GPU-based implementations of the noniterative regularized-CCSD(T) corrections: Applications to strongly correlated systems

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 7, Issue 5, 2011, Pages 1316-1327

  Ma, Wenjing ^a   Krishnamoorthy, Sriram ^b   Villa, Oreste ^b   Kowalski, Karol ^c  

^a Ohio State University   (United States)

^b PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

^c PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 79955926729     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct1007247     Document Type: Article

References (88)

1. Coester, F. Nucl. Phys. 1958, 7, 421-424
2. Coester, F.; Kümmel, H. Nucl. Phys. 1960, 17, 477-485
3. Čížek, J. J. Chem. Phys. 1966, 45, 4256-4266
4. Paldus, J.; Shavitt, I.; Čížek, J. Phys. Rev. A 1972, 5, 50-67
5. Crawford, T. D.; Schaefer, H. F. Rev. Comput. Chem. 2000, 14, 33-136
6. Piecuch, P.; Kowalski, K.; Pimienta, I. S. O.; McGuire, M. J. Int. Rev. Phys. Chem. 2002, 21, 527-655
7. Bartlett, R. J.; Musiał, M. Rev. Mod. Phys. 2007, 79, 291-352
8. Purvis, G. D.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 1982, 76, 1910-1918
9. Cullen, J. M.; Zerner, M. C. J. Chem. Phys. 1982, 77, 4088-4109
10. Noga, J.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 1987, 86, 7041-7050
11. Noga, J. J. Chem. Phys. 1988, 89, 3401-3401
12. Urban, M.; Noga, J.; Cole, S. J.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 1985, 83, 4041-4046
13. Raghavachari, K.; Trucks, G. W.; Pople, J. A.; Head-Gordon, M. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 479-483
14. Stanton, J. F. Chem. Phys. Lett. 1997, 281, 130-134
15. Stanton, J. F.; Gauss, J. J. Chem. Phys. 1995, 103, 1064-1076
16. Stanton, J. F.; Gauss, J. Theor. Chim. Acta 1996, 93, 303-313
17. Kucharski, S. A.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 1998, 108, 5243-5254
18. Kucharski, S. A.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 1998, 108, 5255-5264
19. Crawford, T. D.; Stanton, J. F. Int. J. Quantum Chem. 1998, 70, 601-611
20. Gwaltney, S. R.; Head-Gordon, M. Chem. Phys. Lett. 2000, 323, 21-28
21. Gwaltney, S. R.; Head-Gordon, M. J. Chem. Phys. 2001, 115, 2014-2021
22. Gwaltney, S. R.; Byrd, E. F. C.; Van Voorhis, T.; Head-Gordon, M. Chem. Phys. Lett. 2002, 353, 359-367
23. Hirata, S.; Nooijen, M.; Grabowski, I.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 2001, 114, 3919-3928
24. Hirata, S.; Nooijen, M.; Grabowski, I.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 2001, 115, 3967-3968
25. Bomble, Y. J.; Stanton, J. F.; Kállay, M.; Gauss, J. J. Chem. Phys. 2005, 123, 8
26. Kállay, M.; Gauss, J. J. Chem. Phys. 2005, 123, 13
27. Taube, A. G.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 2008, 128, 13
28. Taube, A. G.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 2008, 128, 9
29. Kowalski, K.; Piecuch, P. J. Chem. Phys. 2000, 113, 18-35
30. Kowalski, K.; Piecuch, P. J. Chem. Phys. 2000, 113, 5644-5652
