Quantum chemical topology study of the water-platinum(II) interaction

Inorganic Chemistry

Volumn 52, Issue 3, 2013, Pages 1217-1227

  Bergès, Jacqueline ^a,b   Fourré, Isabelle ^a   Pilmé, Julien ^a   Kozelka, Jiri ^c,d  

^a SORBONNE UNIVERSITÉ   (France)

^b UNIVERSITÉ PARIS DESCARTES   (France)

^c UNIVERSITÉ PARIS DESCARTES   (France)

^d MASARYK UNIVERSITY   (Czech Republic)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PLATINUM; WATER;

ARTICLE; CHEMISTRY; QUANTUM THEORY;

PLATINUM; QUANTUM THEORY; WATER;

EID: 84873381510     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic301512c     Document Type: Article

References (59)

1. Elizondo-Riojas, M.-A.; Kozelka, J. J. Mol. Biol. 2001, 314, 1227-1243, and references therein
2. Bhattacharyya, D.; Ramachandran, S.; Sharma, S.; Pathmasiri, W.; King, C. L.; Baskerville-Abraham, I.; Boysen, G.; Swenberg, J. A.; Campbell, S. L.; Dokholyan, N. V.; C. S., G. PLoS One 2011, 6, e23582
3. Carloni, P.; Sprik, M.; Andreoni, W. J. Phys. Chem. 2000, 104, 823-835
4. Truflandier, L. A.; Autschbach, J. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 3472-3483
5. Truflandier, L. A.; Sutter, K.; Autschbach, J. Inorg. Chem. 2011, 50, 1723-1732
6. Kozelka, J.; Bergès, J.; Attias, R.; Fraitag, J. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2000, 39, 198-201
7. Rizzato, S.; Bergès, J.; Mason, S. A.; Albinati, A.; Kozelka, J. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 7440-7443
8. Vidossich, P.; Ortuno, M. A.; Ujaque, G.; Lledos, A. ChemPhysChem 2011, 12, 1666-1668
9. Bergès, J.; Caillet, J.; Langlet, J.; Kozelka, J. Chem. Phys. Lett. 2001, 344, 573-577
10. Kumar, M.; Kozlowski, P. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 123, 8861-8864
11. Kumar, M.; Kumar, N.; Hirao, H.; Kozlowski, P. M. Inorg. Chem. 2012, 51, 5533-5538
12. Kumar, M.; Hirao, H.; Kozlowski, P. M. J. Biol. Inorg. Chem. 2012, 17, 1107-1121
13. Coste, F.; Malinge, J.-M.; Serre, L.; Shepard, W.; Roth, M.; Leng, M.; Zelwer, C. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 1837-1846
14. Fedoce Lopes, J.; Stroele de A. Menezes, V.; Duarte, H. A.; Rocha, W. R.; De Almeida, W. B.; Dos Santos, H. F. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 12047-12054
15. Fu, C.-F.; Tian, S.-X. J. Chem. Phys. 2010, 132, 174507
16. Baidina, I. A.; Podberezskaya, N. V.; Borisov, S. V.; Shestakova, N. A.; Kyklina, U. F.; Mal'chikov, G. D. Zh. Strukt. Khim. 1979, 20, 548-551
17. Baidina, I. A.; Podberezskaya, N. V.; Krylova, L. F.; Borisov, S. V. J. Struct. Chem. 1981, 22, 463-465
18. Beret, E. C.; Martínez, J. M.; Pappalardo, R. R.; Sánchez Marcos, E.; Doltsinis, N. L.; Marx, D. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 2108-2121
19. Beret, E. C.; Pappalardo, R. R.; Doltsinis, N. L.; Marx, D.; Sánchez Marcos, E. ChemPhysChem 2008, 9, 237-240
20. Fedoce Lopes, J.; Da Silva, J. C. S.; Rocha, W. R.; De Almeida, W. B.; Dos Santos, H. F. J. Chem. Theory Comput. 2011, 10, 371-391
21. Vinje, J.; Sletten, E.; Kozelka, J. Chem.-Eur. J. 2005, 11, 3863-3871
22. Burda, J. V.; Zeizinger, M.; Sponer, J.; Leszynski, J. J. Chem. Phys. 2000, 113, 2224-2232
23. Zimmermann, T.; Burda, J. V. Interdiscip. Sci.Comput. Life Sci. 2010, 2, 98-114
24. Pilmé, J.; Piquemal, J.-P. J. Comput. Chem. 2008, 29, 1440-1449
