Domain-specific folding kinetics of staphylococcal nuclease observed through single-molecule FRET in a microfluidic mixer

ChemPhysChem

Volumn 12, Issue 18, 2011, Pages 3515-3518

  Zhi, Zeyong ^a   Liu, Pengcheng ^a,b   Wang, Peng ^a   Huang, Yanyi ^c   Zhao, Xin Sheng ^a  

^a PEKING UNIVERSITY   (China)

^b INSTITUTE OF GEOLOGY AND GEOPHYSICS   (China)

^c PEKING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

FRET; microfluidic mixer; proteins; single molecule studies; SNase

Indexed keywords

ENERGY TRANSFER; FLUIDIC DEVICES; MICROFLUIDICS; MIXERS (MACHINERY); MOLECULES; PROTEINS;

FRET; MICROFLUIDIC MIXERS; MICROFLUIDIC MIXING; SINGLE MOLECULE FLUORESCENCE; SINGLE-MOLECULE FRETS; SINGLE-MOLECULE STUDIES; SNASE; STAPHYLOCOCCAL NUCLEASE;

FORSTER RESONANCE ENERGY TRANSFER;

EID: 83755163116     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.201100652     Document Type: Article

References (28)

1. A. R. Dinner, A. Sali, L. J. Smith, C. M. Dobson, M. Karplus, Trends Biochem. Sci. 2000, 25, 331-339
2. A. I. Bartlett, S. E. Radford, Nat. Struct. Mol. Biol. 2009, 16, 582-588.
3. J. Fitter, Cell. Mol. Life Sci. 2009, 66, 1672-1681.
4. S. E. Radford, C. M. Dobson, P. A. Evans, Nature 1992, 358, 302-307
5. R. L. Baldwin, G. D. Rose, Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 77-83.
6. K. Maki, H. Cheng, D. A. Dolgikh, H. Roder, J. Mol. Biol. 2007, 368, 244-255.
7. B. Schuler, E. A. Lipman, W. A. Eaton, Nature 2002, 419, 743-747
8. A. Hoffmann, A. Kane, D. Nettels, D. E. Hertzog, P. Baumgartel, J. Lengefeld, G. Reichardt, D. A. Horsley, R. Seckler, O. Bakajin, B. Schuler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 105-110
9. S. D. Pugh, C. Gell, D. A. Smith, S. E. Radford, D. J. Brockwell, J. Mol. Biol. 2010, 398, 132-145.
10. J. B. Knight, A. Vishwanath, J. P. Brody, R. H. Austin, Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 3863-3866
11. D. E. Hertzog, B. Ivorra, B. Mohammadi, O. Bakajin, J. G. Santiago, Anal. Chem. 2006, 78, 4299-4306
12. L. J. Lapidus, S. Yao, K. S. McGarrity, D. E. Hertzog, E. Tubman, O. Bakajin, Biophys. J. 2007, 93, 218-224
13. H. Y. Park, S. A. Kim, J. Korlach, E. Rhoades, L. W. Kwok, W. R. Zipfell, M. N. Waxham, W. W. Webb, L. Pollack, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 542-547.
14. E. A. Lipman, B. Schuler, O. Bakajin, W. A. Eaton, Science 2003, 301, 1233-1235.
15. S. H. Pfeil, C. E. Wickersham, A. Hoffmann, E. A. Lipman, Rev. Sci. Instrum. 2009, 80, 055105.
16. Y. Gambin, V. Vandelinder, A. C. Ferreon, E. A. Lemke, A. Groisman, A. A. Deniz, Nat. Methods 2011, 8, 239-241.
17. K. M. Hamadani, S. Weiss, Biophys. J. 2008, 95, 352-365.
18. E. A. Lemke, Y. Gambin, V. Vandelinder, E. M. Brustad, H.-W. Liu, P. G. Schultz, A. Groisman, A. A. Deniz, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 13610-13612.
19. H. Hofmann, F. Hillger, S. H. Pfeil, A. Hoffmann, D. Streich, D. Haenni, D. Nettels, E. A. Lipman, B. Schuler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 11793-11798.
20. W. F. Walkenhorst, S. M. Green, H. Roder, Biochemistry 1997, 36, 5795-5805
21. K. Maki, H. Cheng, D. A. Dolgikh, M. C. R. Shastry, H. Roder, J. Mol. Biol. 2004, 338, 383-400
22. P. C. Liu, X. L. Meng, P. Qu, X. S. Zhao, C. C. Wang, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 12030-12036.
23. Z. Y. Zhi, P. C. Liu, Y. Y. Huang, X. S. Zhao, Acta Phys. Chim. Sin. 2011, 27, 1990-1995.
24. D. Nettels, I. V. Gopich, A. Hoffmann, B. Schuler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 2655-2660.
25. M. Dahan, A. A. Deniz, T. Ha, D. S. Chemla, P. G. Schultz, S. Weiss, Chem. Phys. 1999, 247, 85-106.
26. K. A. Merchant, R. B. Best, J. M. Louis, I. V. Gopich, W. A. Eaton, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 1528-1533.
27. Z. D. Su, M. T. Arooz, H. M. Chen, C. J. Gross, T. Y. Tsong, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 2539-2544.
28. K. Maki, T. Ikura, T. Hayano, N. Takahashi, K. Kuwajima, Biochemistry 1999, 38, 2213-2223.