Why BLUF photoreceptors with roseoflavin cofactors lose their biological functionality

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 32, 2011, Pages 14775-14783

  Merz, Thomas ^a   Sadeghian, Keyarash ^a   Schütz, Martin ^a  

^a UNIVERSITY OF REGENSBURG   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLAVINE ADENINE NUCLEOTIDE; FLAVOPROTEIN; WATER;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; LIGHT; METABOLISM; QUANTUM THEORY;

FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE; FLAVOPROTEINS; LIGHT; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR STRUCTURE; QUANTUM THEORY; WATER;

EID: 80051696074     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1cp21386e     Document Type: Article

References (55)

1. J. M. Christie W. R. Briggs J. Biol. Chem. 2001 276 11457 11460
2. M. A. van der Horst K. J. Hellingwerf Acc. Chem. Res. 2004 37 13 20
3. W. D. Hoff K. H. Jung J. L. Spudlich Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1997 26 223
4. P. H. Quail Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. B 1998 353 1399
5. R. Kort W. D. Hoff M. van West A. R. Kroon S. M. Hoffer K. H. Vlieg W. Crielaand J. J. V. Beeumen K. J. Hellingwerf EMBO J. 1996 15 3209
6. E. Huala P. W. Oeller E. Liscum I. S. Han E. Larsen W. R. Briggs Science 1997 278 2120
7. T. E. Swartz S. B. Corchnoy J. M. Christie J. W. Lewis I. Szundi W. R. Briggs R. A. Bogomolni J. Biol. Chem. 2001 276 36493
8. M. Ahmad A. R. Cashmore Nature 1993 366 162 166
9. M. Gomelsky G. Klug Trends Biochem. Sci. 2002 27 497 500
10. S. Masuda C. Bauer Cell (Cambridge, Mass.) 2002 110 613
11. W. Laan M. van der Horst I. van Stokkum K. Hellingwerf Photochem. Photobiol. 2003 78 290
12. V. Dragnea M. Waegele S. Balascuta C. Bauer B. Dragnea Biochemistry 2005 44 15978
13. S. Masuda Y. Tomida H. Ohta K.-I. Takamiya J. Mol. Biol. 2007 368 1223
14. P. Zirak A. Penzkofer T. Schiereis P. Hegemann A. Jung I. Schlichting Chem. Phys. 2005 315 142
15. M. Gauden I. H. M. van Stokkum J. M. Key D. C. Lührs R. van Grondelle P. Hegemann J. T. M. Kennis Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 10895
16. A. Jung J. Reinstein T. Domratcheva R. L. Shoeman I. Schlichting J. Mol. Biol. 2006 362 717
17. P. Zirak A. Penzkofer T. Schiereis P. Hegemann A. Jung I. Schlichting J. Photochem. Photobiol., B 2006 83 180
18. A. Jung T. Domratcheva M. Tarutina Q. Wu W.-H. Ko R. Shoeman M. Gomelsky K. H. Gardner I. Schlichting Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 12350
19. K. Hasegawa S. Masuda T.-A. Ono Biochemistry 2004 43 14979
20. S. Masuda K. Hasegawa A. Ishii T.-A. Ono Biochemistry 2004 43 5304
21. K. Hasegawa S. Masuda T.-A. Ono Plant Cell Physiol. 2005 46 136
22. P. Zirak A. Penzkofer C. Lehmpfuhl T. Mathes P. Hegemann J. Photochem. Photobiol., B 2007 86 22
23. H. Yuan S. Anderson S. Masuda V. Dragnea K. Moffat C. Bauer Biochemistry 2006 45 12687
24. Y. Fukushima K. Okajima Y. Shibata M. Ikeuchi S. Itoh Biochemistry 2005 44 5149
25. K. Okajima Y. Fukushima H. Suzuki A. Kita Y. Ochiai M. Katayama Y. Shibata K. Miki T. Noguchi S. Itoh M. Ikeuchi J. Mol. Biol. 2006 363 10
