Protein phosphorylation analysis in archival clinical cancer samples by shotgun and targeted proteomics approaches

Molecular BioSystems

Volumn 7, Issue 8, 2011, Pages 2368-2374

  Gámez Pozo, Angelo ^a   Sánchez Navarro, Iker ^a   Calvo, Enrique ^b   Díaz, Esther ^a   Miguel Martín, María ^a   López, Rocío ^a   Agulló, Teresa ^c   Camafeita, Emilio ^b   Espinosa, Enrique ^d   López, Juan Antonio ^b   Nistal, Manuel ^d   Vara, Juan Ángel Fresno ^a  

^a INSTITUTO DE INVESTIGACIÓN SANITARIA DEL HOSPITAL CLÍNICO SAN CARLOS IDISSC   (Spain)

^b CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CARDIOVASCULARES CNIC   (Spain)

^c HOSPITAL UNIVERSITARIO 12 DE OCTUBRE   (Spain)

^d HOSPITAL UNIVERSITARIO LA PAZ   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PHOSPHOPROTEIN; TUMOR PROTEIN;

AFFINITY CHROMATOGRAPHY; AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CHEMISTRY; COMPARATIVE STUDY; CYTOCHEMISTRY; HUMAN; METABOLISM; METHODOLOGY; MOLECULAR GENETICS; NEOPLASM; PEPTIDE MAPPING; POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS; PROTEOMICS; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

AMINO ACID SEQUENCE; CHROMATOGRAPHY, AFFINITY; ELECTROPHORESIS, POLYACRYLAMIDE GEL; HISTOCYTOCHEMISTRY; HUMANS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NEOPLASM PROTEINS; NEOPLASMS; PEPTIDE MAPPING; PHOSPHOPROTEINS; PROTEOMICS; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EUKARYOTA;

EID: 79960350722     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1mb05113j     Document Type: Article

References (35)

