Spectrally silent intermediates during the photochemical reactions of Salinibacter sensory rhodopsin i

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 15, 2011, Pages 4500-4508

  Inoue, Keiichi ^a   Sudo, Yuki ^b,c   Homma, Michio ^b   Kandori, Hideki ^a  

^a NAGOYA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (Japan)

^b NAGOYA UNIVERSITY   (Japan)

^c JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIOLOGY; CHLORINE COMPOUNDS; PHOTOEXCITATION; REFRACTIVE INDEX; SIGNAL TRANSDUCTION;

ACTIVE STATE; BLUE-SHIFTED; CHLORIDE IONS; ENTHALPY CHANGE; MICROBIAL RHODOPSINS; PHOTOREACTIONS; REFRACTIVE INDEX CHANGES; REMOVAL OF CHLORIDE; SIGNALING PROCESS; SILENT STEP; STRUCTURAL CHANGE; TRANSIENT GRATING; VOLUME EXPANSION;

REACTION INTERMEDIATES;

EID: 79954543976     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp2000706     Document Type: Article

References (55)

1. Spudich, J. L.; Jung, K.-H. Handbook of Photosensory Receptors; Wiley-VCH: Weinheim, 2005.
2. Chizhov, I.; Schmies, G.; Seidel, R.; Sydor, J. R.; Lüttenberg, B.; Engelhard., M. Biophys. J. 1998, 75, 999-1009
3. Furutani, Y.; Iwamoto, M.; Shimono, K.; Wada, A.; Ito, M.; Kamo, N.; Kandori, H. Biochemistry 2004, 43, 5204-5212
4. Furutani, Y.; Kamada, K.; Sudo, Y.; Shimono, K.; Kamo, N.; Kandori, H. Biochemistry 2005, 44, 2909-2915
5. Gordeliy, V. I.; Labahn, J.; Moukhametzianov, R.; Efremov, R.; Granzin, J.; Schlesinger, R.; Büldt, G.; Savopol, T.; Scheidig, A. J.; Klare, J. P.; Engelhard, M. Nature 2002, 419, 484-487
6. Wegener, A.-A.; Klare, J. P.; Engelhard, M.; Steinhoff, H.-J. EMBO J. 2001, 20, 5312-5319
7. Moukhametzianov, R.; Klare, J. P.; Efremov, R.; Baeken, C.; Göppner, A.; Labahn, J.; Engelhard, M.; Büldt, G.; Gordeliy, V. I. Nature 2006, 440, 115-119
8. Sudo, Y.; Furutani, Y.; Shimono, K.; Kamo, N.; Kandori, H. Biochemistry 2003, 43, 13748-13754
9. Yang, C.-S.; Sineshchekov, O.; Spudich, E. N.; Spudich, J. L. J. Biol. Chem. 2004, 279, 42970-42976
10. Kitajima-Ihara, T.; Furutani, Y.; Suzuki, D.; Ihara, K.; Kandori, H.; Homma, M.; Sudo, Y. J. Biol. Chem. 2008, 283, 23533-23541
11. Yagasaki, J.; Suzuki, D.; Ihara, K.; Inoue, K.; Kikukawa, T.; Sakai, M.; Fujii, M.; Homma, M.; Kandori, H.; Sudo, Y. Biochemistry 2010, 49, 1183-1190
12. Suzuki, D.; Furutani, Y.; Inoue, K.; Kikukawa, T.; Sakai, M.; Fujii, M.; Kandori, H.; Homma, M.; Sudo, Y. J. Mol. Biol. 2009, 392, 48-62
13. Sudo, Y.; Okada, A.; Suzuki, D.; Inoue, K.; Irieda, H.; Sakai, M.; Fujii, M.; Furutani, Y.; Kandori, H.; Homma, M. Biochemistry 2009, 48, 10136-10145
14. Swartz, T. E.; Szundi, I.; Spudich, J. L.; Bogomolni, R. A. Biochemistry 2000, 39, 15101-15109
15. Chizhov, I.; Chernavskii, D. S.; Engelhard, M.; Mueller, K.-H.; Hess, B. Biophys. J. 1996, 71, 2329-2345
16. Lórenz-Fonfría, V. A.; Kandori, H. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 5891-5901
17. Shibata, M.; Muneda, N.; Sasaki, T.; Shimono, K.; Kamo, N.; Demura, M.; Kandori, H. Biochemistry 2005, 44, 12279-12286
18. Klare, J. P.; Gordeliy, V. I.; Labahn, J.; Büldt, G.; Steinhoff, H.-J.; Engelhard, M. FEBS Lett. 2004, 564, 219-224
19. Garczarek, F.; Gerwert, K. Nature 2006, 439, 109-112
20. Hein, M.; Wegener, A. A.; Engelhard, M.; Siebert, F. Biophys. J. 2003, 84, 1208-1217
21. Hein, M.; Wegener, A. A.; Engelhard, M.; Siebert, F. Biochemistry 2004, 43, 995-1002
