Determination of relative tensor orientations by γ-encoded chemical shift anisotropy/heteronuclear dipolar coupling 3D NMR spectroscopy in biological solids

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 12, Issue 45, 2010, Pages 14873-14883

  Hou, Guangjin ^a,b   Paramasivam, Sivakumar ^a   Byeon, In Ja L ^b   Gronenborn, Angela M ^b   Polenova, Tatyana ^a,b  

^a UNIVERSITY OF DELAWARE   (United States)

^b UNIVERSITY OF PITTSBURGH SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

NITROGEN; OLIGOPEPTIDE;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CHEMISTRY; METHODOLOGY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE;

AMINO ACID SEQUENCE; NITROGEN ISOTOPES; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; OLIGOPEPTIDES;

EID: 78649730176     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0cp00795a     Document Type: Article

References (87)

1. A. McDermott T. Polenova Curr. Opin. Struct. Biol. 2007 17 617 622
2. L. Huang A. E. McDermott Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2008 1777 1098 1108
3. M. Hong Structure 2006 14 1731 1740
4. K. Seidel O. C. Andronesi J. Krebs C. Griesinger H. S. Young S. Becker M. Baldus Biochemistry 2008 47 4369 4376
5. C. Ader R. Schneider K. Seidel M. Etzkorn S. Becker M. Baldus J. Am. Chem. Soc. 2009 131 170 176
6. D. H. Zhou G. Shah C. Mullen D. Sandoz C. M. Rienstra Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 1253 1256
7. R. P. Nanga J. R. Brender S. Vivekanandan N. Popovych A. Ramamoorthy J. Am. Chem. Soc. 2009 131 17972 17979
8. L. Shi E. M. Lake M. A. Ahmed L. S. Brown V. Ladizhansky Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2009 1788 2563 2574
9. R. Tycko Q. Rev. Biophys. 2006 39 1
10. C. Wasmer A. Lange H. Van Melckebeke A. B. Siemer R. Riek B. H. Meier Science 2008 319 1523 1526
11. C. P. Jaroniec C. E. MacPhee V. S. Bajaj M. T. McMahon C. M. Dobson R. G. Griffin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 711 716
12. J. J. Helmus K. Surewicz P. S. Nadaud W. K. Surewicz C. P. Jaroniec Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 6284 6289
13. K. J. Shon Y. Kim L. A. Colnago S. J. Opella Science 1991 252 1303 1305
14. D. S. Thiriot A. A. Nevzorov L. Zagyanskiy C. H. Wu S. J. Opella J. Mol. Biol. 2004 341 869 879
15. Y. Han J. Ahn J. Concel I. J. Byeon A. M. Gronenborn J. Yang T. Polenova J. Am. Chem. Soc. 2010 132 1976 1987
16. S. Sun A. Siglin J. C. Williams T. Polenova J. Am. Chem. Soc. 2009 131 10113 10126
17. J. L. Lorieau A. E. McDermott J. Am. Chem. Soc. 2006 128 11505 11512
18. J. L. Lorieau L. A. Day A. E. McDermott Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 10366 10371
19. A. Mainz S. Jehle B. J. van Rossum H. Oschkinat B. Reif J. Am. Chem. Soc. 2009 131 15968 15969
20. N. Giraud M. Blackledge M. Goldman A. Bockmann A. Lesage F. Penin L. Emsley J. Am. Chem. Soc. 2005 127 18190 18201
21. A. Bockmann M. Juy E. Bettler L. Emsley A. Galinier F. Penin A. Lesage J. Biomol. NMR 2005 32 195 207
22. A. Lesage L. Emsley F. Penin A. Bockmann J. Am. Chem. Soc. 2006 128 8246 8255
