Interaction and protection mechanism between li@C60 and nucleic acid bases (NABs): Performance of PM6-DH2 on noncovalent interaction of NABs-Li@C60

Journal of Computational Chemistry

Volumn 33, Issue 5, 2012, Pages 490-501

  Sun, Wenming ^a   Bu, Yuxiang ^a   Wang, Yixuan ^b  

^a SHANDONG UNIVERSITY   (China)

^b ALBANY STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

dispersion corrected DFT; endohedral metallofullerene Li@C60; M06 2x; noncovalent interaction; PM6 DH2

Indexed keywords

DISPERSION-CORRECTED DFT; ENDOHEDRAL METALLOFULLERENES; M06-2X; NON-COVALENT INTERACTION; PM6-DH2;

DISPERSIONS; GASES; MOLECULAR ORBITALS; NUCLEIC ACIDS; RADIATION PROTECTION;

BINDING ENERGY;

DNA; LITHIUM DERIVATIVE; NUCLEIC ACID;

ARTICLE; CHEMISTRY; THERMODYNAMICS;

DNA; LITHIUM COMPOUNDS; NUCLEIC ACIDS; THERMODYNAMICS;

EID: 84856223169     PISSN: 01928651     EISSN: 1096987X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jcc.22881     Document Type: Article

References (42)

1. S. Loft, H. E. Poulsen, J Mol Med 1996, 74, 297.
2. P. Mecocci, G. Fanõ, S. Fulle, U. MacGarvey, L. Shinobu, M. C. Polidori, A. Cherubini, J. Vecchiet, U. Senin, M. F. Beal, Free Radical Bio Med 1999, 26, 303.
3. C. J. Burrows, J. G. Muller, Chem Rev 1998, 98, 1109.
4. W. Sun, Y. Bu, Y. Wang, J Phys Chem C 2011, 115, 3220.
5. M. Yamada, T. Akasaka, S. Nagase, Accounts Chem Res 2009, 43, 92.
6. D. W. Cagle, S. J. Kennel, S. Mirzadeh, J. M. Alford, L. J. P. Wilson, Nat Acad Sci USA 1999, 96, 5182.
7. X.-H. Zeng, Q. Bi, G.-C. Guo, H. E. Ruda, Phys Lett A 2003, 313, 21.
8. I. T. Belash, A. D. Bronnikov, O. V. Zharikov, A. V. Palnichenko, Synth Met 1990, 36, 283.
9. S. Guha, K. Nakamoto, Coordin Chem Rev 2005, 249, 1111.
10. D. S. Bethune, R. D. Johnson, J. R. Salem, M. S. de Vries, C. S. Yannoni, Nature 1993, 366, 123.
11. E. Broclawik, A. Eilmes, J Chem Phys 1998, 108, 3498.
12. C. M. Chang, A. F. J. Jalbout, Comput Theor Nanosci 2009, 6, 1487.
13. B. I. Dunlap, J. L. Ballester, P. P. Schmidt, J Phys Chem 1992, 96, 9781.
14. C. M. Chang, A. F. Jalbout, Thin Solid Films 2010, 518, 2070.
15. A. F. Jalbout, J Organomet Chem 2008, 693, 1143.
16. A. F. Jalbout, J Phys Chem C 2009, 113, 504.
17. M. Zhang, L. B. Harding, S. K. Gray, S. A. Rice, J Phys Chem A 2008, 112, 5478.
18. Y. Zhao, N. E. Schultz, D. G. J. Truhlar, Chem Theory Comput 2006, 2, 364.
19. S. F. Boys, F. Bernardi, Mol Phys 1970, 19, 553.
20. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, A. F. Izmaylov, J. Bloino, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., J. E. Peralta, F. Ogliaro, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, K. N. Kudin, V. N. Staroverov, R. Kobayashi, J. Normand, K. Raghavachari, A. Rendell, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, M. Cossi, N. Rega, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, R. L. Martin, K. Morokuma, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. Dapprich, A. D. Daniels, Ö. Farkas, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, J. Cioslowski, and, D. J. Fox,. Gaussian, Inc., Wallingford CT 2009, Gaussian 09, Revision A.02.
21. V. Barone, M. Cossi, J Phys Chem A 1998, 102, 1995.
22. S. Grimme, J Comput Chem 2004, 25, 1463.
23. S. Grimme, J Comput Chem 2006, 27, 1787.
24. J. P. Perdew, K. Burke, M. Ernzerhof, Phys Rev Lett 1996, 77, 3865.
25. F. Neese, ORCA-an ab initio, density functional and semiempirical program package, Ver. 2.8.0, Max-Planck-Institut fur Bioanorganische Chemie, Mulheim an der Ruhr 2010.
26. J. Rězáč, J. I. Fanfrlík, D. Salahub, P. Hobza, J Chem Theory Comput 2009, 5, 1749.
27. M. Korth, M. Pitoňák, J. Rězáč, P. Hobza, J Chem Theory Comput 2009, 6, 344.
28. K. E. Riley, M. Pitoňák, P. Jurečka, P. Hobza, Chem Rev 2010, 110, 5023.
29. J. J. P. Stewart, MOPAC2009, Stewart Computational Chemistry, Version 11.052W, Available at.
30. A. Klamt, G. J. Schüümann, Chem Soc Perkin Trans 2 1993, 799.
31. E. R. Johnson, S. Keinan, P. Mori-Sánchez, J. Contreras- García, A. J. Cohen, W. Yang, J Am Chem Soc 2010, 132, 6498.
32. T. Lu, Multiwfn: a multifunctional wavefunction analyzer, Version 1.5, Available at, 2010.
33. W. Humphrey, A. Dalke, K. Schulten, J Mol Graph 1996, 14, 33.
34. Z. Slanina, F. Uhlik, S. L. Lee, L. Adamowicz, S. Nagase, Int J Mol Sci 2008, 9, 1841.
35. S. Maheshwari, D. Chakraborty, N. Sathyamurthy, Chem Phys Lett 1999, 315, 181.
36. G. Mpourmpakis, E. Tylianakis, D. Papanikolaou, G. E. J. Froudakis, Nanosci Nanotechnol 2006, 6, 3731.
37. G. Mpourmpakis, G. Froudakis, J Chem Phys 2006, 125, 204707.
38. G. Mpourmpakis, G. Froudakis, A. N. Andriotis, M. Menon, J Phys Chem C 2007, 111, 6593.
39. S. R. Cox, D. E. Williams, J Comput Chem 1981, 2, 304.
40. K. B. Wiberg, P. R. Rablen, J Comput Chem 1993, 14, 1504.
41. Y. Wang, J Phys Chem C 2008, 112, 14297.
42. J. Stewart, J Mol Model 2007, 13, 1173.