Noncovalent interactions in SIESTA using the vdW-DF functional: S22 benchmark and macrocyclic structures

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 8, Issue 1, 2012, Pages 281-289

  Carter, Damien J ^a,b   Rohl, Andrew L ^a,b  

^a CURTIN UNIVERSITY   (Australia)

^b Western Australian Interactive Virtual Environments Centre   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84855715734     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct200679b     Document Type: Article

References (48)

1. Soler, J. M.; Artacho, E.; Gale, J. D.; Garcia, A.; Junquera, J.; Ordejon, P.; Sanchez-Portal, D. J. Phys.: Condens. Matter 2002, 14, 2745-2779
2. Raghavachari, K.; Trucks, G. W.; Pople, J. A.; Head-Gordon, M. Chem. Phy. Lett. 1989, 157, 479-483
3. Grimme, S. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1463-1473
4. Grimme, S. J. Comput. Chem. 2006, 27, 1787-1799
5. Grimme, S.; Antony, J.; Ehrlich, S.; Krieg, H. J. Chem. Phys. 2010, 132, 154104
6. Williams, R. W.; Malhotra, D. Chem. Phys. 2006, 327, 54-62
7. Riley, K. E.; Vondrasek, J.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 5555-5560
8. Civalleri, B.; Zicovich-Wilson, C. M.; Valenzano, L.; Ugliengo, P. CrystEngComm 2008, 10, 405-410
9. Neumann, M. A.; Leusen, F. J. J.; Kendrick, J. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 2427-2430
10. Xu, X.; Goddard, W. A., III. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 2673-2677
11. Chai, J.-D.; Head-Gordon, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 6615-6620
12. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 2006, 120, 215-241
13. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 5656-5667
14. Schwabe, T.; Grimme, S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 3397-3406
15. Zhang, Y.; Xu, X.; Goddard, W. A., III. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 4963-4968
16. Hebelmann, A. J. Chem. Phys. 2009, 130, 084104
17. Becke, A. D.; Johnson, E. R. J. Chem. Phys. 2005, 122, 154104
18. Becke, A. D.; Johnson, E. R. J. Chem. Phys. 2006, 124, 014104
19. Dion, M.; Rydberg, H.; Schroder, E.; Langreth, D. C.; Lundqvist, B. I. Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 246401
20. Lee, K.; Murray, E. D.; Kong, L.; Lundqvist, B. I.; Langreth, D. C. Phys. Rev. B 2010, 82, 081101
21. Vydrov, O. A.; Van Voorhis, T. Phys. Rev. Lett. 2009, 103, 063004
22. Roman-Perez, G.; Soler, J. M. Phys. Rev. Lett. 2009, 103, 096102
23. Kong, L.; Roman-Perez, G.; Soler, J. M.; Langreth, D. C. Phys. Rev. Lett. 2009, 103, 096103
24. Walker, A. M.; Civalleri, B.; Slater, B.; Mellot-Draznieks, C.; Cora, F.; Zicovich-Wilson, C. M.; Roman-Perez, G.; Soler, J. M.; Gale, J. D. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 122, 7663-7665
25. Jurecka, P.; Sponer, J.; Cerny, J.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 1985-1993
26. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865-3868
27. Troullier, N.; Martins, J. L. Phys. Rev. B 1991, 43, 1993-2006
28. Junquera, J.; Paz, O.; Sanchez-Portal, D.; Artacho, E. Phys. Rev. B 2001, 64, 235111
29. Takatani, T.; Hohenstein, E. G.; Malagoli, M.; Marshall, M. S.; Sherrill, C. D. J. Chem. Phys. 2010, 132, 144104
30. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 289-300
31. van Mourik, T.; Karamertzanis, P. G.; Price, S. L. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 8-12
32. Antony, J.; Grimme, S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 5287-5293
33. Schatz, J.; Scholdbach, F.; Lentz, A.; Rastatter, S.; Schilling, J.; Dormann, J.; Ruoff, A.; Debaerdemaeker, T. Z. Naturforsch., B: J. Chem. Sci. 2000, 55, 213-221
34. Arduini, A.; Caciuffo, R.; Geremia, S.; Ferrero, C.; Ugozzoli, F.; Zontone, F. Supramol. Chem. 1998, 10, 125-132
35. Jurecka, P.; Cerny, J.; Hobza, P.; Salahub, D. R. J. Comput. Chem. 2007, 28, 555-569
36. Koch, W.; Holthausen, M. C. A Chemist's Guide to Density Functional Theory, 2 nd ed.; Wiley-VCH Verlag GmbH: Weinheim, Germany, 2001.
37. Carter, D. J.; Rohl, A. L.; Gale, J. D. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 797-800
38. Carter, D. J.; Rohl, A. L. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 1604-1609
39. Kannemann, F. O.; Becke, A. D. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 1081-1088
40. Burns, L. A.; Vazquez-Mayagoitia, A.; Sumpter, B. G.; Sherrill, C. D. J. Chem. Phys. 2011, 134, 084107
41. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 4061-4067
42. Becke, A. D.; Dickson, R. M. J. Chem. Phys. 1998, 89, 2993-2997
43. Gulans, A.; Puska, M. J.; Nieminen, R. M. Phys. Rev. B 2009, 79, 201105
44. Klimes, J.; Bowler, D. R.; Michaelides, A. J. Phys.: Condens. Matter 2010, 22, 022201
45. Schatz, J.; Backes, A. C.; Siehl, H. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 2000, 2, 609-610
46. Ogden, M. I.; Rohl, A. L.; Gale, J. D. Chem. Commun. 2001, 1626-1627
47. Andreeti, G. D.; Ungaro, R.; Pochini, A. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1979, 1005-1007
48. Enright, G. D.; Brouwer, E. B.; Udachin, K. A.; Ratcliffe, C. I.; Ripmeester, J. A. Acta Crystallogr., Sect. B: Struct. Sci. 2002, 58, 1032-1035