A self-calibrating bipartite viscosity sensor for mitochondria

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 24, 2013, Pages 9181-9185

  Yang, Zhigang ^a   He, Yanxia ^a   Lee, Jae Hong ^a   Park, Nayoung ^a   Suh, Myungkoo ^b   Chae, Weon Sik ^c   Cao, Jianfang ^d   Peng, Xiaojun ^d   Jung, Hyosung ^a   Kang, Chulhun ^b   Kim, Jong Seung ^a  

^a Korea University   (South Korea)

^b Kyung Hee University   (South Korea)

^c Korea Basic Science Institute (KBSI)   (South Korea)

^d DALIAN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLUORESCENCE INTENSITY RATIO; FLUORESCENCE LIFETIMES; LINEAR RELATIONSHIPS; LIVING HELA CELLS; MONENSIN; SELF-CALIBRATING; VISCOSITY SENSOR;

FLUORESCENCE; IONOPHORES; SENSORS; VISCOSITY;

MITOCHONDRIA;

COUMARIN; DEOXYRIBODIPYRIMIDINE PHOTOLYASE; IONOPHORE; MONENSIN; NYSTATIN;

ARTICLE; BIPARTITE VISCOSITY SENSOR; CHEMICAL STRUCTURE; FEMALE; FLUORESCENCE; HELA CELL; HUMAN; HUMAN CELL; MITOCHONDRION; SENSOR;

BIOSENSING TECHNIQUES; BORON; COUMARINS; FLUORESCENT DYES; HELA CELLS; HUMANS; MITOCHONDRIA; PORPHOBILINOGEN; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE; VISCOSITY;

EID: 84879358804     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja403851p     Document Type: Article

References (40)

