Microfluidic digital isoelectric fractionation for rapid multidimensional glycoprotein analysis

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 8, 2012, Pages 3538-3545

  Mai, Junyu ^a   Sommer, Gregory J ^a   Hatch, Anson V ^a  

^a SANDIA NATIONAL LABORATORIES   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANALYTES; AUTOMATED APPROACH; BIOLOGICAL SAMPLES; C-REACTIVE PROTEINS; CANCER MARKERS; DIAGNOSTIC TESTING; FUNCTIONALIZED; GLYCOPROTEIN ANALYSIS; HIGH FIDELITY; HUMAN SERUM; INTEGRATED MICROFLUIDIC DEVICES; ISOELECTRIC; ISOFORMS; MONOLITHIC COLUMNS; MULTIDIMENSIONAL ANALYSIS; ON CHIPS; PROSTATE SPECIFIC ANTIGEN; RUNTIMES; SAMPLE PRECONCENTRATION; SPATIAL ARRANGEMENTS;

BIOMARKERS; GLYCOPROTEINS; PROTEINS; UROLOGY;

FACTOR ANALYSIS;

BIOLOGICAL MARKER; FETUIN; GLYCOPROTEIN; ISOPROTEIN; PROSTATE SPECIFIC ANTIGEN;

ARTICLE; CHEMISTRY; COLORIMETRY; HUMAN; IMMUNOASSAY; ISOELECTRIC FOCUSING; MICROFLUIDICS; TIME;

BIOLOGICAL MARKERS; COLORIMETRY; FETUINS; GLYCOPROTEINS; HUMANS; IMMUNOASSAY; ISOELECTRIC FOCUSING; MICROFLUIDICS; PROSTATE-SPECIFIC ANTIGEN; PROTEIN ISOFORMS; TIME FACTORS;

EID: 84859902923     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac203076p     Document Type: Article

References (50)

