Erratum: Identification of c -type Heme-containing peptides using nonactivated immobilized metal affinity chromatography resin enrichment and higher-energy collisional dissociation (Analytical Chemistry (2011) 83 (19) (7260-7268) DOI: 10.1021/ac2000829);Identification of c-type heme-containing peptides using nonactivated immobilized metal affinity chromatography resin enrichment and higher-energy collisional dissociation

Analytical Chemistry

Volumn 83, Issue 19, 2011, Pages 7260-7268

  Zhang, Haizhen ^a   Yang, Feng ^a   Qian, Wei Jun ^a   Brown, Roslyn N ^a   Wang, Yuexi ^a   Merkley, Eric D ^a   Park, Jea H ^a   Monroe, Matthew E ^a   Purvine, Samuel O ^a   Moore, Ronald J ^a   Shi, Liang ^a   Fredrickson, James K ^a   Paša Tolić, Ljiljana ^a   Smith, Richard D ^a   Lipton, Mary S ^a  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AFFINITY CHROMATOGRAPHY; BACTERIA; CELL DEATH; DISSOCIATION; MASS SPECTROMETRY; PEPTIDES; RESINS; SUPPORT VECTOR MACHINES;

BIOLOGICAL SAMPLES; C-TYPE CYTOCHROME; COLLISIONAL DISSOCIATION; ELECTRON TRANSFER; IMMOBILIZED METAL AFFINITY CHROMATOGRAPHY; RESPIRATION ACTIVITY; SHEWANELLA ONEIDENSIS MR-1; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

PORPHYRINS;

CYTOCHROME C; METAL; PEPTIDE FRAGMENT; RESIN;

AFFINITY CHROMATOGRAPHY; ANIMAL; ARTICLE; CATTLE; CHEMISTRY; ENZYMOLOGY; HORSE; LIQUID CHROMATOGRAPHY; METABOLISM; PROTEOMICS; SHEWANELLA; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

ANIMALS; CATTLE; CHROMATOGRAPHY, AFFINITY; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; CYTOCHROME C GROUP; HORSES; METALS; PEPTIDE FRAGMENTS; PROTEOMICS; RESINS, SYNTHETIC; SHEWANELLA; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EID: 84865743590     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac301396b     Document Type: Erratum

References (36)

