3D structures of membrane-associated small molecules as determined in isotropic bicelles

Natural Product Reports

Volumn 27, Issue 10, 2010, Pages 1480-1492

  Matsumori, Nobuaki ^a   Murata, Michio ^a  

^a OSAKA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PEPTIDE; PHOSPHOLIPID; LIPID BILAYER;

AMINO ACID SEQUENCE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; LIPID BILAYER; METHODOLOGY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; REVIEW; PROCEDURES;

AMINO ACID SEQUENCE; LIPID BILAYERS; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR STRUCTURE; PEPTIDES; PHOSPHOLIPIDS;

EID: 77957144293     PISSN: 02650568     EISSN: 14604752     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0np00002g     Document Type: Review

References (89)

1. J. K. Seydel and M. Wiese, Drug-Membrane Interactions, Wiley-VCH: Weinheim, Germany, 2003, pp. 1-31
2. P. T. F. Williamson Concepts Magn. Reson. A. 2009 34 144 172
3. X. Gao T. C. Wong Biophys. J. 1998 74 1871 1888
4. C. Fernandez K. Wuthrich FEBS Lett. 2003 555 144 150
5. A. Mascioni F. Porcelli U. Ilangovan A. Ramamoorthy G. Veglia Biopolymers 2003 69 29 41
6. F. Porcelli B. Buck D.-K. Lee K. J. Hallock A. Ramamoorthy G. Veglia J. Biol. Chem. 2004 279 45815 45823
7. M. Lindberg J. Jarvet U. Langel A. Gräslund Biochemistry 2001 40 3141 3149
8. H. Biverståhl A. Andersson A. Gräslund L. Mäler Biochemistry 2004 43 14940 14947
9. P. Damberg J. Jarvet A. Gräslund Methods Enzymol. 2001 339 271 285
10. I. Marcotte M. Auger Concepts Magn. Reson. A. 2005 24 17 37
11. C. R. Sanders B. J. Hare K. P. Howard J. H. Prestegard Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 1994 26 421 444
12. J. J. Chou J. D. Kaufman S. J. Stahl P. T. Wingfield A. Bax J. Am. Chem. Soc. 2002 124 2450 2451
13. C. R. Sanders J. H. Prestegard Biophys. J. 1990 58 447 460
14. S. Gaemers A. Bax J. Am. Chem. Soc. 2001 123 12343 12352
15. M. P. Nieh C. J. Glinka S. Krueger R. S. Prosser J. Katsaras Langmuir 2001 17 2629 2638
16. C. R. Sanders G. C. Landis Biochemistry 1995 34 4030 4040
17. K. P. Howard J. H. Prestegard J. Am. Chem. Soc. 1996 118 3345 3353
18. J. A. Losonczi J. H. Prestegard Biochemistry 1998 37 706 716
19. C. R. Sanders G. C. Landis J. Am. Chem. Soc. 1994 116 6470 6471
20. T. L. Lin C. C. Liu M. F. Roberts S. H. Chen J. Phys. Chem. 1991 95 6020 6027
21. R. R. Vold R. S. Prosser J. Magn. Reson., Ser. B 1996 113 267 271
22. K. J. Glover J. A. Whiles G. F. Wu N. J. Yu R. Deems J. O. Struppe R. E. Stark E. A. Komives R. R. Vold Biophys. J. 2001 81 2163 2171
23. P. A. Luchette T. N. Vetman R. S. Prosser R. E. W. Hancock M. P. Nieh C. J. Glinka S. Krueger J. Katsaras Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2001 1513 83 94
24. L. van Dam G. Karlsson K. Edwards Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2004 1664 241 256
