Minimum set of mutations needed to optimize cyan fluorescent proteins for live cell imaging

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 2, 2013, Pages 258-267

  Erard, Marie ^a   Fredj, Asma ^a   Pasquier, Hélène ^a   Beltolngar, Dahdjim Benoît ^a   Bousmah, Yasmina ^a   Derrien, Valérie ^a   Vincent, Pierre ^a   Merola, Fabienne ^a  

^a CNRS   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MAMMALIA;

CYAN FLUORESCENT PROTEIN; GREEN FLUORESCENT PROTEIN; RECOMBINANT PROTEIN;

AMINO ACID SUBSTITUTION; ANIMAL; ARTICLE; CELL LINE; CHEMISTRY; CYTOLOGY; DOG; ESCHERICHIA COLI; FLUORESCENCE MICROSCOPY; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; GENETICS; HAMSTER; MDCK CELL; METABOLISM; METHODOLOGY; MOLECULAR IMAGING; MUTATION;

AMINO ACID SUBSTITUTION; ANIMALS; CELL LINE; CRICETINAE; DOGS; ESCHERICHIA COLI; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; GREEN FLUORESCENT PROTEINS; MADIN DARBY CANINE KIDNEY CELLS; MICROSCOPY, FLUORESCENCE; MOLECULAR IMAGING; MUTATION; RECOMBINANT PROTEINS;

EID: 84872054990     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2mb25303h     Document Type: Article

References (42)

