Degradation of chitosans with a family 46 chitosanase from streptomyces coelicolor A3(2)

Biomacromolecules

Volumn 11, Issue 9, 2010, Pages 2487-2497

  Heggset, Ellinor B ^a   Dybvik, Anette I ^a   Hoell, Ingunn A ^b   Norberg, Anne Line ^b   Sørlie, Morten ^b   Eijsink, Vincent G H ^b   Vårum, Kjell M ^a  

^a NORWEGIAN UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY   (Norway)

^b NORWEGIAN UNIVERSITY OF LIFE SCIENCES   (Norway)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACETYLATED CHITOSAN; CHITOOLIGOSACCHARIDES; CHITOSANASE; DEACETYLATED CHITOSANS; DEGREES OF ACETYLATION; DOMINANT PRODUCT; GLYCOSIDIC LINKAGES; HIGHER-DEGREE; KINETIC PHASE; MAXIMUM DEGREE; MODE OF ACTION; SECOND PHASE; STREPTOMYCES COELICOLOR A3(2); SUBSITES; TETRAMERS;

ACETYLATION; CHITIN; CHITOSAN; DEGRADATION; DIAGNOSTIC PRODUCTS; DIMERS; HYDROGELS; MULTILAYERS; SUBSTRATES;

BIOLOGICAL MEMBRANES;

CHITOSAN; CHITOSANASE; DIMER; OLIGOMER; OLIGOSACCHARIDE; PROTEIN SCCSN46A; TETRAMER; UNCLASSIFIED DRUG;

ACETYLATION; ARTICLE; BACTERIAL STRAIN; DEGRADATION; ENZYME ACTIVITY; KINETICS; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; REACTION ANALYSIS; STREPTOMYCES COELICOLOR;

ACETYLATION; BIOCOMPATIBLE MATERIALS; CHITINASE; CHITOSAN; CHROMATOGRAPHY, GEL; DNA, BACTERIAL; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; OLIGOSACCHARIDES; RECOMBINANT PROTEINS; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION; STREPTOMYCES COELICOLOR;

STREPTOMYCES COELICOLOR;

EID: 77956512257     PISSN: 15257797     EISSN: 15264602     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bm1006745     Document Type: Article

References (39)