1. Pettigrew, G. W.; Moore, G. R. Cytochrome c: Biological Aspects; Springer: New York, 1987.
2. Scott, R. A.; Mauk, A. G. Cytochrome c: A Multidisciplinary Approach; University Science Books: Mill Valley, CA, 1995.
3. Einsle, O.; Messerschmidt, A.; Stach, P.; Bourenkov, G. P.; Bartunik, H. D.; Huber, R.; Kroneck, P. M. Nature 1999, 400, 476-480
4. Igarashi, N.; Moriyama, H.; Fujiwara, T.; Fukumori, Y.; Tanaka, N. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 276-284
5. Martinou, J. C.; Desagher, S.; Antonsson, B. Nat. Cell Biol. 2000, 2, E41-43
6. Bowman, S. E.; Bren, K. L. Nat. Prod. Rep. 2008, 25, 1118-1130
7. Page, M. D.; Sambongi, Y.; Ferguson, S. J. Trends Biochem. Sci. 1998, 23, 103-108
8. Thony-Meyer, L. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1997, 61, 337-376
9. Takano, T.; Trus, B. L.; Mandel, N.; Mandel, G.; Kallai, O. B.; Swanson, R.; Dickerson, R. E. J. Biol. Chem. 1977, 252, 776-785
10. Fredrickson, J. K.; Romine, M. F.; Beliaev, A. S.; Auchtung, J. M.; Driscoll, M. E.; Gardner, T. S.; Nealson, K. H.; Osterman, A. L.; Pinchuk, G.; Reed, J. L.; Rodionov, D. A.; Rodrigues, J. L.; Saffarini, D. A.; Serres, M. H.; Spormann, A. M.; Zhulin, I. B.; Tiedje, J. M. Nat. Rev. Microbiol. 2008, 6, 592-603
11. Heidelberg, J. F.; Paulsen, I. T.; Nelson, K. E.; Gaidos, E. J.; Nelson, W. C.; Read, T. D.; Eisen, J. A.; Seshadri, R.; Ward, N.; Methe, B.; Clayton, R. A.; Meyer, T.; Tsapin, A.; Scott, J.; Beanan, M.; Brinkac, L.; Daugherty, S.; DeBoy, R. T.; Dodson, R. J.; Durkin, A. S.; Haft, D. H.; Kolonay, J. F.; Madupu, R.; Peterson, J. D.; Umayam, L. A.; White, O.; Wolf, A. M.; Vamathevan, J.; Weidman, J.; Impraim, M.; Lee, K.; Berry, K.; Lee, C.; Mueller, J.; Khouri, H.; Gill, J.; Utterback, T. R.; McDonald, L. A.; Feldblyum, T. V.; Smith, H. O.; Venter, J. C.; Nealson, K. H.; Fraser, C. M. Nat. Biotechnol. 2002, 20, 1118-1123
12. Heidelberg, J. F.; Seshadri, R.; Haveman, S. A.; Hemme, C. L.; Paulsen, I. T.; Kolonay, J. F.; Eisen, J. A.; Ward, N.; Methe, B.; Brinkac, L. M.; Daugherty, S. C.; Deboy, R. T.; Dodson, R. J.; Durkin, A. S.; Madupu, R.; Nelson, W. C.; Sullivan, S. A.; Fouts, D.; Haft, D. H.; Selengut, J.; Peterson, J. D.; Davidsen, T. M.; Zafar, N.; Zhou, L.; Radune, D.; Dimitrov, G.; Hance, M.; Tran, K.; Khouri, H.; Gill, J.; Utterback, T. R.; Feldblyum, T. V.; Wall, J. D.; Voordouw, G.; Fraser, C. M. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 554-559
13. Methe, B. A.; Nelson, K. E.; Eisen, J. A.; Paulsen, I. T.; Nelson, W.; Heidelberg, J. F.; Wu, D.; Wu, M.; Ward, N.; Beanan, M. J.; Dodson, R. J.; Madupu, R.; Brinkac, L. M.; Daugherty, S. C.; DeBoy, R. T.; Durkin, A. S.; Gwinn, M.; Kolonay, J. F.; Sullivan, S. A.; Haft, D. H.; Selengut, J.; Davidsen, T. M.; Zafar, N.; White, O.; Tran, B.; Romero, C.; Forberger, H. A.; Weidman, J.; Khouri, H.; Feldblyum, T. V.; Utterback, T. R.; Van Aken, S. E.; Lovley, D. R.; Fraser, C. M. Science 2003, 302, 1967-1969
14. Thomas, S. H.; Wagner, R. D.; Arakaki, A. K.; Skolnick, J.; Kirby, J. R.; Shimkets, L. J.; Sanford, R. A.; Loffler, F. E. PLoS ONE 2008, 3, e2103