1. E. Kiyokawa K. Aoki T. Nakamura M. Matsuda Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2011 51 337 358
2. X. Zhou K. J. Herbst-Robinson J. Zhang Methods Enzymol. 2012 504 317 340
3. P. Vincent N. Gervasi J. Zhang Brain Cell Biol. 2008 36 3 17
4. M. Tramier M. Zahid J. C. Mevel M. J. Masse M. Coppey-Moisan Microsc. Res. Tech. 2006 69 933 939
5. N. C. Shaner M. Z. Lin M. R. McKeown P. A. Steinbach K. L. Hazelwood M. W. Davidson R. Y. Tsien Nat. Methods 2008 5 545 551
6. A. Villoing M. Ridhoir B. Cinquin M. Erard L. Alvarez G. Vallverdu P. Pernot R. Grailhe F. Merola H. Pasquier Biochemistry 2008 47 12483 12492
7. J. W. Borst M. Willemse R. Slijkhuis G. van der Krogt S. P. Laptenok K. Jalink B. Wieringa J. A. Fransen PLoS One 2010 5 e13862
8. J. Goedhart L. van Weeren M. A. Hink N. O. Vischer K. Jalink T. W. Gadella Jr. Nat. Methods 2010 7 137 139
9. M. L. Markwardt G. J. Kremers C. A. Kraft K. Ray P. J. Cranfill K. A. Wilson R. N. Day R. M. Wachter M. W. Davidson M. A. Rizzo PLoS One 2011 6 e17896
10. J. Goedhart D. von Stetten M. Noirclerc-Savoye M. Lelimousin L. Joosen M. A. Hink L. van Weeren T. W. Gadella Jr. A. Royant Nat. Commun. 2012 3 751
11. D. A. Zacharias J. D. Violin A. C. Newton R. Y. Tsien Science 2002 296 913 916
12. D. von Stetten M. Noirclerc-Savoye J. Goedhart T. W. J. Gadella A. Royant Acta Crystallogr., Sect. F: Struct. Biol. Cryst. Commun. 2012 68 878 882
13. A. Espagne M. Erard K. Madiona V. Derrien G. Jonasson B. Levy H. Pasquier R. Melki F. Merola Biochemistry 2011 50 437 439
14. B. P. Cormack R. H. Valdivia S. Falkow Gene 1996 173 33 38
15. G. H. Patterson R. N. Day D. W. Piston J. Cell Sci. 2001 114 837 838
16. G. J. Kremers J. Goedhart D. J. van den Heuvel H. C. Gerritsen T. W. J. Gadella Biochemistry 2007 46 3775 3783
17. G. J. Kremers J. Goedhart E. B. van Munster T. W. J. Gadella Biochemistry 2006 45 6570 6580
18. R. Heim A. B. Cubitt R. Y. Tsien Nature 1995 373 663 664
19. M. A. Rizzo G. H. Springer B. Granada D. W. Piston Nat. Biotechnol. 2004 29 445 449
20. X. Shu K. Kallio X. Shi P. Abbyad P. Kanchanawong W. Childs S. G. Boxer S. J. Remington Biochemistry 2007 46 12005 12013
21. A. Esposito M. Gralle M. A. Dani D. Lange F. S. Wouters Biochemistry 2008 47 13115 13126
22. A. Fredj H. Pasquier I. Demachy G. Jonasson B. Levy V. Derrien Y. Bousmah G. Manoussaris F. Wien J. Ridard M. Erard F. Merola PLoS One 2012 7 e49149
23. J. H. Bae M. Rubini G. Jung G. Wiegand M. H. J. Seifert M. K. Azim J. S. Kim A. Zumbusch T. A. Holak L. Moroder R. Huber N. Budisa J. Mol. Biol. 2003 328 1071 1081
24. M. H. Seifert D. Ksiazek M. K. Azim P. Smialowski N. Budisa T. A. Holak J. Am. Chem. Soc. 2002 124 7932 7942
25. H. C. Chang C. M. Kaiser F. U. Hartl J. M. Barral J. Mol. Biol. 2005 353 397 409
26. D. M. Chudakov M. V. Matz S. Lukyanov K. A. Lukyanov Physiol. Rev. 2010 90 1103 1163
27. K. Jordan J. L. Solan M. Dominguez M. Sia A. Hand P. D. Lampe D. W. Laird Mol. Biol. Cell 1999 10 2033 2050
28. M. D. Resh Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell. Res. 1999 1451 1 16
29. R. Grailhe F. Merola J. Ridard S. Couvignou C. Le Poupon J. P. Changeux H. Laguitton-Pasquier ChemPhysChem 2006 7 1442 1454
30. K. A. Walther B. Papke M. B. Sinn K. Michel A. Kinkhabwala Mol. BioSyst. 2011 7 322 336
31. J. W. Borst M. A. Hink A. van Hoek A. J. W. G. Visser J. Fluoresc. 2005 15 153 160
32. B. Young R. Wightman R. Blanvillain S. B. Purcel P. Gallois Plant Methods 2010 6 27
33. D. Sinnecker P. Voigt N. Hellwig M. Schaefer Biochemistry 2005 44 7085 7094
34. T. A. Dunn C. T. Wang M. A. Colicos M. Zaccolo L. M. DiPilato J. Zhang R. Y. Tsien M. B. Feller J. Neurosci. 2006 26 12807 12815
35. L. R. V. Castro N. Gervasi E. Guiot L. Cavellini V. O. Nikolaev D. Paupardin-Tritsch P. Vincent J. Neurosci. 2010 30 6143 6151
36. F. Cardarelli R. Bizzarri M. Serresi L. Albertazzi F. Beltram J. Biol. Chem. 2009 284 36638 36646
37. G. D. Malo L. J. Pouwels M. Wang A. Weichsel W. R. Montfort M. A. Rizzo D. W. Piston R. M. Wachter Biochemistry 2007 46 9865 9873
38. M. Lelimousin M. Noirclerc-Savoye C. Lazareno-Saez B. Paetzold S. Le Vot R. Chazal P. Macheboeuf M. J. Field D. Bourgeois A. Royant Biochemistry 2009 48 10038 10046
39. G. Vallverdu I. Demachy F. Merola H. Pasquier J. Ridard B. Levy Proteins 2010 78 1040 1054
40. L. Alvarez C. Houee-Levin F. Merola T. Bizouarn H. Pasquier L. Baciou F. Rusconi M. Erard Photochem. Photobiol. 2010 86 55 61
41. T. Nagai K. Ibata E. S. Park M. Kubota K. Mikoshiba A. Miyawaki Nat. Biotechnol. 2002 20 87 90
42. F. Merola R. Rigler A. Holmgren J. C. Brochon Biochemistry 1989 28 3383 3398