New family of biuret hydrolases involved in s -triazine ring metabolism

ACS Catalysis

Volumn 1, Issue 9, 2011, Pages 1075-1082

  Cameron, Stephan M ^a   Durchschein, Katharina ^a,b   Richman, Jack E ^a   Sadowsky, Michael J ^a   Wackett, Lawrence P ^a  

^a UNIVERSITY OF MINNESOTA   (United States)

^b UNIVERSITY OF GRAZ   (Austria)

Author keywords

13C NMR; allophanate; biuret; biuret hydrolase; carboxybiuret; enzyme; kinetics

Indexed keywords

13C NMR; ALLOPHANATE; BIURET; BIURET HYDROLASE; CARBOXYBIURET;

AMINO ACIDS; BIOINFORMATICS; CARBOXYLATION; ESCHERICHIA COLI; GENES; METABOLISM; PHYSIOLOGY;

HYDROLASES;

EID: 80052483198     PISSN: 21555435     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cs200295n     Document Type: Article

References (39)

1. Hatfield, S. Masters thesis, Texas A & M University, College Station, Texas, U.S.A., 2007.
2. Smolin, E. M.; Rapoport, L. s-Triazines and Derivatives. In The Chemistry of Heterocyclic Compounds Series 13; Weissberger, A., Ed.; Interscience Publishers, Inc.: New York, NY, 1959.
3. Behki, R. M.; Khan, S. U. J. Agric. Food. Chem. 1986, 34, 746-749
4. Mandelbaum, R. T.; Allan, D. L.; Wackett, L. P. Appl. Environ. Microbiol. 1995, 61, 1451-1457
5. Strong, L. C.; Pedersen (Rosendahl), C.; Johnson, G.; Sadowsky, M. J.; Wackett, L. P. Appl. Environ. Microbiol. 2002, 68, 5973-5980
6. Aislabie, J.; Bej, A. K.; Ryburn, J.; Lloyd, N.; Wilkins, A. FEMS Microbiol. Ecol. 2005, 52, 279-286
7. Topp, E.; Mulbry, W. M.; Zhu, H.; Nour, S. M.; Cuppels, D. Appl. Environ. Microbiol. 2000, 66, 3134-3141
8. Cheng, G.; Shapir, N.; Sadowsky, M. J.; Wackett, L. P. Appl. Environ. Microbiol. 2005, 71, 4437-4445
9. Nishihara, H.; Shoji, K.; Hori, M. Biken J. 1965, 8, 23-34
10. Jutzi, K.; Cook, A. M.; Hütter, R. Biochem. J. 1982, 208, 679-684
11. Cook, A. M.; Beilstein, P.; Grossenbacher, H.; Hütter, R. Biochem. J. 1985, 231, 25-30
12. Martinez, B.; Tomkins, J.; Wackett, L. P.; Wing, R.; Sadowsky, M. J. J. Bacteriol. 2001, 183, 5684-5697
13. Bjellqvist, B.; Hughes, G. J.; Pasquali, C.; Paquet, N.; Ravier, F.; Sanchez, J. C.; Frutiger, S.; Hochstrasser, D. F. Electrophoresis 1993, 14, 1023-1031
14. Marchler-Bauer, A.; Lu, S.; Anderson, J. B.; Chitsaz, F.; Derbyshire, M. K.; DeWeese-Scott, C.; Fong, J. H.; Geer, L. Y.; Geer, R. C.; Gonzales, N. R.; Gwadz, M.; Hurwitz, D. I.; Jackson, J. D.; Ke, Z.; Lanczycki, C. J.; Lu, F.; Marchler, G. H.; Mullokandov, M.; Omelchenko, M. V.; Robertson, C. L.; Song, J. S.; Thanki, N.; Yamashita, R. A.; Zhang, D.; Zhang, N.; Zheng, C.; Bryant, S. H. Nucleic Acids Res. 2011, 39, D225-229
15. Gonnet, G. H.; Cohen, M. A.; Benner, S. A. Science 1992, 256, 1443-1445
16. French, J. B.; Cen, Y.; Sauve, A. A.; Ealick, S. E. Biochemistry 2010, 49, 8803-8812
17. Luo, H. B.; Zheng, H.; Zimmerman, M. D.; Chruszcz, M.; Skarina, T.; Egorova, O.; Savchenko, A.; Edwards, A. M.; Minor, W. J. Struct. Biol. 2010, 169, 304-311
