Experimental and theoretical study of the vibrational spectra of oligoureas: Helical versus β-sheet-type secondary structures

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 15, 2011, Pages 4446-4452

  Cavagnat, Dominique ^a   Claudon, Paul ^b   Fischer, Lucile ^b   Guichard, Gilles ^b   Desbat, Bernard ^b  

^a UNIVERSITÉ DE BORDEAUX   (France)

^b INSTITUT EUROPÉEN DE CHIMIE ET BIOLOGIE   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CALCULATIONS; HYDROGEN; HYDROGEN BONDS; ULTRATHIN FILMS; UREA;

AB INITIO CALCULATIONS; BOND DISTANCE; CARBONYL BANDS; INFRARED SPECTRUM; OLIGOUREAS; OPTICAL INDICES; PM-IRRAS; POLARIZATION MODULATION INFRARED REFLECTION ABSORPTION SPECTROSCOPY; PRINCIPAL DIRECTIONS; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; REFLECTION SPECTROSCOPY; SECONDARY STRUCTURES; THEORETICAL STUDY; TRANSITION MOMENTS; VIBRATIONAL ASSIGNMENT;

ABSORPTION SPECTROSCOPY;

EID: 79954508885     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp1109674     Document Type: Article

References (17)

1. Fischer, L.; Guichard, G. Org. Biomol. Chem. 2010, 8, 3101-3117
2. Violette, A.; Fournel, S.; Lamour, K.; Chaloin, O.; Frisch, B.; Briand, J. P.; Monteil, H.; Guichard, G. Chem. Biol. 2006, 13, 531-538
3. Claudon, P.; Violette, A.; Lamour, K.; Decossas, M.; Fournel, S.; Heurtault, B.; Godet, J.; Mély, Y.; Jamart-Gregoire, B.; Averlant-Petit, M. C.; Briand, J. P.; Duportail, G.; Monteil, H.; Guichard, G. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 333-336
4. Violette, A.; Averlant-Petit, M. C.; Semetey, V.; Hemmerlin, C.; Casimir, R.; Graff, R.; Marraud, M.; Briand, J. P.; Rognan, D.; Guichard, G. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 2156-2164
5. Miyazawa, T. Infrared Spectra and Helical Conformations in Poly-α-Amino Acids; Marcel Dekker: New York, 1967.
6. Goormaghtigh, E.; Cabiaux, V.; Ruysschaert, J. M. Subcell. Biochem. 1994, 23, 405-450
7. Fischer, L.; Claudon, P.; Pendem, N.; Miclet, E.; Didierjean, C.; Ennifar, E.; Guichard, G. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2010, 49, 1067-70
8. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, J. A., Jr.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.; Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, N. J.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Farkas, Ö.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J. Gaussian 09; Gaussian, Inc.: Wallingford CT, 2009.
9. Chai, J.-D.; Head-Gordon, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 6615-6620
10. Kubelka, J.; Huang, R.; Keiderling, T. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 8231-8243
11. Buffeteau, T.; Blaudez, D.; Péré, E.; Desbat, B. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 5020-5027
12. Koch, O.; Bocola, M.; Klebe, G. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2005, 61, 310-317
13. Blaudez, D.; Turlet, J. M.; Dufourc, J.; Bard, D.; Buffeteau, T.; Desbat, B. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1996, 92, 525-530
14. Blaudez, D.; Buffeteau, T.; Cornut, J. C.; Desbat, B.; Escafre, N.; Pezolet, M.; Turlet, J. M. Appl. Spectrosc. 1993, 47, 869-874
15. Frey, S.; Tamm, L. K. Biophys. J. 1991, 60, 922-930
16. Reiter, G.; Siam, M.; Falkenhagen, D.; Gollneritsch, W.; Baurecht, D.; Fringeli, U. P. Langmuir 2002, 18, 5761-5771
17. Castano, S.; Desbat, B. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1715, 81-95