1. Kuzmanov, U.; Jiang, N.; Smith, C. R.; Soosaipillai, A.; Diamandis, E. P. Mol. Cell. Proteomics 2009, 8, 791-798
2. Arcinas, A.; Yen, T.-Y.; Kebebew, E.; Macher, B. A. J. Proteome Res. 2009, 8, 3958-3968
3. Drake, P. M.; Cho, W.; Li, B.; Prakobphol, A.; Johansen, E.; Anderson, N. L.; Regnier, F. E.; Gibson, B. W.; Fisher, S. J. Clin. Chem. 2010, 56, 223-236
4. Whelan, S. A.; Lu, M.; He, J.; Yan, W.; Saxton, R. E.; Faull, K. F.; Whitelegge, J. P.; Chang, H. R. J. Proteome Res. 2009, 8, 4151-4160
5. White, K. Y.; Rodemich, L.; Nyalwidhe, J. O.; Comunale, M. A.; Clements, M. A.; Lance, R. S.; Schellhammer, P. F.; Mehta, A. S.; Semmes, O. J.; Drake, R. R. J. Proteome Res. 2009, 8, 620-630
6. Abd Hamid, U. M.; Royle, L.; Saldova, R.; Radcliffe, C. M.; Harvey, D. J.; Storr, S. J.; Pardo, M.; Antrobus, R.; Chapman, C. J.; Zitzmann, N.; Robertson, J. F.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Glycobiology 2008, 18, 1105-1118
7. Gornik, O.; Lauc, G. Disease Markers 2008, 25, 267-278
8. Alavi, A.; Axford, J. S. Disease Markers 2008, 25, 193-205
9. Sato, Y.; Nakata, K.; Kato, Y.; Shima, M.; Ishii, N.; Koji, T.; Taketa, K.; Endo, Y.; Nagataki, S. N. Engl. J. Med. 1993, 328, 1802-1806
10. Debruyne, E. N.; Delanghe, J. R. Clin. Chim. Acta 2008, 395, 19-26
11. Blow, N. Nature 2009, 457, 617-620
12. Marino, K.; Bones, J.; Kattla, J. J.; Rudd, P. M. Nat. Chem. Biol. 2010, 6, 713-723
13. Mao, X.; Luo, Y.; Dai, Z.; Wang, K.; Du, Y.; Lin, B. Anal. Chem. 2004, 76, 6941-6947
14. Nakano, M.; Higo, D.; Arai, E.; Nakagawa, T.; Kakehi, K.; Taniguchi, N.; Kondo, A. Glycobiology 2009, 19, 135-143
15. Madera, M.; Mechref, Y.; Klouckova, I.; Novotny, M. V. J. Chromatogr., B 2007, 845, 121-137
16. Kamoda, S.; Kakehi, K. Electrophoresis 2006, 27, 2495-2504
17. Narimatsu, H.; Sawaki, H.; Kuno, A.; Kaji, H.; Ito, H.; Ikehara, Y. FEBS J. 2010, 277, 95-105
18. Awdeh, Z. L.; Williamson, A. R.; Askonas, B. A. Nature 1968, 219, 66-67
19. Bjellqvist, B.; Ek, K.; Giorgio Righetti, P.; Gianazza, E.; Görg, A.; Westermeier, R.; Postel, W. J. Biochem. Biophys. Methods 1982, 6, 317-339
20. Burditt, L. J.; Johnson, M. M.; Johnson, P. J.; Williams, R. Cancer 1994, 74, 25-29
21. Ho, S.; Cheng, P.; Yuen, J.; Chan, A.; Leung, N.; Yeo, W.; Leung, T.; Lau, W. Y.; Li, A. K.; Johnson, P. J. Br. J. Cancer 1996, 73, 985-988
22. Sarrats, A.; Comet, J.; Tabarés, G.; Ramírez, M.; Aleixandre, R. N.; de Llorens, R.; Peracaula, R. Prostate 2010, 70, 1-9
23. Das, T.; Sen, A. K.; Kempf, T.; Pramanik, S. R.; Mandal, C. Biochem. J. 2003, 373, 345-355
24. Ansar, W.; Mukhopadhyay, S.; Habib, S. K.; Basu, S.; Saha, B.; Sen, A. K.; Mandal, C. N.; Mandal, C. Glycoconjugate J. 2009, 26, 1151-1169
25. Rodriguez-Diaz, R, W. T.; Zhu, M. Electrophoresis 1997, 18, 2134-2144
26. Sommer, G. J.; Hatch, A. V. Electrophoresis 2009, 30, 742-757
27. O'Neill, R. A.; Bhamidipati, A.; Bi, X.; Deb-Basu, D.; Cahill, L.; Ferrante, J.; Gentalen, E.; Glazer, M.; Gossett, J.; Hacker, K.; Kirby, C.; Knittle, J.; Loder, R.; Mastroieni, C.; MacLaren, M.; Mills, T.; Nguyen, U.; Parker, N.; Rice, A.; Roach, D.; Suich, D.; Voehringer, D.; Voss, K.; Yang, J.; Yang, T.; Vander Horn, P. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 16153-16158
28. Fan, A. C.; Deb-Basu, D.; Orban, M. W.; Gotlib, J. R.; Natkunam, Y.; O'Neill, R.; Padua, R.-A.; Xu, L.; Taketa, D.; Shirer, A. E.; Beer, S.; Yee, A. X.; Voehringer, D. W.; Felsher, D. W. Nat. Med. 2009, 15, 566-571
29. Li, Y.; Buch, J. S.; Rosenberger, F.; DeVoe, D. L.; Lee, C. S. Anal. Chem. 2004, 76, 742-748
30. Kim, K. H.; Moon, M. H. Anal. Chem. 2009, 81, 1715-1721
31. Albrecht, J. W.; El-Ali, J.; Jensen, K. F. Anal. Chem. 2007, 79, 9364-9371
32. Wen, J.; Wilker, E. W.; Yaffe, M. B.; Jensen, K. F. Anal. Chem. 2010, 82, 1253-1260
33. Righetti, P. G.; Wenisch, E.; Jungbauer, A.; Katinger, H.; Faupel, M. J. Chromatogr., A 1990, 500, 681-696
34. Zuo, X.; Speicher, D. W. Anal. Biochem. 2000, 284, 266-278
35. Lim, P.; North, R.; Vigh, G. Electrophoresis 2007, 28, 1851-1859
36. Lim, P. J.; Vigh, G. Electrophoresis 2011, 32, 1647-1653
37. Sommer, G. J.; Mai, J.; Singh, A. K.; Hatch, A. V. Anal. Chem. 2011, 83, 3120-3125
38. Zilberstein, G.; Korol, L.; Bukshpan, S.; Baskin, E. Proteomics 2004, 4, 2533-2540
39. Ketteler, M.; Bongartz, P.; Westenfeld, R.; Wildberger, J. E.; Mahnken, A. H.; Böhm, R.; Metzger, T.; Wanner, C.; Jahnen-Dechent, W.; Floege, J. Lancet 2003, 361, 827-833
40. Karamessinis, P. M.; Malamitsi-Puchner, A.; Boutsikou, T.; Makridakis, M.; Vougas, K.; Fountoulakis, M.; Vlahou, A.; Chrousos, G. Mol. Cell. Proteomics 2008, 7, 591-599
41. Partin, A. W.; Yoo, J.; Carter, H. B.; Pearson, J. D.; Chan, D. W.; Epstein, J. I.; Walsh, P. C. J. Urol. 1993, 150, 110-4
42. Peracaula, R.; Tabarés, G.; Royle, L.; Harvey, D. J.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M.; de Llorens, R. Glycobiology 2003, 13, 457-470
43. Huber, P. R.; Schmid, H. P.; Mattarelli, G.; Strittmatter, B.; van Steenbrugge, G. J.; Maurer, A. Prostate 1995, 27, 212-9
44. Sarrats, A.; Saldova, R.; Comet, J.; O'Donoghue, N.; de Llorens, R.; Rudd, P. M.; Peracaula, R. OMICS: J. Integr. Biol. 2010, 14, 465-474
45. Ohyama, C.; Hosono, M.; Nitta, K.; Oh-eda, M.; Yoshikawa, K.; Habuchi, T.; Arai, Y.; Fukuda, M. Glycobiology 2004, 14, 671-679
46. Tabarés, G.; Radcliffe, C. M.; Barrabés, S.; Ramírez, M.; Aleixandre, R. N.; Hoesel, W.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M.; Peracaula, R.; de Llorens, R. Glycobiology 2006, 16, 132-145
47. Saldova, R.; Fan, Y.; Fitzpatrick, J. M.; Watson, R. W. G.; Rudd, P. M. Glycobiology 2011, 21, 195-205
48. Thompson, D.; Pepys, M. B.; Wood, S. P. Structure 1999, 7, 169-177
49. Hatch, A. V.; Herr, A. E.; Throckmorton, D. J.; Brennan, J. S.; Singh, A. K. Anal. Chem. 2006, 78, 4976-4984
50. Bindila, L.; Peter-Katalini?, J. Mass Spectrom. Rev. 2009, 28, 223-253