25. C. R. Sanders J. P. Schwonek Biochemistry 1992 31 8898 8905
26. C. R. Sanders Biophys. J. 1993 64 171 181
27. A. Arnold T. Labrot R. Oda E. J. Dufourc Biophys. J. 2002 83 2667 2680
28. C. Loudet S. Manet S. Gineste R. Oda M. F. Achard E. J. Dufourc Biophys. J. 2007 92 3949 3959
29. B. J. Forrest L. W. Reeves Chem. Rev. 1981 81 1 14
30. P. Ram J. H. Prestegard Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 1988 940 289 294
31. J. H. Davis Biochemistry 1988 27 428 436
32. N. Tjandra A. Bax Science 1997 278 1111 1114
33. A. Bax N. Tjandra J. Biomol. NMR 1997 10 289 292
34. A. Diller C. Loudet F. Aussenac G. Raffard S. Fournier M. Laguerre A. Grélard S. J. Opella F. M. Marassi E. J. Dufourc Biochimie 2009 91 744 751
35. R. R. Vold R. S. Prosser A. J. Deese J. Biomol. NMR 1997 9 329 335
36. E. Bárány-Wallje A. Andersson A. Gräslund L. Mäler FEBS Lett. 2004 567 265 269
37. M. Lindberg H. Biverståhl A. Gräslund L. Mäler Eur. J. Biochem. 2003 270 3055 3063
38. L. Mäler A. Gräslund Methods Mol. Biol. 2009 480 129 139
39. I. Marcotte E. J. Dufourc M. Ouellet M. Auger Biophys. J. 2003 85 328 339
40. N. Matsumori A. Morooka M. Murata J. Med. Chem. 2006 49 3501 3508
41. J. Villalaín Eur. J. Biochem. 1996 241 586 593
42. M. S. Al-Abdul-Wahid C. Neale R. Pomès R. S. Prosser J. Am. Chem. Soc. 2009 131 6452 6459
43. J. A. Losonczi E. T. Olejniczak S. F. Betz J. E. Harlan J. Mack S. W. Fesik Biochemistry 2000 39 11024 11033
44. C. Hilty G. Wider C. Fernandez K. Wuthrich ChemBioChem 2004 5 467 473
45. S. E. Feller C. A. Brown D. T. Nizza K. Gawrisch Biophys. J. 2002 82 1396 1404
46. D. Huster K. Gawrisch J. Am. Chem. Soc. 1999 121 1992 1993
47. F. Evanics R. S. Prosser Anal. Chim. Acta 2005 534 21 29
48. K. Gawrisch H. C. Gaede M. Mihailescu S. H. White Eur. Biophys. J. 2007 36 281 291
49. J. A. Whiles R. Brasseur K. J. Glover G. Melacini E. A. Komives R. R. Vold Biophys. J. 2001 80 280 293
50. K. J. Glover J. A. Whiles M. J. Wood G. Melacini E. A. Komives R. R. Vold Biochemistry 2001 40 13137 13142
51. K. J. Glover J. A. Whiles R. R. Vold G. Melacini J. Biomol. NMR 2002 22 57 64
52. A. Andersson L. Mäler J. Biomol. NMR 2002 24 103 112
53. A. Andersson L. Mäler FEBS Lett. 2003 545 139 143
54. A. Andersson J. Almqvist F. Hagn L. Mäler Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2004 1661 18 25
55. A. Andersson H. Biverståhl J. Nordin J. Danielsson E. Lindahl L. Mäler Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2007 1768 115 121
56. H. Biverståhl J. Lind A. Bodor L. Mäler Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2009 1788 1976 1986
57. W. Zhang S. O. Smith Biochemistry 2005 44 10110 10118
58. J. Dittmer L. Thøgersen J. Underhaug K. Bertelsen T. Vosegaard J. M. Pedersen B. Schiøtt E. Tajkhorshid T. Skrydstrup N. C. Nielsen J. Phys. Chem. B 2009 113 6928 6937