23. B. J. Wylie L. J. Sperling H. L. Frericks G. J. Shah W. T. Franks C. M. Rienstra J. Am. Chem. Soc. 2007 129 5318 5319
24. B. Wylie C. D. Schwieters E. Oldfield C. Rienstra J. Am. Chem. Soc. 2009 131 985 992
25. J. Yang M. L. Tasayco T. Polenova J. Am. Chem. Soc. 2008 130 5798 5807
26. J. Yang M. L. Tasayco T. Polenova J. Am. Chem. Soc. 2009 131 13690 13702
27. M. Baldus Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2002 41 1 47
28. R. Tycko Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2003 42 53 68
29. R. R. Ernst, G. Bodenhausen and A. Wokaun, Principles of nuclear magnetic resonance in one and two dimensions, Oxford University Press, New York, 1987
30. K. Schmidt-Rohr and H. W. Spiess, Multidimensional solid-state NMR and polymers, Academic Press, London, San Diego, 1994
31. W. T. Franks D. H. Zhou B. J. Wylie B. G. Money D. T. Graesser H. L. Frericks G. Sahota C. M. Rienstra J. Am. Chem. Soc. 2005 127 12291 12305
32. W. T. Franks B. Wylie H. L. Schmidt A. J. Nieuwkoop R. M. Mayrhofer G. J. Shah D. T. Graesser C. Rienstra Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 4621 4626
33. M. Hohwy C. P. Jaroniec B. Reif C. M. Rienstra R. G. Griffin J. Am. Chem. Soc. 2000 122 3218 3219
34. S. K. Kandasamy D. K. Lee R. P. Nanga J. Xu J. S. Santos R. G. Larson A. Ramamoorthy Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2009 1788 686 695
35. J. C. C. Chan R. Tycko J. Chem. Phys. 2003 118 8378 8389
36. L. Duma D. Abergel F. Ferrage P. Pelupessy P. Tekely G. Bodenhausen ChemPhysChem 2008 9 1104 1106
37. M. A. Mehta M. T. Eddy S. A. McNeill F. D. Mills J. R. Long J. Am. Chem. Soc. 2008 130 2202 2212
38. I. Schnell Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 2004 45 145 207
39. C. T. Kehlet A. C. Sivertsen M. Bjerring T. O. Reiss N. Khaneja S. J. Glaser N. C. Nielsen J. Am. Chem. Soc. 2004 126 10202 10203
40. X. Zhao M. Eden M. H. Levitt Chem. Phys. Lett. 2001 342 353 361
41. R. Verel M. Ernst B. H. Meier J. Magn. Reson. 2001 150 81 99
42. A. E. Bennett D. P. Weliky R. Tycko J. Am. Chem. Soc. 1998 120 4897 4898
43. R. Fu S. A. Smith G. Bodenhausen Chem. Phys. Lett. 1997 272 361 369
44. M. Ernst S. Bush A. C. Kolbert A. Pines J. Chem. Phys. 1996 105 3387 3397
45. Y. F. Wei D. K. Lee A. E. McDermott A. Ramamoorthy J. Magn. Reson. 2002 158 23 35
46. D. K. Lee Y. F. Wei A. Ramamoorthy J. Phys. Chem. B 2001 105 4752 4762
47. Y. F. Wei D. K. Lee A. Ramamoorthy Chem. Phys. Lett. 2000 324 20 24
48. A. Poon J. Birn A. Ramamoorthy J. Phys. Chem. B 2004 108 16577 16585
49. L. Chen Q. Wang B. W. Hu O. Lafon J. Trebosc F. Deng J. P. Amoureux Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 9395 9405
50. G. A. Lorigan R. McNamara R. A. Jones S. J. Opella J. Magn. Reson. 1999 140 315 319
51. A. A. Nevzorov S. J. Opella J. Magn. Reson. 2003 160 33 39
52. J. K. Denny J. Wang T. A. Cross J. R. Quine J. Magn. Reson. 2001 152 217 226
53. N. J. Traaseth L. Shi R. Verardi D. G. Mullen G. Barany G. Veglia Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 10165 10170
