Understanding the molecular properties of doxorubicin filling inside and wrapping outside single-walled carbon nanotubes

Journal of Computational and Theoretical Nanoscience

Volumn 8, Issue 8, 2011, Pages 1385-1391

  Sornmee, Purinchaya ^a   Rungrotmongkol, Thanyada ^a   Saengsawang, Oraphan ^a   Arsawang, Uthumporn ^a   Remsungnen, Tawun ^b   Hannongbua, Supot ^a  

^a CHULALONGKORN UNIVERSITY   (Thailand)

^b KHON KAEN UNIVERSITY   (Thailand)

Author keywords

Carbon Nanotube; Doxorubicin Anticancer Drug; Drug Delivery System; Molecular Dynamics Simulations

Indexed keywords

ANTICANCER DRUG; CARBON ATOMS; CENTER OF MASS; COLLABORATIVE INTERACTION; CURVATURE EFFECT; DOXORUBICIN; DRUG DELIVERY SYSTEM; FREEFORMS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; MOLECULAR PROPERTIES; STACKING CONFORMATIONS; VOLUME CONSTRAINT; WATER ACCESSIBILITY;

CARBON NANOTUBES; DRUG DELIVERY;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 84856866454     PISSN: 15461955     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1166/jctn.2011.1823     Document Type: Article

References (25)

1. K. K. Jain, Tech. in Cancer Res. 4, 311 (2005).
2. T. Lebold, C. Jung, J. Michaelis, and C. Bräuchle, Nano Lett. 9, 2877 (2009).
3. T. A. Hilder and J. M. Hill, Curr. App. Phys. 8, 258 (2008).
4. M. Foldvari and M. Bagonluri, Nanomedicine 4, 183 (2008).
5. Z. Lui, K. Chen, C. Davis, S. Sherlock, Q. Cao, X. Chen, and H. Dai, Cancer Res. 68, 6652 (2008).
6. G. Speelmans, R. W. H. M. Staffhorst, H. G. Steenbergen, and B. de Kruijff, Biochim. Biophys. Acta. 1284, 240 (1996).
7. K. A. Janes, M. P. Fresneau, A. Marazuela, A. Fabra, and M. J. Alonsao, J. Control Release 73, 255 (2001).
8. T. Pirawattana and T. Srinophakun, Int. J. Mol. Sci. 9, 2290 (2008).
9. L. Brannon-Peppas and J. O. Blanchette, Adv. Drug Deliv. Rev. 56, 1649 (2004).
10. L. Vaccari, D. Canton, N. Zaffaroni, R. Villa, M. Tormen, and E. D. Fabrizio, Microelec. Eng. 83, 1598 (2006).
11. T. Lebold, C. Jung, J. Michaelis, and C. Bräuchle, Nano Lett. 9, 2877 (2009).
12. Z. Liu, X. Sun, N. Nakayama-Ratchford, and H. Dai, Am. Chem. Soc. Nano. 1, 50 (2007).
13. E. Heistera, V. Neves, C. Tïlmaciub, K. Lipert, V. S. Beltrán, H. M. Coley, S. R. P. Silva, and J. McFadden, Carbon 47, 2152 (2009).
14. JCrystalSoft, Nanotube Modeler [online], Available from: http://www.jcrystal.com/products/wincnt (2010).
15. D. S. Wishart, C. Knox, A. C. Guo, D. Cheng, S. Shrivastava, D. Tzur, B. Gautam, and M. Hassanali, Nucleic Acids Res. 36, D901 (2008).
16. D. S. Wishart, C. Knox, A. C. Guo, S. Shrivastava, M. Hassanali, P. Stothard, Z. Chang, and J. Woolsey, Nucleic Acids Res. 34, D668 (2006).
17. D. J. Adams, Curr. Med. Chem. - Anti-Cancer Agents 5, 1 (2005).
18. L. Kleeberger and E. M. Röttinger, Cancer Chemo. Pharm. 33, 144 (1993).
19. J. M. Wang, P. Cieplak, and P. A. Kollman, J. Comp. Chem. 21, 1049 (2000).
20. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P.Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, and J. A. Pople, Gaussian 03, Revision C.02. Gaussian, Inc., Wallingford CT (2004).
21. D. A. Case, T. A. Darden, T. E. Cheatham III, C. L. Simmerling, J. Wang, R. E. Duke, R. Luo, K. M. Merz, D. A. Pearlman, M. Crowley, R. C. Walker, W. Zhang, B. Wang, S. Hayik, A. Roitberg, G. Seabra, K. F. Wong, F. Paesani, X. Wu, S. Brozell, V. Tsui, H. Gohlke, L. Yang, C. Tan, J. Mongan, V. Hornak, G. Cui, P. Beroza, D. H. Mathews, C. Schafmeister, W. S. Ross, and P. A. Kollman, AMBER 10, University of California, San Francisco (2008).
22. J. Wang, R. M. Wolf, J. W. Caldwell, P. A. Kollman, and D. A. Case, J. Comp. Chem. 25, 1157 (2004).
23. E. L. Pollock and J. GLlosli, Comput. Phys. Commun. 81, 93 (1996).
24. J. P. Ryckaert, G. Cicotti, and H. J. C. Berendsen, J. Comput. Phys. 23, 327 (1977).
25. E. Heistera, V. Neves, C. Tïlmaciub, K. Lipert, V. S. Beltrán, H. M. Coley, S. R. P. Silva, and J. McFadden, Carbon 47, 2152 (2009).