15. Shi, L.; Richardson, D. J.; Wang, Z.; Kerisit, S. N.; Rosso, K. M.; Zachara, J. M.; Fredrickson, J. K. Environ. Microbiol. Rep. 2009, 1, 220-227
16. Shi, L.; Squier, T. C.; Zachara, J. M.; Fredrickson, J. K. Mol. Microbiol. 2007, 65, 12-20
17. Richardson, D. J. Microbiology 2000, 146 (Pt 3) 551-571
18. Aebersold, R.; Mann, M. Nature 2003, 422, 198-207
19. Qian, W. J.; Camp, D. G., 2nd; Smith, R. D. Expert Rev. Proteomics 2004, 1, 87-95
20. Romine, M. F.; Elias, D. A.; Monroe, M. E.; Auberry, K.; Fang, R.; Fredrickson, J. K.; Anderson, G. A.; Smith, R. D.; Lipton, M. S. OMICS 2004, 8, 239-254
21. Yang, F.; Bogdanov, B.; Strittmatter, E. F.; Vilkov, A. N.; Gritsenko, M.; Shi, L.; Elias, D. A.; Ni, S.; Romine, M.; Pasa-Tolic, L.; Lipton, M. S.; Smith, R. D. J. Proteome Res. 2005, 4, 846-854
22. Yates, J. R., 3rd; Eng, J. K.; McCormack, A. L.; Schieltz, D. Anal. Chem. 1995, 67, 1426-1436
23. Porath, J.; Carlsson, J.; Olsson, I.; Belfrage, G. Nature 1975, 258, 598-599
24. Porath, J.; Olin, B. Biochemistry 1983, 22, 1621-1630
25. Yang, F.; Stenoien, D. L.; Strittmatter, E. F.; Wang, J.; Ding, L.; Lipton, M. S.; Monroe, M. E.; Nicora, C. D.; Gristenko, M. A.; Tang, K.; Fang, R.; Adkins, J. N.; Camp, D. G., 2nd; Chen, D. J.; Smith, R. D. J. Proteome Res. 2006, 5, 1252-1260
26. Ren, D.; Penner, N. A.; Slentz, B. E.; Regnier, F. E. J. Proteome Res. 2004, 3, 37-45
27. Olsen, J. V.; Macek, B.; Lange, O.; Makarov, A.; Horning, S.; Mann, M. Nat. Methods 2007, 4, 709-712
28. Shi, L.; Chen, B.; Wang, Z.; Elias, D. A.; Mayer, M. U.; Gorby, Y. A.; Ni, S.; Lower, B. H.; Kennedy, D. W.; Wunschel, D. S.; Mottaz, H. M.; Marshall, M. J.; Hill, E. A.; Beliaev, A. S.; Zachara, J. M.; Fredrickson, J. K.; Squier, T. C. J. Bacteriol. 2006, 188, 4705-4714
29. Brown, R. N.; Romine, M. F.; Schepmoes, A. A.; Smith, R. D.; Lipton, M. S. J. Proteome Res. 2010, 9, 4454-4463
30. Ross, D. E.; Ruebush, S. S.; Brantley, S. L.; Hartshorne, R. S.; Clarke, T. A.; Richardson, D. J.; Tien, M. Appl. Environ. Microbiol. 2007, 73, 5797-5808
31. Monroe, M. E.; Shaw, J. L.; Daly, D. S.; Adkins, J. N.; Smith, R. D. Comput. Biol. Chem. 2008, 32, 215-217
32. Tolmachev, A. V.; Robinson, E. W.; Wu, S.; Kang, H.; Lourette, N. M.; Pasa-Tolic, L.; Smith, R. D. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2008, 19, 586-597
33. Livesay, E. A.; Tang, K.; Taylor, B. K.; Buschbach, M. A.; Hopkins, D. F.; LaMarche, B. L.; Zhao, R.; Shen, Y.; Orton, D. J.; Moore, R. J.; Kelly, R. T.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2008, 80, 294-302
34. Romine, M. F.; Carlson, T. S.; Norbeck, A. D.; McCue, L. A.; Lipton, M. S. Appl. Environ. Microbiol. 2008, 74, 3257-3265
35. Ren, D.; Penner, N. A.; Slentz, B. E.; Inerowicz, H. D.; Rybalko, M.; Regnier, F. E. J. Chromatogr., A 2004, 1031, 87-92
36. Xiong, Y.; Shi, L.; Chen, B.; Mayer, M. U.; Lower, B. H.; Londer, Y.; Bose, S.; Hochella, M. F.; Fredrickson, J. K.; Squier, T. C. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 13978-13979