26. A. Kita K. Okajima Y. Morioto M. Ikeuchi K. Miki J. Mol. Biol. 2005 349 1
27. W. Laan M. Gauden S. Yeremenko R. van Grondelle J. T. M. Kennis K. J. Hellingwerf Biochemistry 2006 45 51 60
28. M. Gauden I. H. M. van Stokkum J. M. Key D. C. Luhrs R. van Grondelle P. Hegemann J. T. M. Kennis Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 10895 10900
29. M. Gauden J. S. Grinstead W. Laan I. H. M. van Stokkum M. Avila-Perez K. C. Toh R. Boelens R. Kaptein R. van Grondelle K. J. Hellingwerf J. T. M. Kennis Biochemistry 2007 46 7405
30. A. L. Stelling K. L. Ronayne J. Nappa P. J. Tonge S. R. Meech J. Am. Chem. Soc. 2007 129 15556 15564
31. T. Domratcheva B. L. Grigorenko I. Schlichting A. V. Nemukhin Biophys. J. 2008 94 3872 3879
32. J. Götze P. Saalfrank J. Photochem. Photobiol., B 2009 94 87 95
33. K. Sadeghian M. Bocola M. Schütz J. Am. Chem. Soc. 2008 130 12501
34. K. Sadeghian M. Bocola M. Schütz Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 8840 8846
35. A. Udvarhelyi T. Domratcheva Photochem. Photobiol. 2010 87 554 563
36. T. Mathes C. Vogl J. Stolz P. Hegemann J. Mol. Biol. 2009 385 1511 1518
37. P. Zirak A. Penzkofer T. Mathes P. Hegemann J. Photochem. Photobiol., B 2009 97 61
38. P. Zirak A. Penzkofer T. Mathes P. Hegeman Chem. Phys. 2009 358 111
39. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 1372 1377
40. O. Christiansen H. Koch P. Jørgensen Chem. Phys. Lett. 1995 243 409 418
41. C. Hättig F. Weigend J. Chem. Phys. 2000 113 5154 5161
42. B. R. Brooks R. E. Bruccoleri B. D. Olafson D. J. States S. Swaminathan M. Karplus J. Comput. Chem. 1983 4 187
43. A. D. MacKerell D. Bashford M. Bellott R. L. Dunbrack J. D. Evanseck M. J. Field S. Fischer J. Gao H. Guo S. Ha D. Joseph-McCarthy L. Kuchnir K. Kuczera F. T. K. Lau C. Mattos S. Michnick T. Ngo D. T. Nguyen B. Prodhom W. E. Reiher B. Roux M. Schlenkrich J. C. Smith R. Stote J. Straub M. Watanabe J. Wiorkiewicz-Kuczera D. Yin M. Karplus J. Phys. Chem. B 1998 102 3586 3616
44. N. Foloppe A. D. MacKerell J. Comput. Chem. 2000 21 86
45. P. Sherwood A. H. de Vries M. F. Guest G. Schreckenbach C. R. A. Catlow S. A. French A. A. Sokol S. T. Bromley W. Thiel A. J. Turner S. Billeter F. Terstegen S. Thiel J. Kendrick S. C. Rogers J. Casci M. Watson F. King E. Karlsen M. Sjøvoll A. Fahmi A. Schäfer C. Lennartz THEOCHEM 2003 1 632
46. W. Smith C. W. Yong P. M. Rodger Mol. Simul. 2002 28 385 471
47. S. R. Billeter A. J. Turner W. Thiel Phys. Chem. Chem. Phys. 2000 2 2177 2186
48. R. Ahlrichs M. Bär M. Häser H. Horn C. Kölmel Chem. Phys. Lett. 1989 162 165
49. A. D. Becke Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1988 38 3098 3100
50. A. Schäfer H. Horn R. Ahlrichs J. Chem. Phys. 1992 97 2571
51. D. E. Woon T. H. Dunning, Jr. J. Chem. Phys. 1993 98 1358 1371
52. A. Schäfer C. Huber R. Ahlrichs J. Chem. Phys. 1994 100 5829
53. A. Dreuw J. L. Weisman M. Head-Gordon J. Chem. Phys. 2003 119 2943
54. T. Yoshihara S. Druzhinin K. Zachariasse J. Am. Chem. Soc. 2004 126 8535
55. Z. R. Grabowski K. Rotkiewicz W. Rettig Chem. Rev. 2003 103 3899