, P. G. Scaling Concepts in Polymer Physics; Cornell University Press: Ithaca, NY, 1979.
28. Rubinstein, M.; Colby, R. H. Polymer Physics; Oxford University Press: New York, 2003.
29. Joanny, J. F.; Leibler, L.; De Gennes, P. G. J. Polym. Sci., Polym. Phys. Ed. 1979, 17, 1073-1084
30. Onsager, L. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1949, 51, 627-659
31. Zhang, C.; Zhang, F.; van Kan, J. A.; van der Maarel, J. R. C. J. Chem. Phys. 2008, 128, 225109
32. Tinland, B.; Pluen, A.; Sturm, J.; Weill, G. Macromolecules 1997, 30, 5763-5765
33. Persson, F.; Bingen, P.; Staudt, T.; Engelhardt, J.; Tegenfeldt, J. O.; Hell, S. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 5581-5583