1. Deliconstantinos, G.; Villiotou, V.; Stavrides, J. C. Biochem. Pharmacol. 1995, 49, 1589-1600
2. Nadiv, O.; Shinitzky, M.; Manu, H.; Hecht, D.; Roberts, C. T., Jr.; Leroith, D.; Zick, Y. Biochem. J. 1994, 298, 443-450
3. Zubenko, G. S.; Kopp, U.; Seto, T.; Firestone, L. L. Psychopharmacology (Berlin) 1999, 145, 175-180
4. Shinitzky, M. In: Physiology of membrane fluidity; Shinitzky, M., Ed.; CRC Press: Boca Raton, FL, 1984; pp 1-51.
5. Singer, S. J.; Nicolson, G. L. Science 1972, 175, 720-731
6. Haidekker, M. A.; Brady, T. P.; Lichlyter, D.; Theodorakis, E. A. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 398-399
7. Luby-Phelps, K.; Mujumdar, S.; Mujumdar, R. B.; Ernst, L. A.; Galbraith, W.; Waggoner, A. S. Biophys. J. 1993, 65, 236-242
8. Fischer, D.; Theodorakis, E. A.; Haidekker, M. A. Nat. Protoc. 2007, 2, 227-236
9. Bozdemir, O. A.; Cakmak, Y.; Sozmen, F.; Ozdemir, T.; Siemiarczuk, A.; Akkaya, E. U. Chem.-Eur. J. 2010, 16, 6346-6351
10. Jiao, G.-S.; Thoresen, L. H.; Burgess, K. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 14668-14669
11. Han, J.; Jose, J.; Mei, E.; Burgess, K. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 1684-1687
12. Ueno, Y.; Jose, J.; Loudet, A.; Pérez-Bolívar, C.; Anzenbacher, P., Jr.; Burgess, K. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 51-55
13. Lin, W.; Yuan, L.; Cao, Z.; Feng, Y.; Song, J. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 375-379
14. Jiao, G.-S.; Loudet, A.; Lee, H. B.; Kalinin, S.; Johansson, L. B.-A.; Burgess, K. Tetrahedron 2003, 59, 3109-3116
15. Quade, D. T. M.; Pullen, A. E.; Swager, T. M. Chem. Rev. 2000, 100, 2537-2574
16. Tour, J. M. Chem. Rev. 1996, 96, 537-554
17. Holten, D.; Bocian, D.; Lindsey, J. S. Acc. Chem. Res. 2002, 35, 57-69
18. Kumar, M.; Kumar, N.; Bhalla, V.; Singh, H.; Sharma, P. R.; Kaur, T. Org. Lett. 2011, 13, 1422-1425
19. Bandichhor, R.; Petrescu, A. D.; Vespa, A.; Kier, A. B.; Schroeder, F.; Burgess, K. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 10688-10689
20. Coskun, A.; Akkaya, E. U. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 10464-10465
21. Coskun, A.; Akkaya, E. U. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14474-14475
22. Diring, S.; Puntoriero, F.; Nastasi, F.; Campagna, S.; Ziessel, R. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 6108-6110
23. Haidekker, M. A.; Theodorakis, E. A. Org. Biomol. Chem. 2007, 5, 1669-1678
24. Levitt, J. A.; Chung, P.-H.; Kuimova, M. K.; Yahioglu, G.; Wang, Y.; Qu, J.; Suhling, K. Chem. Phys. Chem. 2011, 12, 662-672
25. Kuimova, M. K. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 12671-12686
26. Zhou, F.; Shao, J.; Yang, Y.; Zhao, J.; Guo, H.; Li, X.; Ji, S.; Zhang, Z. Eur. J. Org. Chem. 2011, 25, 4773-4787
27. Sutharsan, J.; Lichlyter, D.; Wright, N. E.; Dakanali, M.; Haidekker, M. A.; Theodorakis, E. A. Tetrahedron 2010, 66, 2582-2588
28. Liu, F.; Wu, T.; Cao, J.; Cui, S.; Yang, Z.; Qiang, X.; Sun, S.; Song, F.; Fan, J.; Wang, J.; Peng, X. Chem.-Eur. J. 2013, 19, 1548-1553
29. Peng, X.; Yang, Z.; Wang, J.; Fan, J.; He, Y.; Song, F.; Wang, B.; Sun, S.; Qu, J.; Qi, J.; Yan, M. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 6626-6635
30. Kuimova, M. K.; Botchway, S. W.; Parker, A. W.; Balaz, M.; Collins, H. A.; Anderson, H. L.; Suhling, K.; Ogilby, P. R. Nat. Chem. 2009, 1, 69-73
31. Kuimova, M. K.; Yahioglu, G.; Levitt, J. A.; Suhling, K. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 6672-6673
32. Levitt, J. A.; Kuimova, M. K.; Yahioglu, G.; Chung, P.-H.; Suhling, K.; Phillips, D. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 11634-11642
33. Wang, L.; Xiao, Y.; Tian, W.; Deng, L. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 2903-2906
34. Lee, M. H.; Han, J. H.; Lee, J.-H.; Choi, H. G.; Kang, C.; Kim, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 17317-17319
35. Souza, A. C.; Machado, F. S.; Celes, M., R.; Faria, G.; Rocha, L., B.; Silva, J. S.; Rossi, M. A. J. Vet. Med., A 2005, 52, 230-237
36. Soltoff, S. P.; Mandel, L. J. J. Membr. Biol. 1986, 94, 153-161
37. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, J. A., Jr.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.; Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N. J.; Millam, M.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K. V.; Zakrzewski, G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Farkas, O.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J. Gaussian 09, revision A. 02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2009.
38. Hansson, M. J.; Morota, S.; Teilum, M.; Mattiasson, G.; Uchino, H.; Elmér, E. J. Biol. Chem. 2010, 285, 741-750
39. Hurnák, O.; Zachar, J. Gen. Physiol. Biophys. 1995, 14, 359-366
40. Koyama, T.; Zhu, M.-Y.; Araiso, T.; Kinjo, M.; Kitagawa, H.; Sugimura, M. Jpn. J. Physiol. 1990, 40, 65-78