Purification, crystallization and preliminary X-ray structure analysis of the laccase from Ganoderma lucidum

Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications

Volumn 67, Issue 8, 2011, Pages 926-929

  Lyashenko, Andrey V ^a   Belova, Oksana ^b   Gabdulkhakov, Azat G ^a   Lashkov, Alexander A ^a   Lisov, Alexandr V ^b   Leontievsky, Alexey A ^b   Mikhailov, Albert M ^a  

^a SHUBNIKOV INSTITUTE OF CRYSTALLOGRAPHY   (Russian Federation)

^b SKRYABIN INSTITUTE OF BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY OF MICROORGANISMS   (Russian Federation)

Author keywords

Ganoderma lucidum; laccases; white rot fungi

Indexed keywords

LACCASE;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CRYSTALLIZATION; ENZYMOLOGY; GANODERMA LUCIDUM; ISOLATION AND PURIFICATION; PROTEIN TERTIARY STRUCTURE; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

CRYSTALLIZATION; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; LACCASE; MODELS, MOLECULAR; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; REISHI;

BASIDIOMYCOTA; FUNGI; GANODERMA LUCIDUM;

EID: 80051540104     PISSN: None     EISSN: 17443091     Source Type: Journal    
DOI: 10.1107/S1744309111021129     Document Type: Article

References (42)