31. McGuire, M. J.; Piecuch, P.; Kowalski, K.; Kucharski, S. A.; Musiał, M. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 8878-8893
32. Kowalski, K.; Piecuch, P. J. Chem. Phys. 2005, 122, 12
33. Piecuch, P.; Włoch, M. J. Chem. Phys. 2005, 123, 10
34. Piecuch, P.; Włoch, M.; Gour, J. R.; Kinal, A. Chem. Phys. Lett. 2006, 418, 467-474
35. Włoch, M.; Gour, J. R.; Piecuch, P. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 11359-11382
36. Tajti, A.; Szalay, P. G.; Császár, A. G.; Kállay, M.; Gauss, J.; Valeev, E. F.; Flowers, B. A.; Vázquez, J.; Stanton, J. F. J. Chem. Phys. 2004, 121, 11599-11613
37. Bomble, Y. J.; Vázquez, J.; Kállay, M.; Michauk, C.; Szalay, P. G.; Császár, A. G.; Gauss, J.; Stanton, J. F. J. Chem. Phys. 2006, 125, 8
38. Hirata, S. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 9887-9897
39. Lotrich, V.; Flocke, N.; Ponton, M.; Yau, A. D.; Perera, A.; Deumens, E.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 2008, 128, 15
40. Kuś, T.; Lotrich, V. F.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 2009, 130, 7
41. Janowski, T.; Ford, A. R.; Pulay, P. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 1368-1377
42. Janowski, T.; Pulay, P. Chem. Phys. Lett. 2007, 447, 27-32
43. Janowski, T.; Ford, A. R.; Pulay, P. Mol. Phys. 2010, 108, 249-257
44. Bentz, J. L.; Olson, R. M.; Gordon, M. S.; Schmidt, M. W.; Kendall, R. A. Comput. Phys. Commun. 2007, 176, 589-600
45. de Jong, W. A.; Bylaska, E.; Govind, N.; Janssen, C. L.; Kowalski, K.; Muller, T.; Nielsen, I. M. B.; van Dam, H. J. J.; Veryazov, V.; Lindh, R. Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 6896-6920
46. Kowalski, K.; Krishnamoorthy, S.; Villa, O.; Hammond, J. R.; Govind, N. J. Chem. Phys. 2010, 132, 154103
47. Yoo, S.; Apra, E.; Zeng, X. C.; Xantheas, S. S. J. Phys. Chem. Lett. 2010, 1, 3122-3127
48. Valiev, M.; Bylaska, E. J.; Govind, N.; Kowalski, K.; Straatsma, T. P.; Van Dam, H. J. J.; Wang, D.; Nieplocha, J.; Apra, E.; Windus, T. L.; de Jong, W. A. Comput. Phys. Commun. 2010, 181, 1477-1489
49. Apra, E.; Harrison, R.; de Jong., W. A.; Rendell, A.; Tipparaju, V.; Xantheas, S.; Olsen, R. Proc. of the ACM/IEEE Supercomp. 2009 Conf. 2009; pp 66:1 - 66:7.
50. Anderson, A. G.; Goddard, W. A.; Schröder, P. Comput. Phys. Commun. 2007, 177, 298-306
51. Owens, J. D.; Luebke, D.; Govindaraju, N.; Harris, M.; Kruger, J.; Lefohn, A. E.; Purcell, T. J. Comput. Graphics Forum 2007, 26, 80-113
52. Stone, J. E.; Phillips, J. C.; Freddolino, P. L.; Hardy, D. J.; Trabuco, L. G.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2007, 28, 2618-2640
53. Hardy, D. J.; Stone, J. E.; Schulten, K. Parallel Comput. 2009, 35, 164-177
54. Stone, J. E.; Hardy, D. J.; Ufimtsev, I. S.; Schulten, K. J. Mol. Graph. Model. 2010, 29, 116-125
55. Yasuda, K. J. Comput. Chem. 2008, 29, 334-342
56. Yasuda, K. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1230-1236
57. Ufimtsev, I. S.; Martinez, T. J. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 222-231
58. Ufimtsev, I. S.; Martinez, T. J. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 1004-1015
