-
2
-
-
0036667496
-
-
Ryde, U.; Olsen, L.; Nilsson, K. J. Comput. Chem. 2002, 23, 1058
-
(2002)
J. Comput. Chem.
, vol.23
, pp. 1058
-
-
Ryde, U.1
Olsen, L.2
Nilsson, K.3
-
3
-
-
60349127442
-
-
Senn, H. M.; Thiel, W. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 1198
-
(2009)
Angew. Chem., Int. Ed.
, vol.48
, pp. 1198
-
-
Senn, H.M.1
Thiel, W.2
-
4
-
-
15844393284
-
-
Hsiao, Y.-W.; Drakenberg, T.; Ryde, U. J. Biomol. NMR 2005, 31, 97
-
(2005)
J. Biomol. NMR
, vol.31
, pp. 97
-
-
Hsiao, Y.-W.1
Drakenberg, T.2
Ryde, U.3
-
5
-
-
33845249275
-
-
Hsiao, Y.-W.; Tao, Y.; Shokes, J. E.; Scott, R. A.; Ryde, U. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 2006, 74, 214101/1
-
(2006)
Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys.
, vol.74
-
-
Hsiao, Y.-W.1
Tao, Y.2
Shokes, J.E.3
Scott, R.A.4
Ryde, U.5
-
6
-
-
33846561241
-
-
Ryde, U.; Hsiao, Y.-W.; Rulišek, L.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 726
-
(2007)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.129
, pp. 726
-
-
Ryde, U.1
Hsiao, Y.-W.2
Rulišek, L.3
Solomon, E.I.4
-
8
-
-
24044522903
-
-
Yu, N.; Yennawar, H. P.; Merz, K. M., Jr. Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2005, 61, 322
-
(2005)
Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.
, vol.61
, pp. 322
-
-
Yu, N.1
Yennawar, H.P.2
Merz, Jr.K.M.3
-
9
-
-
33751504561
-
-
Yu, N.; Hayik, S. A.; Wang, B.; Liao, N.; Reynolds, C. H.; Merz, K. M., Jr. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 1057
-
(2006)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.2
, pp. 1057
-
-
Yu, N.1
Hayik, S.A.2
Wang, B.3
Liao, N.4
Reynolds, C.H.5
Merz, Jr.K.M.6
-
10
-
-
67650547195
-
-
Li, X.; He, X.; Wang, B.; Merz, K., Jr. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 7742
-
(2009)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.131
, pp. 7742
-
-
Li, X.1
He, X.2
Wang, B.3
Merz, Jr.K.4
-
11
-
-
77950689552
-
-
Li, X.; Hayik, S. A.; Merz, K. M., Jr. J. Inorg. Biochem. 2010, 104, 512
-
(2010)
J. Inorg. Biochem.
, vol.104
, pp. 512
-
-
Li, X.1
Hayik, S.A.2
Merz, Jr.K.M.3
-
12
-
-
0003834618
-
-
Yale University: New Haven, CT
-
Brunger, A. T.; Adams, P. D.; Clore, G. M.; Delano, W. L.; Gros, P.; Grosse-Kunstleve, R. W.; Jiang, J.-S.; Kuszewski, I.; Niges, M.; Pannu, N. S.; Read, R. J.; Rice, L. M.; Simonson, T.; Warren, G. L. Crystallography & NMR system CNS, Version 1.2; Yale University: New Haven, CT, 2000.
-
(2000)
Crystallography & NMR System CNS, Version 1.2
-
-
Brunger, A.T.1
Adams, P.D.2
Clore, G.M.3
Delano, W.L.4
Gros, P.5
Grosse-Kunstleve, R.W.6
Jiang, J.-S.7
Kuszewski, I.8
Niges, M.9
Pannu, N.S.10
Read, R.J.11
Rice, L.M.12
Simonson, T.13
Warren, G.L.14
-
13
-
-
9244260409
-
-
University of California: San Francisco, CA
-
Case, D.; Darden, T.; Cheatham, T. E. I.; Simmerling, C.; Wang, J.; Duke, R.; Luo, R.; Merz, K.; Wang, B.; Pearlman, D. A.; Crowley, M.; Brozell, S.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Beroza, P.; Schafmeister, C.; Caldwell, J. W.; Ross, W. S.; Kollman, P. A. AMBER 8; University of California: San Francisco, CA, 2004.
-
(2004)
AMBER 8
-
-
Case, D.1
Darden, T.2
Cheatham, T.E.I.3
Simmerling, C.4
Wang, J.5
Duke, R.6
Luo, R.7
Merz, K.8
Wang, B.9
Pearlman, D.A.10
Crowley, M.11
Brozell, S.12
Tsui, V.13
Gohlke, H.14
Mongan, J.15
Hornak, V.16
Cui, G.17
Beroza, P.18
Schafmeister, C.19
Caldwell, J.W.20
Ross, W.S.21
Kollman, P.A.22
more..
-
16
-
-
0041784950
-
-
MacKerell, A. D. J.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E. I.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586
-
-
MacKerell, A.D.J.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack, R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-Mccarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher, W.E.I.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stote, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
17
-
-
0035895225
-
-
Yarbrough, D.; Wachter, R. M.; Kallio, K.; Matz, M. V.; Remington, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 462
-
(2001)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.98
, pp. 462
-
-
Yarbrough, D.1
Wachter, R.M.2
Kallio, K.3
Matz, M.V.4
Remington, S.J.5
-
19
-
-
0034710921
-
-
Gross, L. A.; Baird, G. S.; Hoffman, R. C.; Baldridge, K. K.; Tsien, R. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 11990
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.97
, pp. 11990
-
-
Gross, L.A.1
Baird, G.S.2
Hoffman, R.C.3
Baldridge, K.K.4
Tsien, R.Y.5
-
20
-
-
0042847137
-
-
Boye, S.; Brondsted Nielsen, S.; Krogh, H.; Bloch Nielsen, I.; Pedersen, U. V.; Bell, A. F.; He, X.; Tonge, P. J.; Andersen, L. H. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 3021
-
(2003)
Phys. Chem. Chem. Phys.
