Phosphorylation-dependent mobility shift of proteins on SDS-PAGE is due to decreased binding of SDS

Bulletin of the Korean Chemical Society

Volumn 34, Issue 7, 2013, Pages 2063-2066

  Lee, Chang Ro ^a,c   Park, Young Ha ^a   Kim, Yeon Ran ^a   Peterkofsky, Alan ^b   Seok, Yeong Jae ^a  

^a Seoul National University   (South Korea)

^b NATIONAL HEART LUNG AND BLOOD INSTITUTE   (United States)

^c Myong Ji University   (South Korea)

Author keywords

Electrophoretic mobility shift; Protein phosphorylation; SDS PAGE; Signal transduction

Indexed keywords

CONSENSUS SEQUENCE; ELECTROPHORETIC MOBILITY SHIFT; MOLECULAR MECHANISM; NEGATIVE CHARGE; NEGATIVELY CHARGED; PHOSPHORYLATION SITES; PROTEIN PHOSPHORYLATION; SDS-PAGE;

AMINO ACIDS; ELECTROPHORETIC MOBILITY; MICROCHANNELS; PHOSPHORYLATION; SIGNAL TRANSDUCTION;

PROTEINS;

EID: 84881400507     PISSN: 02532964     EISSN: 12295949     Source Type: Journal    
DOI: 10.5012/bkcs.2013.34.7.2063     Document Type: Article

References (28)

1. Deutscher, J.; Francke, C.; Postma, P. W. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2006, 70, 939-1031.
2. Koo, B. M.; Yoon, M. J.; Lee, C. R.; Nam, T. W.; Choe, Y. J.; Jaffe, H.; Peterkofsky, A.; Seok, Y. J. J. Biol. Chem. 2004, 279, 31613-31621.
3. Lee, S. J.; Boos, W.; Bouche, J. P.; Plumbridge, J. EMBO J. 2000, 19, 5353-5361.
4. Lux, R.; Jahreis, K.; Bettenbrock, K.; Parkinson, J. S.; Lengeler, J. W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 11583-11587.
5. Nam, T. W.; Cho, S. H.; Shin, D.; Kim, J. H.; Jeong, J. Y.; Lee, J. H.; Roe, J. H.; Peterkofsky, A.; Kang, S. O.; Ryu, S.; Seok, Y. J. EMBO J. 2001, 20, 491-498.
6. Park, Y. H.; Lee, B. R.; Seok, Y. J.; Peterkofsky, A. J. Biol. Chem. 2006, 281, 6448-6454.
7. Seok, Y. J.; Sondej, M.; Badawi, P.; Lewis, M. S.; Briggs, M. C.; Jaffe, H.; Peterkofsky, A. J. Biol. Chem. 1997, 272, 26511-26521.
8. Tanaka, Y.; Kimata, K.; Aiba, H. EMBO J. 2000, 19, 5344-5352.
9. Peterkofsky, A.; Wang, G.; Seok, Y. J. Arch. Biochem. Biophys. 2006, 453, 101-107.
10. Pflüger-Grau, K.; Görke, B. Trends Microbiol. 2010, 18, 205-214.
11. Powell, B. S.; Court, D. L.; Inada, T.; Nakamura, Y.; Michotey, V.; Cui, X.; Reizer, A.; Saier, M. H., Jr.; Reizer, J. J. Biol. Chem. 1995, 270, 4822-4839.
12. Lee, C. R.; Cho, S. H.; Kim, H. J.; Kim, M.; Peterkofsky, A.; Seok, Y. J. Mol. Microbiol. 2010, 78, 1468-1483.
13. Lee, C. R.; Cho, S. H.; Yoon, M. J.; Peterkofsky, A.; Seok, Y. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 4124-4129.
14. Lüttmann, D.; Göpel, Y.; Görke, B. Mol. Microbiol. 2012, 86, 96-110.
15. Lüttmann, D.; Heermann, R.; Zimmer, B.; Hillmann, A.; Rampp, I. S.; Jung, K.; Görke, B. Mol Microbiol 2009, 72, 978-994.
16. Pflüger, K.; de Lorenzo, V. J. Biol. Chem. 2007, 282, 18206-18211.
17. Prell, J.; Mulley, G.; Haufe, F.; White, J. P.; Williams, A.; Karunakaran, R.; Downie, J. A.; Poole, P. S. Mol. Microbiol. 2012, 84, 117-129.
18. Hogema, B. M.; Arents, J. C.; Bader, R.; Eijkemans, K.; Inada, T.; Aiba, H.; Postma, P. W. Mol. Microbiol. 1998, 28, 755-765.
19. Lee, J. W.; Helmann, J. D. J. Biol. Chem. 2006, 281, 23567-23578.
20. Nam, T. W.; Park, Y. H.; Jeong, H. J.; Ryu, S.; Seok, Y. J. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 6712-6722.
21. Lee, C. R.; Koo, B. M.; Cho, S. H.; Kim, Y. J.; Yoon, M. J.; Peterkofsky, A.; Seok, Y. J. Mol. Microbiol. 2005, 58, 334-344.
22. LaVallie, E. R.; DiBlasio, E. A.; Kovacic, S.; Grant, K. L.; Schendel, P. F.; McCoy, J. M. Biotechnology (NY) 1993, 11, 187-193.
23. Reddy, P.; Peterkofsky, A.; McKenney, K. Nucleic Acids Res. 1989, 17, 10473-10488.
24. Rath, A.; Glibowicka, M.; Nadeau, V. G.; Chen, G.; Deber, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 1760-1765.
25. Lee, C. R.; Park, Y. H.; Kim, M.; Kim, Y. R.; Park, S.; Peterkofsky, A.; Seok, Y. J. Mol. Microbiol. 2013, in press.
26. Reynolds, J. A.; Tanford, C. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1970, 66, 1002-1007.
27. Dutta, A.; Kim, T. Y.; Moeller, M.; Wu, J.; Alexiev, U.; Klein-Seetharaman, J. Biochemistry 2010, 49, 6329-6340.
28. Zhou, X. M.; Liu, Y.; Payne, G.; Lutz, R. J.; Chittenden, T. J. Biol. Chem. 2000, 275, 25046-25051.