Probing electronic coupling between adenine bases in RNA strands from synchrotron radiation circular dichroism experiments

Chemical Communications

Volumn 48, Issue 84, 2012, Pages 10425-10427

  Nielsen, Lisbeth Munksgaard ^a   Hoffmann, Søren Vrønning ^a   Nielsen, Steen Brøndsted ^a  

^a AARHUS UNIVERSITY   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENINE; RNA;

ARTICLE; CIRCULAR DICHROISM; DNA STRAND; ELECTRON; SYNCHROTRON RADIATION;

EID: 84866954051     PISSN: 13597345     EISSN: 1364548X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cc35201j     Document Type: Article

References (39)

1. C. E. Crespo-Hernandez, B. Cohen, P. M. Hare, B. Kohler, Chem. Rev., 2004, 104, 1977
2. C. T. Middleton, K. de La Harpe, C. Su, Y. K. Law, C. E. Crespo-Hernandez, B. Kohler, Annu. Rev. Phys. Chem., 2009, 60, 217
3. D. Markovitsi, T. Gustavsson, A. Banyasz, Mutat. Res., Rev. Mutat. Res., 2010, 704, 21
4. C. E. Crespo-Hernandez, B. Cohen, B. Kohler, Nature, 2005, 436, 1141
5. D. Markovitsi, F. Talbot, T. Gustavsson, D. Onidas, E. Lazzarotto, S. Marguet, Nature, 2006, 441, E7
6. I. Buchvarov, Q. Wang, M. Raytchev, A. Trifonov, T. Fiebig, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2007, 104, 4794
7. I. Vayá, T. Gustavsson, F.-A. Miannay, T. Douki, D. Markovitsi, J. Am. Chem. Soc., 2010, 132, 11834
8. A. W. Lange, J. M. Herbert, J. Am. Chem. Soc., 2009, 131, 3913
9. J. C. Genereux, J. K. Barton, Chem. Rev., 2010, 110, 1642
10. H. W. Fink, C. Schönenberger, Nature, 1999, 398, 407
11. D. Porath, A. Bezryadin, S. de Vries, C. Dekker, Nature, 2000, 403, 635
12. A. Y. Kasumov, M. Kociak, S. Gueron, B. Reulet, V. T. Volkov, D. V. Klinov, H. Bouchiat, Science, 2001, 291, 280
13. W. C. Johnson, Jr., in Methods of Biochemical Analysis, ed. D. Glick, John Wiley & Sons, New York, 1985, vol. 31, p. 61
14. U. Kadhane, A. I. S. Holm, S. V. Hoffmann, S. Brøndsted Nielsen, Phys. Rev. E, 2008, 77, 021901
15. A. I. S. Holm, L. M. Nielsen, S. V. Hoffmann, S. Brøndsted Nielsen, Biopolymers, 2012, 97, 550
16. A. I. S. Holm, L. M. Nielsen, B. Kohler, S. V. Hoffmann, S. Brøndsted Nielsen, Phys. Chem. Chem. Phys., 2010, 12, 3426
17. A. I. S. Holm, L. M. Nielsen, S. V. Hoffmann, S. Brøndsted Nielsen, Phys. Chem. Chem. Phys., 2010, 12, 9581
18. B. Jolles, A. Laigle, L. Chinsky, P. Y. Turpin, Nucleic Acids Res., 1985, 13, 2075
19. T. G. Dewey, D. H. Turner, Biochemistry, 1979, 18, 5757
20. H. Simpkins, E. G. Richards, Biochemistry, 1967, 6, 2513
21. C. S. M. Olsthoorn, L. J. Bostelaar, J. F. M. De Rooij, J. H. Van Boom, C. Altona, Biochemistry, 1981, 115, 309
22. S. B. Zimmerman, D. R. Davies, M. A. Navia, Eur. J. Biochem., 1977, 116, 317
23. W. Saenger, J. Riecke, D. Suck, J. Mol. Biol., 1975, 93, 529
24. B. Dick, ChemPhysChem, 2011, 12, 1578
25. A. J. Miles, S. V. Hoffmann, Y. Tao, R. W. Janes, B. A. Wallace, Spectroscopy (Amsterdam), 2007, 21, 245
26. A. J. Miles, R. W. Janes, A. Brown, D. T. Clarke, J. C. Sutherland, Y. Tao, B. A. Wallace, S. V. Hoffmann, J. Synchrotron. Radiat., 2008, 15, 420
27. http://eu.idtdna.com/analyzer/Applications/OligoAnalyzer
28. C. A. Sprecher, W. C. Johnson, Jr., Biopolymers, 1977, 16, 2243
29. C. L. Cech, W. Hug, I. Tinoco, Jr., Biopolymers, 1976, 15, 131
30. K. E. Van Holde, J. Brahms, A. M. Michelson, J. Mol. Biol., 1965, 12, 726
31. V. P. Antao, D. M. Gray, J. Biomol. Struct. Dyn., 1993, 10, 819
32. W. C. Johnson, Jr., I. Tinoco, Jr., Biopolymers, 1969, 7, 727
33. K. H. Johnson, D. M. Gray, J. C. Sutherland, Nucleic Acids Res., 1991, 19, 2275
34. C. Su, C. T. Middleton, B. Kohler, J. Phys. Chem. B, 2012, 116, 10266
35. D. Poerschke, J. Am. Chem. Soc., 1973, 95, 8440
36. D. Poerschke, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1973, 70, 2683
37. S. Kumar, N. D. Sharma, R. J. H. Davies, D. W. Phillipson, J. A. McCloskey, Nucleic Acids Res., 1987, 15, 1199
38. P. H. Clingen, R. J. H. Davies, J. Photochem. Photobiol., B, 1997, 38, 81
39. Y. Wang, J.-S. Taylor, M. L. Gross, Chem. Res. Toxicol., 2001, 14, 738