1. W. C. Cho C. H. Cheng Expert Rev. Proteomics 2007 4 401 410
2. S. Hanash Nature 2003 422 226 232
3. N. Rifai M. A. Gillette S. A. Carr Nat. Biotechnol. 2006 24 971 983
4. K. Ikeda T. Monden T. Kanoh M. Tsujie H. Izawa A. Haba T. Ohnishi M. Sekimoto N. Tomita H. Shiozaki M. Monden J. Histochem. Cytochem. 1998 46 397 403
5. S. R. Shi R. J. Cote L. Wu C. Liu R. Datar Y. Shi D. Liu H. Lim C. R. Taylor J. Histochem. Cytochem. 2002 50 1005 1011
6. N. J. Nirmalan P. Harnden P. J. Selby R. E. Banks J. Pathol. 2009 217 497 506
7. S. K. Penland T. O. Keku C. Torrice X. He J. Krishnamurthy K. A. Hoadley J. T. Woosley N. E. Thomas C. M. Perou R. S. Sandler N. E. Sharpless Lab. Invest. 2007 87 383 391
8. D. K. Crockett Z. Lin C. P. Vaughn M. S. Lim K. S. Elenitoba-Johnson Lab. Invest. 2005 85 1405 1415
9. B. L. Hood M. M. Darfler T. G. Guiel B. Furusato D. A. Lucas B. R. Ringeisen I. A. Sesterhenn T. P. Conrads T. D. Veenstra D. B. Krizman Mol. Cell. Proteomics 2005 4 1741 1753
10. S. I. Hwang J. Thumar D. H. Lundgren K. Rezaul V. Mayya L. Wu J. Eng M. E. Wright D. K. Han Oncogene 2007 26 65 76
11. X. Jiang S. Feng R. Tian M. Ye H. Zou J. Proteome Res. 2007 6 1038 1047
12. D. E. Palmer-Toy B. Krastins D. A. Sarracino J. B. Nadol, Jr S. N. Merchant J. Proteome Res. 2005 4 2404 2411
13. H. Xu L. Yang W. Wang S. R. Shi C. Liu Y. Liu X. Fang C. R. Taylor C. S. Lee B. M. Balgley J. Proteome Res. 2008 7 1098 1108
14. R. W. Sprung, Jr J. W. Brock J. P. Tanksley M. Li M. K. Washington R. J. Slebos D. C. Liebler Mol. Cell. Proteomics 2009 8 1988 1998
15. P. Cohen Nat. Cell Biol. 2002 4 E127 E130
16. P. Cohen Nat. Rev. Drug Discovery 2002 1 309 315
17. M. F. Moran J. Tong P. Taylor R. M. Ewing Biochim. Biophys. Acta 2006 1766 230 241
18. B. Macek M. Mann J. V. Olsen Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2009 49 199 221
19. P. Ostasiewicz D. F. Zielinska M. Mann J. R. Wisniewski J. Proteome Res. 2010 9 3688 3700
20. Y. Tian K. Gurley D. L. Meany C. J. Kemp H. Zhang J. Proteome Res. 2009 8 1657 1662
21. V. Lange P. Picotti B. Domon R. Aebersold Mol. Syst. Biol. 2008 4 222
22. T. A. Addona S. E. Abbatiello B. Schilling S. J. Skates D. R. Mani D. M. Bunk C. H. Spiegelman L. J. Zimmerman A. J. Ham H. Keshishian S. C. Hall S. Allen R. K. Blackman C. H. Borchers C. Buck H. L. Cardasis M. P. Cusack N. G. Dodder B. W. Gibson J. M. Held T. Hiltke A. Jackson E. B. Johansen C. R. Kinsinger J. Li M. Mesri T. A. Neubert R. K. Niles T. C. Pulsipher D. Ransohoff H. Rodriguez P. A. Rudnick D. Smith D. L. Tabb T. J. Tegeler A. M. Variyath L. J. Vega-Montoto A. Wahlander S. Waldemarson M. Wang J. R. Whiteaker L. Zhao N. L. Anderson S. J. Fisher D. C. Liebler A. G. Paulovich F. E. Regnier P. Tempst S. A. Carr Nat. Biotechnol. 2009 27 633 641
23. R. M. Buey E. Calvo I. Barasoain O. Pineda M. C. Edler R. Matesanz G. Cerezo C. D. Vanderwal B. W. Day E. J. Sorensen J. A. Lopez J. M. Andreu E. Hamel J. F. Diaz Nat. Chem. Biol. 2007 3 117 125
24. C. Cocca J. Dorado E. Calvo J. A. Lopez A. Santos A. Perez-Castillo Biochem. Pharmacol. 2009 78 1330 1339
25. D. M. Cox F. Zhong M. Du E. Duchoslav T. Sakuma J. C. McDermott J. Biomol. Tech. 2005 16 83 90
26. H. Liao J. Wu E. Kuhn W. Chin B. Chang M. D. Jones S. O'Neil K. R. Clauser J. Karl F. Hasler R. Roubenoff W. Zolg B. C. Guild Arthritis Rheum 2004 50 3792 3803
27. R. D. Unwin J. R. Griffiths M. K. Leverentz A. Grallert I. M. Hagan A. D. Whetton Mol. Cell. Proteomics 2005 4 1134 1144
28. A. Wolf-Yadlin S. Hautaniemi D. A. Lauffenburger F. M. White Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 5860 5865
29. A. Gamez-Pozo I. Sanchez-Navarro M. Nistal E. Calvo R. Madero E. Diaz E. Camafeita J. de Castro J. A. Lopez M. Gonzalez-Baron E. Espinosa J. A. Fresno Vara PLoS One 2009 4 e7731
30. G. Dennis Jr B. T. Sherman D. A. Hosack J. Yang W. Gao H. C. Lane R. A. Lempicki Genome Biol. 2003 4 P3
31. W. Huang da B. T. Sherman R. A. Lempicki Nat. Protocols 2009 4 44 57
32. B. M. Balgley T. Guo K. Zhao X. Fang F. A. Tavassoli C. S. Lee J. Proteome Res. 2009 8 917 925
33. C. B. Fowler R. E. Cunningham T. J. O'Leary J. T. Mason Lab. Invest. 2007 87 836 846
34. G. Han M. Ye H. Zhou X. Jiang S. Feng R. Tian D. Wan H. Zou J. Gu Proteomics 2008 8 1346 1361
35. N. Sugiyama T. Masuda K. Shinoda A. Nakamura M. Tomita Y. Ishihama Mol. Cell Proteomics 2007 6 1103 1109