1. Abadulla, E., Tzanov, T., Costa, S., Robra, K. H., Cavaco-Paulo, A. & Gübitz, G. M. (2000). Appl. Environ. Microbiol. 66, 3357-3362.
2. Asada, N., Namba, M., Kodama, T. & Kyogoku, Y. (2004). Arch. Insect Biochem. Physiol. 56, 1-6.
3. Baldrian, P. (2006). FEMS Microbiol. Rev. 30, 215-242.
4. Bertrand, T., Jolivalt, C., Briozzo, P., Caminade, E., Joly, N., Madzak, C. & Mougin, C. (2002). Biochemistry, 41, 7325-7333.
5. Bourbonnais, R. & Paice, M. G. (1990). FEBS Lett. 267, 99-102.
6. Camarero, S., Cañas, A. I., Nousiainen, P., Record, E., Lomascolo, A., Martínez, M. J. & Martínez, A. T. (2008). Environ. Sci. Technol. 42, 6703-6709.
7. Camarero, S., García, O., Vidal, T., Colom, J., Del Río, J. C., Gutiérrez, A., Gras, J. M., Monje, R., Martínez, M. J. & Martínez, A. T. (2004). Enzyme Microb. Technol. 35, 113-120.
8. Claus, H. (2003). Arch. Microbiol. 179, 145-150.
9. DeLano, W. L. (2002). PyMOL. http://www.pymol.org.
10. Ducros, V., Brzozowski, A. M., Wilson, K. S., Østergaard, P., Schneider, P., Svendson, A. & Davies, G. J. (2001). Acta Cryst. D57, 333-336.
11. Emsley, P. & Cowtan, K. (2004). Acta Cryst. D60, 2126-2132.
12. Enguita, F. J., Martins, L. O., Henriques, A. O. & Carrondo, M. A. (2003). J. Biol. Chem. 278, 19416-19425.
13. Farver, O. & Pecht, I. (2007). Prog. Inorg. Chem. 55, 2-72.
14. Ferraroni, M., Duchi, I., Myasoedova, N. M., Leontievsky, A. A., Golovleva, L. A., Scozzafava, A. & Briganti, F. (2005). Acta Cryst. F61, 205-207.
15. Garavaglia, S., Cambria, M. T., Miglio, M., Ragusa, S., Iacobazzi, V., Palmieri, F., D'Ambrosio, C., Scaloni, A. & Rizzi, M. (2004). J. Mol. Biol. 342, 1519-1531.
16. Gianfreda, L. & Rao, M. A. (2004). Enzyme Microb. Technol. 35, 339-354.
17. González, A. K., Arévalob, M. C. & Falcóna, M. A. (2009). Electrochim. Acta, 54, 2621-2629.
18. Joo, S. S., Ryu, I. W., Park, J.-K., Yoo, Y. M., Lee, D.-H., Hwang, K. W., Choi, H.-T., Lim, C.-J., Lee, I. D. & Kim, K. (2008). Mol. Cells, 25, 112-118.
19. Kabsch, W. (2010). Acta Cryst. D66, 125-132.
20. Kirk, T. K., Schultz, E., Connors, W. J., Lorenz, L. F. & Zeikus, J. G. (1978). Arch. Microbiol. 177, 277-285.
21. Ko, E.-M., Leem, Y.-E. & Choi, H. T. (2001). Appl. Microbiol. Biotechnol. 57, 98-102.
22. Komori, H., Miyazaki, K. & Higuchi, Y. (2009). Acta Cryst. F65, 264-266.
23. Li, K., Xu, F. & Eriksson, K. E. (1999). Appl. Environ. Microbiol. 65, 2654-2660.
24. Lin, Z. B. & Zhang, H. N. (2004). Acta Pharmacol. Sin. 25, 1387-1395.
25. Lisov, A. V., Zavarzina, A. G., Zavarzin, A. A. & Leontievsky, A. A. (2007). FEMS Lett. 275, 46-52.
26. Lyashenko, A. V., Bento, I. et al. (2006). J. Biol. Inorg. Chem. 11, 963-973.
27. Lyashenko, A. V., Zhukhlistova, N. E. et al. (2006). Acta Cryst. F62, 954-957.
28. Lyashenko, A. V., Zhukova, Y. N., Zhukhlistova, N. E., Zaitsev, V. N., Stepanova, E. V., Kachalova, G. S., Koroleva, O. V., Voelter, W., Betzel, C., Tishkov, V. I., Bento, I., Gabdoulkhakov, A. G., Morgunova, E. Y., Lindley, P. F. & Mikhailov, A. M. (2006). Crystallogr. Rep. 51, 817-823.
29. Matthews, B. W. (1968). J. Mol. Biol. 33, 491-497.
30. McCoy, A. J. (2007). Acta Cryst. D63, 32-41.
31. Morozova, O. V., Shumakovich, G. P., Gorbacheva, M. A., Shleev, S. V. & Yaropolov, A. I. (2007). Biochemistry, 72, 1136-1150.
32. Murshudov, G. N., Skubák, P., Lebedev, A. A., Pannu, N. S., Steiner, R. A., Nicholls, R. A., Winn, M. D., Long, F. & Vagin, A. A. (2011). Acta Cryst. D67, 355-367.
33. Ng, T. B. & Wang, H. X. (2004). Biochem. Biophys. Res. Commun. 313, 37-41.
34. Piontek, K., Antorini, M. & Choinowski, T. (2002). J. Biol. Chem. 277, 37663-37669.
35. Polyakov, K.M., Fedorova, T. V., Stepanova, E. V., Cherkashin, E. A., Kurzeev, S. A., Strokopytov, B. V., Lamzin, V. S. & Koroleva, O. V. (2009). Acta Cryst. D65, 611-617.
36. Sakurai, T. & Kataoka, K. (2007). Chem. Rec. 7, 220-229.
37. Skálová, T., Dohnálek, J., Østergaard, L. H., Østergaard, P. R., Kolenko, P., Dušková, J. & Hašek, J. (2007). Acta Cryst. F63, 1077-1079.
38. Solomon, E. I., Sundaram, U. M. & Machonkin, T. E. (1996). Chem. Rev. 96, 2563-2606.
39. Thurston, C. F. (1994). Microbiology, 140, 19-26.
40. Xu, F. (1996). Biochemistry, 35, 7608-7614.
41. Yaver, D. S., Xu, F., Golightly, E. J., Brown, K. M., Brown, S. H., Rey, M. W., Schneider, P., Halkier, T., Mondorf, K. & Dalboge, H. (1996). Appl. Environ. Microbiol. 62, 834-841.
42. Zavarzina, A. G., Leontievsky, A. A., Golovleva, L. A. & Trofimov, S. Y. (2004). Soil Biol. Biochem. 36, 359-369.