59. Ufimtsev, I. S.; Martinez, T. J. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 2619-2628
60. Anderson, J. A.; Lorenz, C. D.; Travesset, A. J. Chem. Phys. 2008, 227, 5342-5359
61. Vogt, L.; Olivares-Amaya, R.; Kermes, S.; Shao, Y.; Amador-Bedolla, C.; Aspuru-Guzik, A. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 2049-2057
62. Friedrichs, M. S.; Eastman, P.; Vaidyanathan, V.; Houston, M.; Legrand, S.; Beberg, A. L.; Ensign, D. L.; Bruns, C. M.; Pande, V. S. J. Comput. Chem. 2009, 30, 864-872
63. van Meel, J. A.; Arnold, A.; Frenkel, D.; Zwart, S. F. P.; Belleman, R. G. Mol. Simul. 2008, 34, 259-266
64. Eastman, P.; Pande, V. S. J. Comput. Chem. 2010, 31, 1268-1272
65. Ma, W.; Krishnamoorthy, S.; Villa, O.; Kowalski, K. IEEE Intl. Conf. Cluster Comp. 2010, 207-216
66. Kowalski, K.; Valiev, M. J. Chem. Phys. 2009, 131, 12
67. Farazdel, A.; Dupuis, M.; Clementi, E.; Aviram, A. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4206-4214
68. Pastore, M.; Helal, W.; Isti, S. E.; Leininger, T.; Malrieu, J. P.; Maynau, D.; Angeli, C.; Cimiraglia, R. J. Chem. Phys. 2008, 128, 9
69. Helal, W.; Evangelisti, S.; Leininger, T.; Maynau, D. J. Comput. Chem. 2009, 30, 83-92
70. Pastore, M.; Helal, W.; Angeli, C.; Evangelisti, S.; Leininger, T.; Cimiraglia, R. THEOCHEM 2009, 896, 12-17
71. Kowalski, K.; Fan, P. D. J. Chem. Phys. 2009, 130, 11
72. Taube, A. G.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 2009, 130, 14
73. NVIDIA, NVIDIA CUDA C Programming Guide; http://developer.download. nvidia.com/compute/cuda/3-2-prod/toolkit/docs/CUDA-C-Programming-Guide.pdf (accessed 11/9/2010).
74. Dunning, T. H. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007-1023
75. Krishnan, R.; Binkley, J. S.; Seeger, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1980, 72, 650-654
76. Sadlej, A. J. Collect. Czech. Chem. C. 1988, 53, 1995-2016
77. Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11623-11627
78. Glaesemann, K. R.; Govind, N.; Krishnamoorthy, S.; Kowalski, K. J. Phys. Chem. 2010, 114, 8764-8771
79. Schütz, M. J. Chem. Phys. 2002, 116, 8772-8785
80. Knowles, P. J.; Werner, H. J. Chem. Phys. Lett. 1988, 145, 514-522
81. Werner, H. J.; Knowles, P. J. J. Chem. Phys. 1988, 89, 5803-5814
82. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Koseki, S.; Matsunaga, N.; Nguyen, K. A.; Su, S. J.; Windus, T. L.; Dupuis, M.; Montgomery, J. A. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347-1363
83. Piecuch, P.; Kucharski, S. A.; Kowalski, K.; Musiał, M. Comput. Phys. Commun. 2002, 149, 71-96
84. Li, W.; Piecuch, P.; Gour, J. R.; Li, S. H. J. Chem. Phys. 2009, 131, 30
85. Andersson, K.; Malmqvist, P. A.; Roos, B. O.; Sadlej, A. J.; Wolinski, K. J. Phys. Chem. 1990, 94, 5483-5488
86. Angeli, C.; Cimiraglia, R.; Evangelisti, S.; Leininger, T.; Malrieu, J. P. J. Chem. Phys. 2001, 114, 10252-10264
87. Nakano, H. J. Chem. Phys. 1993, 99, 7983-7992
88. Kowalski, K.; Piecuch, P. J. Chem. Phys. 2004, 120, 1715-1738