1. Vårum, K. M.; Smidsrød, O. Structure-Property Relationship in Chitosans. In Polysaccharides: Structural Diversity and Functional Versatility; Dumitriu, S., Ed.; Marcel Dekker: New York, 2005; pp 625-642.
2. Aam, B. B.; Heggset, E. B.; Norberg, A. L.; Sørlie, M.; Vårum, K. M.; Eijsink, V. G. Marine Drugs 2010, 8, 1482-1517
3. Kurita, K.; Sannan, T.; Iwakura, Y. Macromol. Chem. 1977, 178, 3197-3202
4. Vårum, K. M.; Anthonsen, M. W.; Grasdalen, H.; Smidsrød, O. Carbohydr. Res. 1991, 217, 19-27
5. Vårum, K. M.; Anthonsen, M. W.; Grasdalen, H.; Smidsrød, O. Carbohydr. Res. 1991, 211, 17-23
6. Fukamizo, T.; Ohkawa, T.; Ikeda, Y.; Goto, S. Biochim. Biophys. Acta 1994, 1205, 183-188
7. Cantarel, B. L.; Coutinho, P. M.; Rancurel, C.; Bernard, T.; Lombard, V.; Henrissat, B. Nucleic Acids Res. 2009, 37, D233-D238
8. Bentley, S. D.; Chater, K. F.; Cerdeno-Tarraga, A. M.; Challis, G. L.; Thomson, N. R.; James, K. D.; Harris, D. E.; Quail, M. A.; Kieser, H.; Harper, D.; Bateman, A.; Brown, S.; Chandra, G.; Chen, C. W.; Collins, M.; Cronin, A.; Fraser, A.; Goble, A.; Hidalgo, J.; Hornsby, T.; Howarth, S.; Huang, C. H.; Kieser, T.; Larke, L.; Murphy, L.; Oliver, K.; ONeil, S.; Rabbinowitsch, E.; Rajandream, M. A.; Rutherford, K.; Rutter, S.; Seeger, K.; Saunders, D.; Sharp, S.; Squares, R.; Squares, S.; Taylor, K.; Warren, T.; Wietzorrek, A.; Woodward, J.; Barrell, B. G.; Parkhill, J.; Hopwood, D. A. Nature 2002, 417, 141-147
9. Kawase, T.; Yokokawa, S.; Saito, A.; Fujii, T.; Nikaidou, N.; Miyashita, K.; Watanabe, T. Biosci. Biotechnol. Biochem. 2006, 70, 988-998
10. Davies, G.; Henrissat, B. Structure 1995, 3, 853-859
11. Iseli, B.; Armand, S.; Boller, T.; Neuhaus, J. M.; Henrissat, B. FEBS Lett. 1996, 382, 186-8
12. Tews, I.; vanScheltinga, A. C. T.; Perrakis, A.; Wilson, K. S.; Dijkstra, B. W. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7954-7959
13. Lacombe-Harvey, M. E.; Fukamizo, T.; Gagnon, J.; Ghinet, M. G.; Dennhart, N.; Letzel, T.; Brzezinski, R. FEBS J. 2009, 276, 857-869
14. Monzingo, A. F.; Marcotte, E. M.; Hart, P. J.; Robertus, J. D. Nat. Struct. Biol. 1996, 3, 133-140
15. Eijsink, V. G.; Vaaje-Kolstad, G.; Vårum, K. M.; Horn, S. J. Trends Biotechnol. 2008, 26, 228-235
16. Horn, S. J.; Sikorski, P.; Cederkvist, J. B.; Vaaje-Kolstad, G.; Sørlie, M.; Synstad, B.; Vriend, G.; Vårum, K. M.; Eijsink, V. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 18089-18094
17. Horn, S. J.; Sørbotten, A.; Synstad, B.; Sikorski, P.; Sørlie, M.; Vårum, K. M.; Eijsink, V. G. FEBS J. 2006, 273, 491-503
18. Sikorski, P.; Sørbotten, A.; Horn, S. J.; Eijsink, V. G.; Vårum, K. M. Biochemistry 2006, 45, 9566-9574
19. Sikorski, P.; Stokke, B. T.; Sørbotten, A.; Vårum, K. M.; Horn, S. J.; Eijsink, V. G. Biopolymers 2005, 77, 273-85
20. Sørbotten, A.; Horn, S. J.; Eijsink, V. G.; Vårum, K. M. FEBS J. 2005, 272, 538-549
21. Heggset, E. B.; Hoell, I. A.; Kristoffersen, M.; Eijsink, V. G. H.; Vårum, K. M. Biomacromolecules 2009, 10, 892-899
22. Boucher, I.; Dupuy, A.; Vidal, P.; Neugebauer, W. A.; Brzezinski, R. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1992, 38, 188-193
23. Boucher, I.; Fukamizo, T.; Honda, Y.; Willick, G. E.; Neugebauer, W. A.; Brzezinski, R. J. Biol. Chem. 1995, 270, 31077-31082
24. Fukamizo, T.; Honda, Y.; Goto, S.; Boucher, I.; Brzezinski, R. Biochem. J. 1995, 311 (2) 377-383
25. Marcotte, E. M.; Monzingo, A. F.; Ernst, S. R.; Brzezinski, R.; Robertus, J. D. Nat. Struct. Biol. 1996, 3, 155-162
26. Hackman, R. H. Aust. J. Biol. Sci. 1954, 7, 168-178
27. Sannan, T.; Kurita, K.; Iwakura, Y. Macromol. Chem. 1976, 177, 3589-3600
28. Bradford, M. M. Anal. Biochem. 1976, 72, 248-254
29. Vårum, K. M.; Holme, H. K.; Izume, M.; Stokke, B. T.; Smidsrød, O. Biochim. Biophys. Acta 1996, 1291, 5-15
30. Bahrke, S.; Einarsson, J. M.; Gislason, J.; Haebel, S.; Letzel, M. C.; Peter-Katalinic, J.; Peter, M. G. Biomacromolecules 2002, 3, 696-704
31. Domon, B.; Costello, C. E. Glycoconjugate J. 1988, 5, 397-409
32. Cederkvist, F. H.; Parmer, M. P.; Vårum, K. M.; Eijsink, V. G. H.; Sørlie, M. Carbohydr. Polym. 2008, 74, 41-49
33. Haebel, S.; Bahrke, S.; Peters, M. G. Anal. Chem. 2007, 79, 5557-5566
34. Zakariassen, H.; Aam, B. B.; Horn, S. J.; Vårum, K. M.; Sørlie, M.; Eijsink, V. G. J. Biol. Chem. 2009, 284, 10610-10617
35. Einbu, A.; Grasdalen, H.; Vårum, K. M. Carbohydr. Res. 2007, 342, 1055-1062
36. Einbu, A.; Vårum, K. M. Biomacromolecules 2008, 9, 1870-1875
37. Vårum, K. M.; Ottøy, M. H.; Smidsrød, O. Carbohydr. Polym. 2001, 46, 89-98
38. Berth, G.; Dautzenberg, H. Carbohydr. Polym. 2002, 47, 39-51
39. Ishiguro, K.; Yoshie, N.; Sakurai, M.; Inoue, Y. Carbohydr. Res. 1992, 237, 333-338