Viscous friction of hydrogen-bonded matter

Journal of the American Chemical Society

Volumn 134, Issue 1, 2012, Pages 623-630

  Erbaş, Aykut ^a,c   Horinek, Dominik ^b   Netz, Roland R ^a,c  

^a TECHNICAL UNIVERSITY OF MUNICH   (Germany)

^b UNIVERSITY OF REGENSBURG   (Germany)

^c FREIE UNIVERSITÄT BERLIN   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMISTIC MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; BIOMATTER; COOPERATIVITY; EQUIVALENT RADIUS; FRICTION COEFFICIENTS; FRICTION FORCE; FRICTION LAWS; HYDROXYLATED SUBSTRATES; LOW-VELOCITY; NORMAL FORCES; PEPTIDE CHAIN; PRESENCE OF WATER; SIMPLE STOCHASTIC; SLIDING VELOCITIES; SOLID BODIES; SPECIFIC BINDING; SURFACE POLARITIES; VELOCITY SCALE; VISCOUS FRICTION;

COMPUTER SIMULATION; HYDROGEN BONDS; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR POLARITY; PEPTIDES; PLASTICS FILLERS; SPHERES; STOCHASTIC MODELS; TRIBOLOGY; VELOCITY;

FRICTION;

PEPTIDE; WATER;

ARTICLE; FORCE; FRICTION; HYDROGEN BOND; HYDROXYLATION; MOLECULAR DYNAMICS; SIMULATION; STOCHASTIC MODEL; SURFACE PROPERTY; VELOCITY;

EID: 84855675614     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja209454a     Document Type: Article

References (42)

1. Cordier, P.; Tournilhac, F.; Soulié-Ziakovic, C.; Leibler, L. Nature 2008, 451, 977
2. Sijbesma, R. P.; Beijer, F. H.; Brunsveld, L.; Folmer, B. J. B.; Hirschberg, J. H. K.; Lange, R. F. M.; Lowe, J. K. L.; Meijer, E. W. Science 1997, 278, 1601
3. Kushner, A. M.; Vossler, J. D.; Williams, G. A.; Guan, Z. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 8766
4. Evans, E. Annu. Rev. Biophys. Biomed. 2001, 30, 105
5. Sotomayor, M.; Schulten, K. Science 2007, 316, 1144
6. Keten, S.; Buehler, M. J. Nano Lett. 2008, 8, 743
7. Kappel, C.; Grubmüller, H. Biophys. J. 2104, 100, 1109
8. Seifert, U. Phys. Rev. Lett. 2000, 84, 2750
9. Lapidus, L. J.; Eaton, W. A.; Hofrichter, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 7220
10. Moeglich, A.; Joder, K.; Kiefhaber, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 12394
11. Zwanzig, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 2029
12. Bryngelson, J. D.; Wolynes, P. G. J. Phys. Chem. 1989, 93, 6902
13. Gao, J.; Luedtke, W. D.; Gourdon, D.; Ruths, M.; Israelachvili, J. N.; Landman, U. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 3410-3425
14. Baumberger, T.; Caroli, C. Adv. Phys. 2006, 55, 279
15. Drummond, C.; Israelachvili, J.; Richetti, P. Phys. Rev. E 2003, 67, 066110
16. Maier, B.; Rädler, J. O. Phys. Rev. Lett. 1999, 82, 1911
17. Pastré, D.; Piétrement, O.; Zozime, A.; Cam, E. L. Biopolymers 2004, 77, 53
18. Kühner, F.; Erdmann, M.; Sonnenberg, L.; Serr, A.; Morfill, J.; Gaub, H. E. Langmuir 2006, 22, 11180
19. Kuehner, F.; Morfill, J.; Neher, R. A.; Blank, K.; Gaub, H. E. Biophys. J. 2007, 92, 2491
20. Bormuth, V.; Varga, V.; Howard, J.; Schaffer, E. Science 2009, 325, 870
21. Horinek, D.; Serr, A.; Geisler, M.; Pirzer, T.; Slotta, U.; Lud, S. Q.; Garrido, J. A.; Scheibel, T.; Hugel, T.; Netz, R. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 2842
22. Serr, A.; Horinek, D.; Netz, R. R. J. Am. Chem. Soc. 2008, 134, 235102
23. Wiemers, K.; Kauffman, J. F. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 451
24. Dickrell, P. L.; Pal, S. K.; Bourne, G. R.; Muratore, C.; Voevodin, A. A.; Ajayan, P. M.; Schadler, L. S.; Sawyer, W. G. Tribol. Lett. 2006, 24, 85
25. Chen, J.; Ratera, I.; Park, J. Y.; Salmeron, M. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 236102
26. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306
27. Scott, W. R. P.; Hünenberger, P. H.; Tironi, I. G.; Mark, A. E.; Billeter, S. R.; Fennen, J.; Torda, A. E.; Huber, T.; Krüger, P.; van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 3596
28. Berendsen, H. J. S.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. Intermolecular Forces 1981, 331
29. Feenstra, K. A.; Hess, B.; Berendsen, H. J. S. J. Comput. Chem. 1999, 20, 786
30. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089
31. Luzar, A.; Chandler, D. Nature 1996, 379, 55
32. von Hansen, Y.; Sedlmeier, F.; Hinczewski, M.; Netz, R. R. Phys. Rev. E 2011, 84, 051501
33. Fersht, A. R.; Shi, J. P.; Knill-Jones, J.; Lowe, D. M.; Wilkinson, A. J.; Blow, D. M.; Brick, P.; Carter, P.; Waye, M. M. Y.; Winter, G. Nature 1985, 314, 235
34. Li, Q.; Dong, Y.; Perez, D.; Martini, A.; Carpick, R. W. Phys. Rev. Lett. 2011, 106, 126101
35. Lau, A. W. C.; Prasad, A.; Dogic, Z. EPL (Eur. Phys. Lett.) 2009, 87, 48006
36. Mo, Y.; Turner, K. T.; Szlufarska, I. Nature 2009, 457, 1116
37. Ruckenstein, E.; Tsekov, R. J. Chem. Phys. 1994, 100, 7696
38. Thompson, P. A.; Robbins, M. O. Science 1990, 250, 792
39. Williams, S.; Causgrove, T. P.; Gilmanshin, R.; Fang, K. S.; Callender, R. H.; Woodruff, W. H.; Dyer, R. B. Biochemistry 1996, 35, 691
40. Yang, W. Y.; Gruebele, M. Nature 2003, 423, 193-197
41. Wensley, B. G.; Batey, S.; Bone, F. A. C.; Chan, Z. M.; Tumelty, N. R.; Steward, A.; Kwa, L. G.; Borgia, A.; Clarke, J. Nature 2010, 463, 685
42. Müser, M. H.; Robbins, M. O. Phys. Rev. B 2000, 61, 2335