Pancreatic cancer serum detection using a lectin/glyco-antibody array method

Journal of Proteome Research

Volumn 8, Issue 2, 2009, Pages 483-492

  Li, Chen ^a   Simeone, Diane M ^a   Brenner, Dean E ^a   Anderson, Michelle A ^a   Shedden, Kerby A ^a   Ruffin, Mack T ^a   Lubman, David M ^a  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

Author keywords

Antibody array; Cancer markers; Glycoproteins; Lectins; Pancreatic cancer

Indexed keywords

AGGLUTININ; ALPHA 1 BETA GLYCOPROTEIN; CONCANAVALIN A; GLYCOPROTEIN; LECTIN; PYROXYLIN; UNCLASSIFIED DRUG;

ADULT; AGED; ANTIBODY SPECIFICITY; ARTICLE; BIOTINYLATION; CANCER DIAGNOSIS; CHRONIC PANCREATITIS; CONTROLLED STUDY; DIABETES MELLITUS; DISEASE MARKER; FEMALE; GLYCOSYLATION; HUMAN; MAJOR CLINICAL STUDY; MALE; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; MICROARRAY ANALYSIS; PANCREAS CANCER; PRIORITY JOURNAL; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

ANIMALS; GLYCOPROTEINS; GLYCOSYLATION; HUMANS; LECTINS; MICROARRAY ANALYSIS; PANCREATIC NEOPLASMS; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; ROC CURVE; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION; TUMOR MARKERS, BIOLOGICAL;

ALEURIA; LENS CULINARIS; MAACKIA AMURENSIS; SAMBUCUS NIGRA;

EID: 61849093752     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr8007013     Document Type: Article

References (48)