25. Popelier, P. In Structure and Bonding; Wales, D. J., Ed.; Springer-Verlag: Berlin, Germany, 2005; Vol. 115, pp 1-56.
26. Popelier, P. L. A.; Brémond, E. A. G. Int. J. Quantum Chem. 2009, 109, 2542
27. Bader, R. F. W. Atoms in Molecules: A Quantum Theory; Oxford Univ. Press: Oxford, U.K., 1990.
28. Becke, D.; Edgecombe, K. E. J. Chem. Phys. 1990, 92, 5397
29. Feixas, F.; Matito, E.; Duran, M.; Sola, M.; Silvi, B. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 2736-2740
30. Silvi, B.; Savin, A. Nature 1994, 371, 683
31. Silvi, B. J. Mol. Struct. 2002, 614, 3-10
32. Bader, R. F. W.; Larouche, A.; Gatti, C.; Caroll, M. T.; Dougall, P. J.; Wiberg, K. B. J. Chem. Phys. 1987, 87, 1142
33. Boys, S. F.; Bernardi, F. Mol. Phys. 1970, 19, 553-566
34. van Duijneveldt, F. B.; van Duijneveldt-van de Rijdt, J. G. C. M.; van Lenthe, J. H. Chem. Rev. 1994, 94, 1873-1885
35. Andrae, D.; Häussermann, U.; Dolg, M.; Stoll, H.; Preuss, H. Theor. Chim. Acta 1990, 77, 123-141
36. Kozelka, J.; Bergès, J. J. Chim. Phys. 1998, 95, 2226-2240
37. Langlet, J.; Bergès, J.; Caillet, J.; Kozelka, J. Theor. Chem. Acc. 2000, 104, 247-251
38. Chalasinski, G.; Szczesniak, M. M. Chem. Rev. 1994, 94, 1723-1765
39. He, X.; Fusti-Molnar, L.; Cui, G.; Merz, K. M., Jr. J. Phys. Chem. B. 2009, 113, 5290-5300
40. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, Jr., J. A.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision B.02; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2004.
41. Pilmé, J.; Kozlowski, D. J. Comput. Chem. 2011, 32, 3207-3217
42. The TopChem90 package is freely available on: http://www.lct.jussieu.fr/ pagesperso/pilme/topchempage.html.
43. Noury, S.; Krokidis, X.; Fuster, F.; Silvi, B. Comput. Chem. 1999, 23, 597
44. Flukiger, P.; Luthi, H. P.; Portman, S.; Weber, J. Molekel; Swiss Center for Scientific Computing: Manno, Switzerland, 2000-2002.
45. Fedoce Lopes, J.; Rocha, W. R.; Dos Santos, H. F.; De Almeida, W. B. J. Chem. Phys. 2008, 128, 165103
46. Fedoce Lopes, J.; Rocha, W. R.; Dos Santos, H. F.; De Almeida, W. B. J. Braz. Chem.Soc. 2010, 21, 887-96
47. Martín Pendás, A.; Blanco, M. A.; Francisco, E. J. Chem. Phys. 2006, 125, 184112
48. Devereux, M.; Popelier, P. L. A. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 1536-1544
49. Li, Y.; Zhang, G.; Chen, D. Mol. Phys. 2012, 110, 179-184
50. Popelier, P. L. A.; Logothetis, G. J. Organomet. Chem. 1998, 555, 101-111
51. Weinhold, F. In Encyclopedia of Computational Chemistry; Schleyer, P. V. R.; Allinger, N. L.; Gasteiger, T.; Clark, J.; Kollman, P. A.; Schaefer, H. F., III; Schreiner, P. R., Eds.; Wiley: Chichester, U.K., 1998; Vol. 3, p 1792.
52. Koch, U.; Popelier, P. L. A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 9747
53. Popelier, P. L. A. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1873
54. Gálvez, O.; Gómez, P. C.; Pacios, L. F. J. Chem. Phys. 2001, 115, 11166
55. Woodford, J. N. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 8519-8530
56. Pacios, L. F. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 1177-1188
57. Gillespie, R. J. Molecular Geometry; Van Nostrand Reinhold: London, U.K., 1972.
58. Contreras-García, J.; Johnson, E. R.; Keinan, S.; Chaudret, R.; Piquemal, J.-P.; Beratan, D. N.; Yang, W. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 6498-6506
59. Contreras-García, J.; Yang, W. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 12983-12990