Herpes virus genome, the pressure is on

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 30, 2013, Pages 11216-11221

  Bauer, David W ^a   Huffman, Jamie B ^b   Homa, Fred L ^b   Evilevitch, Alex ^a,c  

^a CARNEGIE MELLON UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF PITTSBURGH SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

^c LUND UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTIVIRAL THERAPY; DOUBLE STRANDED DNA; EXPERIMENTAL EVIDENCE; HERPES SIMPLEX VIRUS TYPE 1; HYDRATION FORCE; NANO-METER-SCALE; PRESSURE-DRIVEN; VIRAL INFECTIONS;

BACTERIOPHAGES; DNA;

GENES;

DOUBLE STRANDED DNA; VIRUS DNA;

ARTICLE; ATMOSPHERE; HERPES SIMPLEX VIRUS 1; HYDRATION; MOLECULAR EVOLUTION; NONHUMAN; OSMOTIC PRESSURE; STATIC ELECTRICITY; STRESS; VIRUS CAPSID; VIRUS GENOME;

EID: 84881078113     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja404008r     Document Type: Article

References (49)

1. Davison, A. J.; Eberle, R.; Ehlers, B.; Hayward, G. S.; McGeoch, D. J.; Minson, A. C.; Pellett, P. E.; Roizman, B.; Studdert, M. J.; Thiry, E. Arch. Virol. 2009, 154, 171-177
2. Whittaker, G. R.; Kann, M.; Helenius, A. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2000, 16, 627-651
3. Newcomb, W. W.; Juhas, R. M.; Thomsen, D. R.; Homa, F. L.; Burch, A. D.; Weller, S. K.; Brown, J. C. J. Virol. 2001, 75, 10923-10932
4. Grünewald, K.; Desai, P.; Winkler, D. C.; Heymann, J. B.; Belnap, D. M.; Baumeister, W.; Steven, A. C. Science 2003, 302, 1396-1398
5. Sodeik, B.; Ebersold, M. W.; Helenius, A. J. Cell Biol. 1997, 136, 1007-1021
6. Baines, J. D. Trends Microbiol. 2011, 19, 606-613
7. Thomsen, D. R.; Oien, N. L.; Hopkins, T. A.; Knechtel, M. L.; Brideau, R. J.; Wathen, M. W.; Homa, F. L. J. Virol. 2003, 77, 1868-1876
8. Roos, W. H.; Bruinsma, R.; Wuite, G. J. L. Nat. Phys. 2010, 6, 733-743
9. Roos, W. H.; Radtke, K.; Kniesmeijer, E.; Geertsema, H.; Sodeik, B.; Wuite, G. J. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 9673-9678
10. Kol, N.; Shi, Y.; Tsvitov, M.; Barlam, D.; Shneck, R. Z.; Kay, M. S.; Rousso, I. Biophy. J. 2007, 92, 1777-1783
11. Baines, J. D.; Weller, S. K. In Viral Genome Packaging Machines: Genetic, Structure, and Mechanism; Catalano, C. E., Ed; Landes: Georgetown, 2005; pp 135-150.
12. Conway, J. F.; Homa, F. L. In Alphaherpesviruses; Weller, S. K., Ed; Caister: Norwich, 2011; pp 175-193.
13. Kindt, J.; Tzlil, S.; Ben-Shaul, A.; Gelbart, W. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 13671-13674
14. Purohit, P. K.; Kondev, J.; Phillips, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 3173-3178
15. Tzlil, S.; Kindt, J. T.; Gelbart, W. M.; Ben-Shaul, A. Biophys. J. 2003, 84, 1616-1627
16. Rau, D. C.; Lee, B.; Parsegian, V. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1984, 81, 2621-2625
17. Smith, D. E.; Tans, S. J.; Smith, S. B.; Grimes, S.; Anderson, D. L.; Bustamante, C. Nature 2001, 413, 748-752
18. Fuller, D. N.; Raymer, D. M.; Rickgauer, J. P.; Robertson, R. M.; Catalano, C. E.; Anderson, D. L.; Grimes, S.; Smith, D. E. J. Mol. Biol. 2007, 373, 1113-1122