, vol.5
, pp. 3021
-
-
Boye, S.1
Brondsted Nielsen, S.2
Krogh, H.3
Bloch Nielsen, I.4
Pedersen, U.V.5
Bell, A.F.6
He, X.7
Tonge, P.J.8
Andersen, L.H.9
-
21
-
-
36448940510
-
-
Strongin, D. E.; Bevis, B.; Khuong, N.; Downing, M. E.; Strack, R. L.; Sundaram, K.; Glick, B. S.; Keenan, R. J. Protein Eng., Des. Sel. 2007, 20, 525
-
(2007)
Protein Eng., Des. Sel.
, vol.20
, pp. 525
-
-
Strongin, D.E.1
Bevis, B.2
Khuong, N.3
Downing, M.E.4
Strack, R.L.5
Sundaram, K.6
Glick, B.S.7
Keenan, R.J.8
-
22
-
-
0034710920
-
-
Baird, G.; Zacharias, D. A.; Tsien, R. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 11984
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.97
, pp. 11984
-
-
Baird, G.1
Zacharias, D.A.2
Tsien, R.Y.3
-
23
-
-
73349118793
-
-
Sanchez-Garcia, E.; Doerr, M.; Hsiao, Y.-W.; Thiel, W. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 16622
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 16622
-
-
Sanchez-Garcia, E.1
Doerr, M.2
Hsiao, Y.-W.3
Thiel, W.4
-
25
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187
-
(1983)
J. Comput. Chem.
, vol.4
, pp. 187
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
28
-
-
0347170005
-
-
Hehre, W. J.; Ditchfield, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257
-
(1972)
J. Chem. Phys.
, vol.56
, pp. 2257
-
-
Hehre, W.J.1
Ditchfield, R.2
Pople, J.A.3
-
29
-
-
44449131445
-
-
Hersleth, H.-P.; Hsiao, Y.-W.; Ryde, U.; Görbitz, C. H.; Andersson, K. K. Biochem. J. 2008, 412, 257
-
(2008)
Biochem. J.
, vol.412
, pp. 257
-
-
Hersleth, H.-P.1
Hsiao, Y.-W.2
Ryde, U.3
Görbitz, C.H.4
Andersson, K.K.5
-
31
-
-
0030924992
-
-
Murshudov, G. N.; Vagin, A. A.; Dodson, E. J. Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 1997, 53, 240
-
(1997)
Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.
, vol.53
, pp. 240
-
-
Murshudov, G.N.1
Vagin, A.A.2
Dodson, E.J.3
-
33
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
34
-
-
0001224859
-
-
de Vries, A. H.; Sherwood, P.; Collins, S. J.; Rigby, A. M.; Rigutto, M.; Kramer, G. J. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 6133
-
(1999)
J. Phys. Chem. B
, vol.103
, pp. 6133
-
-
De Vries, A.H.1
Sherwood, P.2
Collins, S.J.3
Rigby, A.M.4
Rigutto, M.5
Kramer, G.J.6
-
35
-
-
70350076653
-
-
Sherwood, P.; de Vries, A. H.; Collins, S. J.; Greatbanks, S. P.; Burton, N. A.; Vincent, M. A.; Hillier, I. H. Faraday Discuss. Chem. Soc. 1997, 79
-
(1997)
Faraday Discuss. Chem. Soc.
, pp. 79
-
-
Sherwood, P.1
De Vries, A.H.2
Collins, S.J.3
Greatbanks, S.P.4
Burton, N.A.5
Vincent, M.A.6
Hillier, I.H.7
-
36
-
-
0030986177
-
-
Adams, P. D.; Pannu, N. S.; Read, R. J.; Brunger, A. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 5018
-
(1997)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.94
, pp. 5018
-
-
Adams, P.D.1
Pannu, N.S.2
Read, R.J.3
Brunger, A.T.4
-
37
-
-
84886753738
-
-
(accessed Sept 29, 2010)
-
VMD-Visual Molecular Dynamics. http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/ (accessed Sept 29, 2010).
-
VMD-Visual Molecular Dynamics
-
-
-
39
-
-
51749091946
-
-
Silva-Junior, M. R.; Schreiber, M.; Sauer, S. P. A.; Thiel, W. J. Chem. Phys. 2008, 129, 104103
-
(2008)
J. Chem. Phys.
, vol.129
, pp. 104103
-
-
Silva-Junior, M.R.1
Schreiber, M.2
Sauer, S.P.A.3
Thiel, W.4
-
42
-
-
72449121493
-
-
Parac, M.; Doerr, M.; Marian, C. M.; Thiel, W. J. Comput. Chem. 2010, 31, 90
-
(2010)
J. Comput. Chem.
, vol.31
, pp. 90
-
-
Parac, M.1
Doerr, M.2
Marian, C.M.3
Thiel, W.4
-
43
-
-
0001544916
-
-
Wiberg, K. B.; Rablen, P. R.; Marquez, M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 8654
-
(1992)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.114
, pp. 8654
-
-
Wiberg, K.B.1
Rablen, P.R.2
Marquez, M.3
|