54. D. K. Lee R. J. Wittebort A. Ramamoorthy J. Am. Chem. Soc. 1998 120 8868 8874
55. B. J. van Rossum C. P. de Groot V. Ladizhansky S. Vega H. J. M. de Groot J. Am. Chem. Soc. 2000 122 3465 3472
56. R. Tycko J. Chem. Phys. 2007 126 064506
57. M. Eden Chem. Phys. Lett. 2003 378 55 64
58. A. Brinkmann M. H. Levitt J. Chem. Phys. 2001 115 357 384
59. M. Eden M. H. Levitt J. Chem. Phys. 1999 111 1511 1519
60. M. Carravetta M. Eden X. Zhao A. Brinkmann M. H. Levitt Chem. Phys. Lett. 2000 321 205 215
61. A. C. DeDios J. G. Pearson E. Oldfield Science 1993 260 1491 1496
62. J. R. Brender D. M. Taylor A. Ramamoorthy J. Am. Chem. Soc. 2001 123 914 922
63. A. P. S. Jurd J. J. Titman Phys. Chem. Chem. Phys. 2009 11 6999 7007
64. O. C. Andronesi J. R. Pfeifer L. Al-Momani S. Ozdirekcan D. T. Rijkers B. Angerstein S. Luca U. Koert J. A. Killian M. Baldus J. Biomol. NMR 2004 30 253 265
65. Y. Ishii T. Terao M. Kainosho Chem. Phys. Lett. 1996 256 133 140
66. A. Ramamoorthy S. J. Opella Solid State Nucl. Magn. Reson. 1995 4 387 392
67. K. Schmidt-Rohr J. Am. Chem. Soc. 1996 118 7601 7603
68. X. L. Yao M. Hong J. Am. Chem. Soc. 2002 124 2730 2738
69. Y. Nishiyama T. Yamazaki T. Terao J. Chem. Phys. 2006 124 064304
70. Y. K. Lee N. D. Kurur M. Helmle O. G. Johannessen N. C. Nielsen M. H. Levitt Chem. Phys. Lett. 1995 242 304 309
71. M. Bak J. Magn. Reson. 2000 147 296 330
72. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, A. Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, GAUSSIAN 03, revision C.02, Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2004
73. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648 5652
74. A. Schafer H. Horn R. Ahlrichs J. Chem. Phys. 1992 97 2571 2577
75. C. M. Rienstra L. Tucker-Kellogg C. P. Jaroniec M. Hohwy B. Reif M. T. McMahon B. Tidor T. Lozano-Perez R. G. Griffin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 10260 10265
76. C. J. Jameson A. K. Jameson S. M. Cohen H. Parker D. Oppusunggu P. M. Burrell S. Wille J. Chem. Phys. 1981 74 1608 1612
77. J. C. Facelli R. J. Pugmire D. M. Grant J. Am. Chem. Soc. 1996 118 5488 5489
78. K. J. Hallock D. K. Lee A. Ramamoorthy J. Chem. Phys. 2000 113 11187 11193
79. A. Samoson T. Tuherm Z. Gan Solid State Nucl. Magn. Reson. 2001 20 130 136
80. M. Ernst M. A. Meier T. Tuherm A. Samoson B. H. Meier J. Am. Chem. Soc. 2004 126 4764 4765
81. A. Samoson T. Tuherm J. Past A. Reinhold T. Anupold N. Heinmaa New Tech. Solid-State NMR 2005 246 15 31
82. D. Rovnyak D. P. Frueh M. Sastry Z. Y. J. Sun A. S. Stern J. C. Hoch G. Wagner J. Magn. Reson. 2004 170 15 21
83. A. T. Petkova M. Baldus M. Belenky M. Hong R. G. Griffin J. Herzfeld J. Magn. Reson. 2003 160 1 12
84. N. P. Wickramasinghe M. Shaibat Y. Ishii J. Am. Chem. Soc. 2005 127 5796 5797
85. D. H. Zhou G. Shah M. Cormos C. Mullen D. Sandoz C. M. Rienstra J. Am. Chem. Soc. 2007 129 11791 11801
86. C. M. Rienstra M. Hohwy L. J. Mueller C. P. Jaroniec B. Reif R. G. Griffin J. Am. Chem. Soc. 2002 124 11908 11922
87. J. C. C. Chan R. Tycko J. Am. Chem. Soc. 2003 125 11828 11829