19. Evilevitch, A.; Lavelle, L.; Knobler, C. M.; Raspaud, E.; Gelbart, W. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 9292-9295
20. Jeembaeva, M.; Jönsson, B.; Castelnovo, M.; Evilevitch, A. J. Mol. Biol. 2010, 395, 1079-1087
21. Ivanovska, I.; Wuite, G.; Jönsson, B.; Evilevitch, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 9603-9608
22. Hernando-Pérez, M.; Miranda, R.; Aznar, M.; Carrascosa, J. L.; Schaap, I. A. T.; Reguera, D.; de Pablo, P. J. Small 2012, 8, 2366-2370
23. Parsegian, V. A.; Rand, R. P.; Fuller, N. L.; Rau, D. C. Methods Enzymol. 1986, 127, 400-416
24. Booy, F. P.; Newcomb, W. W.; Trus, B. L.; Brown, J. C.; Baker, T. S.; Steven, A. C. Cell 1991, 64, 1007-1015
25. Zhou, Z. H.; Chen, D. H.; Jakana, J.; Rixon, F. J.; Chiu, W. J. Virol. 1999, 73, 3210-3218
26. Gelbart, W. M.; Knobler, C. M. Science 2009, 323, 1682-1683
27. Liashkovich, I.; Hafezi, W.; Kühn, J. M.; Oberleithner, H.; Shahin, V. J. Mol. Recognit. 2011, 24, 414-421
28. Newcomb, W. W.; Booy, F. P.; Brown, J. C. J. Mol. Biol. 2007, 370, 633-642
29. Newcomb, W. W.; Cockrell, S. K.; Homa, F. L.; Brown, J. C. J. Mol. Biol. 2009, 392, 885-894
30. Grayson, P.; Evilevitch, A.; Inamdar, M.; Purohit, P.; Gelbart, W.; Knobler, C.; Phillips, R. Virology 2006, 348, 430-436
31. Lander, G. C.; Johnson, J. E.; Rau, D. C.; Potter, C. S.; Carragher, B.; Evilevitch, A. Nucleic Acids Res. 2013, 41, 4518-4524
32. Ojala, P. M.; Sodeik, B.; Ebersold, M. W.; Kutay, U.; Helenius, A. Mol. Cell. Biol. 2000, 20, 4922-4931
33. González-Huici, V.; Salas, M.; Hermoso, J. M. Mol. Microbiol. 2004, 52, 529-540
34. São-José, C.; de Frutos, M.; Raspaud, E.; Santos, M. A.; Tavares, P. J. Mol. Biol. 2007, 374, 346-355
35. Molineux, I. J. Virology 2006, 344, 221-229
36. Jeembaeva, M.; Castelnovo, M.; Larsson, F.; Evilevitch, A. J. Mol. Biol. 2008, 381, 310-323
37. Teif, V. B.; Bohinc, K. Prog. Biophys. Mol. Biol. 2011, 105, 208-222
38. Oh, J.; Fraser, N. W. J. Virol. 2008, 82, 3530-3537
39. Leforestier, A.; Brasilès, S.; de Frutos, M.; Raspaud, E.; Letellier, L.; Tavares, P.; Livolant, F. J. Mol. Biol. 2008, 384, 730-739
40. Bhella, D.; Rixon, F. J.; Dargan, D. J. J. Mol. Biol. 2000, 295, 155-161
41. Poranen, M. M.; Pirttimaa, M. J; Bamford, D. H. In Viral Genome Packaging Machines: Genetic, Structure, and Mechanism; Catalano, C. E., Ed; Landes: Georgetown, 2005; pp 117-134.
42. Gouet, P.; Diprose, J. M.; Grimes, J. M.; Malby, R.; Burroughs, J. N.; Zientara, S.; Stuart, D. I.; Mertens, P. P. Cell 1999, 97, 481-490
43. McClain, B.; Settembre, E.; Temple, B. R. S.; Bellamy, A. R.; Harrison, S. C. J. Mol. Biol. 2010, 397, 587-599
44. Prasad, B. V.; Rothnagel, R.; Zeng, C. Q.; Jakana, J.; Lawton, J. A.; Chiu, W.; Estes, M. K. Nature 1996, 382, 471-473
45. Nurmemmedov, E.; Castelnovo, M.; Medina, E.; Catalano, C. E.; Evilevitch, A. J. Mol. Biol. 2012, 415, 263-273
46. Teif, V. B. Biophys. J. 2005, 89, 2574-2587
47. Porschke, D. J. Mol. Biol. 1991, 222, 423-433
48. Burak, Y.; Ariel, G.; Andelman, D. Biophys. J. 2003, 85, 2100-2110
49. Umene, K.; Oohashi, S.; Yoshida, M.; Fukumaki, Y. J. Gen. Virol. 2008, 89, 841-852