18. Du, X.; Wang, W.; Kim, R.; Yakota, H.; Nguyen, H.; Kim, S. H. Biochemistry 2001, 40, 14166-14172
19. Shapir, N.; Sadowsky, M. J.; Wackett, L. P. J. Bacteriol. 2005, 187, 3731-3738
20. Mani, F.; Peruzzini, M.; Stoppioni, P. Green Chem. 2006, 8, 995-1000
21. Stamper, D. M.; Krzycki, J. A.; Nicomrat, D.; Traina, S. A.; Tuovinen, O. H. Biocatal. Biotransform. 2005, 23, 387-396
22. Fruchey, I.; Shapir, N.; Sadowsky, M. J.; Wackett, L. P. Appl. Environ. Microbiol. 2003, 69, 3653-3657
23. Li, Q.; Seffernick, J. L.; Sadowsky, M. J.; Wackett, L. P. Appl. Environ. Microbiol. 2009, 75, 6986-6991
24. Booth, I. R. The Regulation of Intracellular pH in Bacteria. In Proceedings of the Novartis Foundation Symposium 221: Bacterial Responses to pH, Novartis Foundation Symposium, Basel, Switzerland, December 8, 1999; Chadwick, D. J.; Cardew, G., Eds.; John Wiley & Sons, Ltd.: Chichester, U.K., 2007.
25. Chen, H.; Richardson, A. E.; Rolfe, B. G. Appl. Environ. Microbiol. 1993, 59, 1798-1804
26. Mowafak, M.; Sabbagh, A.; Calmon, M.; Calmon, J. P. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1984, 1233-1238
27. Kim, K. S.; Pelton, J. G.; Inwood, W. B.; Andersen, U.; Kustu, S.; Wemmer, D. E. J. Bacteriol. 2010, 192, 4089-4102
28. Blocki, F. A.; Logan, M. S.; Baoli, C.; Wackett, L. P. J. Biol. Chem. 1994, 269, 8826-8830
29. Stourman, N. V.; Rose, J. H.; Vuilleumier, S.; Armstrong, R. N. Biochemistry. 2003, 42, 11048-11056
30. Whitney, P. A.; Cooper, T. G. J. Biol. Chem. 1972, 247, 1349-1353
31. Altschul, S. F.; Madden, T. L.; Schäffer, A. A.; Zhang, J.; Zhang, Z.; Miller, W.; Lipman, D. J. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 3389-3402
32. Jain, E.; Bairoch, A.; Duvaud, S.; Phan, I.; Redaschi, N.; Suzek, B. E.; Martin, M. J.; McGarvey, P.; Gasteiger, E. BMC Bioinf. 2009, 10, 136
33. Hunter, S.; Apweiler, R.; Attwood, T. K.; Bairoch, A.; Bateman, A.; Binns, D.; Bork, P.; Das, U.; Daugherty, L.; Duquenne, L.; Finn, R. D.; Gough, J.; Haft, D.; Hulo, N.; Kahn, D.; Kelly, E.; Laugraud, A.; Letunic, I.; Lonsdale, D.; Lopez, R.; Madera, M.; Maslen, J.; McAnulla, C.; McDowall, J.; Mistry, J.; Mitchell, A.; Mulder, N.; Natale, D.; Orengo, C.; Quinn, A. F.; Selengut, J. D.; Sigrist, C. J.; Thimma, M.; Thomas, P. D.; Valentin, F.; Wilson, D.; Wu, C. H.; Yeats, C. Nucleic Acids Res. 2009, 37, D224-228
34. Quevillon, E.; Silventoinen, V.; Pillai, S.; Harte, N.; Mulder, N.; Apweiler, R.; Lopez, R. Nucleic Acids Res. 2005, 33, W116-W120
35. Larkin, M. A.; Blackshields, G.; Brown, N. P.; Chenna, R.; McGettigan, P. A.; McWilliam, H.; Valentin, F.; Wallace, I. M.; Wilm, A.; Lopez, R.; Thompson, J. D.; Gibson, T. J.; Higgins, D. G. Bioinformatics 2007, 23, 2947-2948
36. Larsen, I. K. Acta Chem. Scand. A. 1977, 31B, 251-255
37. Exner, O. Collect. Czech. Chem. Commun. 1961, 26, 701-709
38. Weatherburn, M. W. Anal. Chem. 1967, 39, 971-974
39. Patton, C. J.; Crouch, S. R. Anal. Chem. 1977, 49, 464-469