59. I. Marcotte F. Separovic M. Auger S. M. Gagné Biophys. J. 2004 86 1587 1600
60. A. Gayen C. Mukhopadhyay Langmuir 2008 24 5422 5432
61. J. Guo S. Pavlopoulos X. Tian D. Lu S. P. Nikas D. P. Yang A. Makriyannis J. Med. Chem. 2003 46 4838 4846
62. J. F. Wang J. R. Schnell J. J. Chou Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004 324 212 217
63. N. Matsumori A. Morooka M. Murata J. Am. Chem. Soc. 2007 129 14989 14995
64. T. Houdai N. Matsumori M. Murata Org. Lett. 2008 10 4191 4194
65. J. P. Montenez F. Van Bambeke J. Piret R. Brasseur P. M. Tulkens M. P. Mingeot-Leclercq Toxicol. Appl. Pharmacol. 1999 156 129 140
66. M. J. Reasor S. Kacew Exp. Biol. Med. 2001 226 825 830
67. D. R. Harris S. G. McGeachin H. H. Mills Tetrahedron Lett. 1965 6 679 685
68. M. Hong K. Schmidt-Rohr H. Zimmermann Biochemistry 1996 35 8335 8341
69. K. S. Bruzik J. S. Harwood J. Am. Chem. Soc. 1997 119 6629 6637
70. Y. Miyazaki M. Shibuya H. Sugawara O. Kawaguchi C. Hirose J. Nagatsu S. Esumi J. Antibiot. 1974 28 814 821
71. M. Dobler, Ionophores and Their Structures, John Wiley & Sons: New York, 1981
72. S. Mronga G. Mueller J. Fischer F. Riddell J. Am. Chem. Soc. 1993 115 8414 8420
73. E. F. Paulus M. Kurz H. Matter L. Vértesy J. Am. Chem. Soc. 1998 120 8209 8221
74. F. G. Riddell Chirality 2002 14 121 125
75. M. Satake M. Murata T. Yasumoto T. Fujita H. Naoki J. Am. Chem. Soc. 1991 113 9859 9861
76. G. K. Paul N. Matsumori M. Murata K. Tachibana Tetrahedron Lett. 1995 36 6279 6283
77. G. K. Paul N. Matsumori K. Konoki M. Murata K. Tachibana J. Mar. Biotechnol. 1997 5 124 128
78. M. Murata S. Matsuoka N. Matsumori G. K. Paul K. Tachibana J. Am. Chem. Soc. 1999 121 870 871
79. N. Morsy S. Matsuoka T. Houdai N. Matsumori S. Adachi M. Murata T. Iwashita T. Fujita Tetrahedron 2005 61 8606 8610
80. N. Morsy T. Houdai S. Matsuoka N. Matsumori S. Adachi T. Oishi M. Murata T. Iwashita T. Fujita Bioorg. Med. Chem. 2006 14 6548 6554
81. Y. Doi M. Ishibashi H. Nakamichi T. Kosaka T. Ishikawa J. Kobayashi J. Org. Chem. 1997 62 3820 3823
82. X. C. Huang D. Zhao Y. W. Guo H. M. Wu E. Trivellone Tetrahedron Lett. 2004 45 5501 5504
83. K. Washida T. Koyama K. Yamda M. Kita D. Uemura Tetrahedron Lett. 2006 47 2521 2525
84. T. Houdai S. Matsuoka N. Matsumori M. Murata Biochim. Biophys. Acta 2004 14 5677 5680
85. T. Houdai S. Matsuoka N. Morsy N. Matsumori M. Satake M. Murata Tetrahedron 2005 61 2795 2802
86. N. Morsy T. Houdai K. Konoki N. Matsumori T. Oishi M. Murata Bioorg. Med. Chem. 2008 16 3084 3090
87. T. Oishi M. Kanemoto R. Swasono N. Matsumori M. Murata Org. Lett. 2008 10 5203 5206
88. D. Allende S. A. Simon T. J. McIntosh Biophys. J. 2005 88 1828 1837
89. D. Lingwood K. Simons Science 2010 327 46 50