1. Jemal, A.; Siegel, R.; Ward, E.; Murray, T.; et al. Ca-Cancer J. Clin. 2006, 56, 106-130.
2. Mann, D. V.; Edwards, R.; Ho, S.; Lau, W. Y.; Glazer, G. Eur. J. Surg. Oncol 2000, 26, 474-179.
3. Ferrone, C. R.; Finkelstein, D. M.; Thayer, S. P.; Muzikansky, A.; Femandez-del Castillo, G; Warshaw, A. L. J. Clin. Oncol. 2006, 24, 2897-2902.
4. Duffy, M. J. Ann. Clin. Biochem. 1998, 35 (Pt 3), 364-370.
5. Boeck, S.; Stieber, P.; Holdenrieder, S.; Wilkowski, R.; Heinemann, V. Oncology 2006, 70, 255-264.
6. Dalgleish, A. G. Br. Med. J. 2000, 321, 380.
7. Chang, C. Y.; Huang, S. P.; Chiu, H. M.; Lee, Y. C.; Chen, M. F.; Lin, J. T. Hepatogastroenterology 2006, 53, 1-4.
8. Kim, J. E.; Lee, K. T.; Lee, J. K.; Paik, S. W.; Rhee, J. C.; Choi, K.W. J. Gastroenterol. Hepatol. 2004, 19, 182-186.
9. Riker, A.; Libutti, S. K.; Bartlett, D. L. Surg. Oncol. 1998, 6, 157-69.
10. Wigmore, S. J.; Fearon, K. C.; Sangster, K.; Maingay, J. P.; Garden, O. J.; Ross, J. A. Int. J. Oncol. 2002, 21, 881-886.
11. Fearon, K. C.; Barber, M. D.; Falconer, J. S.; McMillan, D. C.; Ross, J. A.; Preston, T. World J. Surg. 1999, 23, 584-588.
12. Dube, D. H.; Bertozzi, C. R. Nat. Rev. Drug Discovery 2005, 4, 477-488.
13. Garcea, G.; Neal, C. P.; Pattenden, C. J.; Steward, W. P.; Berry, D. P. Eur. J. Cancer 2005, 41, 2213-2236.
14. Rustgi, A. K. Gastroenterology 2005, 129, 1344-1347.
15. VanMeter, A.; Signore, M.; Pierobon, M.; Espina, V.; Liotta, L. A.; Petricoin, E. F. Expert Rev. Mol. Diag. 2007, 5, 625-633.
16. An, H. J.; Peavy, T. R.; Hedrick, J. L.; Lebrilla, C. B. Anal. Chem. 2003, 75, 5628-5637.
17. Block, T. M.; Comunale, M. A.; Lowman, M.; Steel, L. F.; Romano, P. R.; Fimmel, C.; Tennant, B. C.; London, W. T.; Evans, A. A.; Blumberg, B. S.; Dwek, R. A.; Manu, T. S.; Mehta, A. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 2005, 102, 779-784.
18. Ressom, H. W.; Varghese, R. S.; Goldman, L.; An, Y.; Loffredo, C. A.; Kyselova; Mechref, Y.; Novotny, M.; Drake, S. K.; Goldman, R. J. Proteome Res. 2008, 7, 603-610.
19. Gessner, P.; Riedl, S.; Quentmaier, A.; Kemmner, W. Cancer Lett. 1993, 75, 143-149.
20. Gorelik, E.; Galili, U.; Raz, A. Cancer Metastasis Rev. 2001, 20, 245-277.
21. Morelle, W.; Michalski, J. C. Curr. Pharm. Des. 2005, 11, 2615- 2645.
22. Peracaula, R.; Tabares, G.; Royle, L.; Harvey, D. J.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M.; de Llorens, R. Glycobiology 2003, 13, 457-470.
23. Poland, D. C.; Kratz, E.; Vermeiden, J. P.; De Groot, S. M.; Bruyneel, B.; De Vries, T.; Van Dijk, W. Prostate 2002, 52, 34-42.
24. Marrero, J. A.; Romano, P. R.; Nikolaeva, O.; Steel, L.; Mehta, A.; Fimmel, C. J.; Comunale, M. A.; D'Amelio, A.; Lok, A. S.; Block, T. M. J. Hepatology 2005, 43, 1007-1012.
25. Ahmed, N.; Oliva, K. T.; Barker, G.; Hoffmann, P.; Reeve, S.; Smith, I. A.; Quinn, M. A.; Rice, G. E. Proteomics 2005, 5, 4625-4636.
26. Bertozzi, C. R.; Kiessling, L. L. Science 2001, 291, 2357-2364.
27. Okuyama, N.; Ide, Y.; Nakano, M.; Nakagawa, T.; Yamanaka, K.; Moriwaki, K.; Murata, K.; Ohigashi, H.; Yokoyama, S.; Eguchi, H.; Ishikawa, O.; Ito, T.; Kato, M.; Kasahara, A.; Kawano, S.; Gu, J. G.; Miyoshi, E. Int. J. Cancer 2006, 118, 2803-2808.
28. Lacunza, I.; Kremmer, T.; Diez-Masa, J. C.; Sanz, J.; de Frutos, M. Eletrophoresis 2007, 23, 4447-4451.
29. Yang, Z. P.; Hancock, W. S. J. Chromatograhpy., A 2004, 1-2, 79-88.
30. Drake, R. R.; Schwegler, E. E.; Malik, G.; Diaz, J.; Block, T.; Mehta, A.; Semmes, O. J. Mol. Cell. Proteomics 2006, 10, 1957-1967.
31. Cho, W.; Jung, K.; Regnier, F. E. Anal. Chem. 2008, 14, 5286-5292.
32. Kyselova, Z.; Mechref, Y.; Kang, P.; Goetz, J. A.; Dobrolecki, L. E.; Sledge, G. W.; Schnaper, L.; Hickey, R. J.; Malkas, L. H.; Novotny, M. V. Clin. Chem. 2008, 7, 1166-1175.
33. Zhao, J.; Simeone, D. M.; Heidt, D.; Anderson, M. A.; Lubman, D. M. J. Proteome Res. 2006, 7, 1792-1802.
34. Zhao, J.; Qiu, W. L.; Simeone, D. M.; Lubman, D. M. J. Proteome Res. 2007, 3, 1126-1138.
35. Zhang, H.; Li, X. J.; Martin, D. B.; Aebersold, R. Nat. Biotechnol. 2003, 6, 660-666.
36. Zhao, J.; Patwa, T. H.; Qiu, W. L.; Shedden, K.; Hinderer, R.; Misek, D. E.; Anderson, M. A.; Simeone, D. M.; Lubman, D. M. J. Proteome Res. 2007, 5, 1864-1874.
37. Qiu, Y.; Patwa, T.H.; L.; Xu, L.; Shedden, K.; Misek, D. E.; Tuck, M.; Jin, G.; Ruffin, M. T.; Turgeon, D. K.; Synal, S.; Bresalier, R.; Marcon, N.; Brenner, D. E.; Lubman, D. M. J. Proteome Res. 2008, 7 (4), 1693-1703.
38. Alvarez, R. A.; Blixt, O. Glycobiology 2006, 415, 292-310.
39. Kuno, A.; Uchiyama, N.; Koseki-Kuno, S.; Ebe, Y.; Takashima, S.; Yamada, M.; Hirabayashi, J. Nat. Methods 2005, 11, 851-856.
40. Chen, P.; Liu, Y,K.; Kang, X. N.; Sun, L.; Yang, P. Y.; Tang, Z. Y. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2008, 8, 851-860.
41. Chen, S. M.; LaRoche, T.; Hamelinck, D.; Bergsma, D.; Brenner, D.; Simeone, D.; Brand, R. E.; Haab, B. B. Nat. Methods 2007, 5, 437-444.
42. Ingvarsson, J.; Wingren, C.; Carlsson, A.; Ellmark, P.; Wahren, B.; Engstrom, G.; Harmenberg, U.; Krogh, M.; Peterson, C.; Borrebaeck, C. A. K. Proteomics 2008, 11, 2211-2219.
43. Haab, B. B. Curr. Opin. Biotechnol. 2006, 4, 415-421.
44. Orchekowski, R.; Hamelinck, D.; Li, L.; Gliwa, E.; VanBrocklin, M.; Marrero, J. A.; Woude, G. F. V.; Feng, Z. D.; Brand, R.; Haab, B. B. Cancer Res. 2005, 23, 11193-11202.
45. Kreunin, P.; Zhao, J.; Rosser, C.; Urquidi, V.; Lubman, D. M.; Goodison, S. J. Proteome Res. 2007, 7, 2631-2639.
46. Liang, X. L.; Lubman, D. M.; Rossi, D. T.; Nordblom, G. D.; Barksdale, C. M. Anal. Chem. 1998, 3, 498-503.
47. Ransohoff, D. F. Nat. Rev. Cancer 2005, 5, 142-149.
48. Evans-Nguyen, K. M.; Tao, S. C.; Zhu, H.; Cotter, R. J. Anal. Chem. 2008, 5, 1448-1458.