22. Lórenz-Fonfría, V. A.; Kandori, H. Appl. Spectrosc. 2007, 61, 428-443
23. Kochendoerfer, G. G.; Kaminaka, S.; Mathies, R. A. Biochemistry 1997, 36, 13153-13159
24. Kim, J. E.; Pan, D.; Mathies, R. A. Biochemistry 2003, 42, 5169-5175
25. Mizuno, M.; Shibata, M.; Yamada, J.; Kandori, H.; Mizutani, Y. J. Phys.Chem. B 2009, 113, 12121-12128
26. Bordignon, E.; Klare, J. P.; Holterhues, J.; Martell, S.; Kransnaberski, A.; Engelhard, M.; Steinhoff, H.-J. Photochem. Photobiol. 2007, 83, 263-272
27. Ostermann, A.; Waschipky, R.; Parak, F. G.; Nienhaus, G. U. Nature 2000, 404, 205-208
28. Schotte, F.; Lim, M.; Jackson, T. A.; Smirnov, A. V.; Soman, J.; Olson, J. S.; Phyillips, G. N., Jr.; Wulff, M.; Anfinrud, P. A. Science 2003, 300, 1944-1947
29. Schmidt, M.; Pahl, R.; Srajer, V.; Anderson, S.; Ren, Z.; Ihee, H.; Rajagopal, S.; Moffat, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 4799-4804
30. Terazima, M.; Hirota, N. J. Phys. Chem. 1993, 97, 5188-5192
31. Sakakura, M.; Morishima, I.; Terazima, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 10424-10434
32. Takeshita, K.; Imamoto, Y.; Kataoka, M.; Mihara, K.; Tokunaga, F.; Terazima, M. Biophys. J. 2002, 83, 1567-1577
33. Nishida, S.; Nada, T.; Terazima, M. Biophys. J. 2004, 87, 2663-2675
34. Nishioku, Y.; Nakagawa, M.; Tsuda, M.; Terazima, M. Biophys. J. 2001, 80, 2922-2927
35. Inoue, K.; Sasaki, J.; Morisaki, M.; Tokunaga, F.; Terazima, M. Biophys. J. 2004, 87, 2587-2597
36. Inoue, K.; Sasaki, J.; Spudich, J. L.; Terazima, M. Biophys. J. 2007, 92, 2028-2040
37. Inoue, K.; Sasaki, J.; Spudich, J. L.; Terazima, M. J. Mol. Biol. 2008, 376, 963-970
38. Hazra, P.; Inoue, K.; Laan, W.; Hellingwerf, K. J.; Terazima, M. Biophys. J. 2006, 91, 654-661
39. Eitoku, T.; Nakasone, Y.; Matsuoka, D.; Tokutomi, S.; Terazima, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 13238-13244
40. Nakasone, Y.; Eitoku, T.; Matsuoka, D.; Tokutomi, S.; Terazima, M. J. Mol. Biol. 2007, 367, 432-442
41. Tanaka, K.; Nakasone, Y.; Okajima, K.; Ikeuchi, M.; Tokutomi, S.; Terazima, M. J. Mol. Biol. 2009, 386, 1290-1300
42. Losi, A.; Braslavsky, S. E.; Gärtner, W.; Spudich, J. L. Biophys. J. 1999, 76, 2183-2191
43. Hashimoto, S.; Obata, K.; Takeuchi, H.; Needleman, R.; Lanyi, J. K. Biochemistry 1997, 36, 11583-11590
44. Tittor, J.; Oesterhelt, D. FEBS. Lett. 1990, 263, 269-273
45. Inoue, K.; Kubo, M.; Demura, M.; Kamo, N.; Terazima, M. Biophys. J. 2009, 96, 3724-3734
46. Kolbe, M.; Besir, H.; Essen, L.-O.; Oesterhelt, D. Science 2000, 288, 1390-1396
47. Young, M. E.; Carroad, P. A. Biotechnol. Bioeng. 1980, 22, 947-955
48. Møller, J. V.; le Maire, M. J. Biol. Chem. 1993, 268, 18659-18672
49. Salamat-Miller, N.; Chittchang, M.; Mitra, A. K.; Johnston, T. P. Int. J. Pharm. 2002, 244, 1-8
50. Van Holde, K. E.; Johnson, W. C.; Shing Ho, P. Physical Biochemistry; Prentice-Hall: Engelwood Cliffs, NJ, USA, 1998.
51. Chen, X.; Spudich, J. L. Biochemistry 2002, 41, 3891-3896
52. Milligan, D. L.; Koshland, D. E., Jr. J. Biol. Chem. 1998, 263, 6268-6275
53. Zhang, X.-N.; Spudich, J. L. J. Biol. Chem. 1998, 273, 19722-19728
54. Losi, A.; Wegener, A. A.; Engelhard, M.; Gärtner, W.; Braslavsky, S. E. Biophys. J. 1999, 77, 3277-3286
55. Nishioku, Y.; Nakagawa, M.; Tsuda, M.; Terazima, M. Biophys. J. 2002, 83, 1136-1146