Experimental and theoretical studies on corals. I. Toward understanding the origin of color in precious red corals from Raman and IR spectroscopies and DFT calculations

Journal of Raman Spectroscopy

Volumn 41, Issue 6, 2010, Pages 651-658

  Kupka, Teobald ^a   Lin, Hong Ming ^b   Stobiński, Leszek ^c,d   Chen, Cheng Han ^b   Liou, Wei Jen ^b   Wrzalik, Roman ^e   Flisak, Zygmunt ^a  

^a UNIVERSITY OF OPOLE   (Poland)

^b Tatung Company   (Taiwan)

^c INSTITUTE OF PHYSICAL CHEMISTRY   (Poland)

^d WARSAW UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Poland)

^e UNIVERSITY OF SILESIA   (Poland)

Author keywords

Carbon carbon double bond; Coral; DFT calculations; Polyenes; Raman and IR spectroscopies

Indexed keywords

CARBON; CAROTENOIDS; COLOR; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; ORGANIC COMPOUNDS;

B3LYP DFT; C-C BONDS; CARBON-CARBON DOUBLE BONDS; CORAL; DFT CALCULATION; IR-SPECTROSCOPY; POLYENE; RAMAN SIGNAL; RED CORAL; THEORETICAL STUDY;

RAMAN SPECTROSCOPY;

EID: 77954045091     PISSN: 03770486     EISSN: 10974555     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jrs.2502     Document Type: Article

References (63)

1. G. D. Stanley, Earth Sci. Rev. 2003, 60, 195.
2. G. D. Stanley Jr., C. A. McRoberts, Can. J. Earth Sci. 1993, 30, 819.
3. M. Enders, Arch. Naturgesch. 1932, 1, 646.
4. J. Stolarski, A. Meibom, R. Przeniosło, M. Mazur, Science 2007, 318, 92.
5. A. Patel, F. Honnart, G. Guillemin, J. L. Patat, Chirurgie Memoiresl Acad. Chirurgie 1980, 106, 199.
6. C. F. Dai, in R. W. Grigg, C. Birkeland (Eds.), Status of Coral Reefs in the Pacific, University of Hawaii: Honolulu, 1997, p 123.
7. R. W. Grigg, Mar. Ecol. 1984, 5, 57.
8. R. W. Grigg, Mar. Fish. Rev. 2002, 64, 13.
9. R. W. Grigg, Pac. Sci. 2001, 55, 199.
10. Y.-C. Wu, T.-M. Lee, K.-H. Chiu, S.-Y. Shaw, C.-Y. Yang, J. Mater. Sci. Mater. Med. 2009, DOI 10.1007/s10856-009-3695-3.
11. G. Guillemin, J.-L. Patat, J. Fournie, M. Chetail, J. Biomed. Mater. Res. 1986, 21, 557.
12. S. Lindskog, Pharmacol. Ther. 1997, 74, 1.
13. R. G. Waller, A. R. Baco, Bull. Mar. Sci. 2007, 81, 533.
14. C. P. Smith, S. F. McClure, S. Eaton-Magana, D. M. Kondo, Gems Gemol. 2007, 43, 4.
15. S. M. Holl, J. Schaefer, W. M. Goldberg, K. J. Kramer, T. D. Morgan, T. L. Hopkins, Arch. Biochem. Biophys. 1992, 292, 107.
16. B. A. Juarez-de la Rosa, P.-L. Ardisson, J. A. Azamar-Barrios, P. Quintana, J. J. Alvarado-Gil, Mater. Sci Eng. 2007, C27, 880.
17. G. C. Su, S. Zhang, S.-H. Qi, Chin. Tradit. Herb. Drugs 2008, 39, 1606.
18. V. Rolandi, A. Brajkovic, I. Adamo, Aust. Gemmol. 2005, 22, 285.
19. F. Luwei, Y. Mingxing, J. China Univ. Geosci. 2008, 19, 146.
20. S. Karampelas, E. Fritsch, J. Y. Mevellec, J.-P. Gauthier, S. Sklavounos, T. Soldatos, J. Raman Spectrosc. 2007, 38, 217.
21. E. Fritsch, S. Karampelas, Mar. Biol. 2008, 154, 929.
22. S. Karampelas, E. Fritsch, Gems Gemol. 2007, 43, 95.
23. B. Kaczorowska, A. Hacura, T. Kupka, R. Wrzalik, E. Talik, G. Pasterny, A. Matuszewska, Anal. Bioanal. Chem. 2003, 377, 1032.
24. E. J. Hochberg, A. M. Apprill, M. J. Atkinson, R. R. Bidigare, Coral Reefs 2006, 25, 99.
25. S. G. Dove, O. Hoegh-Guldberg, S. Ranganathan, Coral reefs 2001, 19, 197.
26. I. Ambarsari, B. E. Brown, R. G. Barlow, G. Britton, D. Cummings, Mar. Ecol. Prog. Ser. 1997, 159, 303.
27. J. C. Merlin, M. L. Delé-Dubois, Comp. Biochem. Physiol. Part B: Biochem. Physiol. 1986, 84, 97.
28. J. C. Merlin, Pure Appl. Chem. 1985, 57, 785.
29. J. Cvejic, S. Tambutté, S. Lotto, M. Mikov, I. Slacanin, D. Allemand, Mar. Biol. 2007, 152, 885.
30. W. P. Griffith, Nature 1969, 224, 264.
31. S. Gunasekaran, G. Anbalagan, S. Pandi, J. Raman Spectrosc. 2006, 37, 892.
32. S. Gunasekaran, G. Anbalagan, J. Raman Spectrosc. 2007, 38, 846.
33. S. Gunasekaran, G. Anbalagan, Spectrochim. Acta Part A Mol. Biomol. Spectrosc. 2007, 68, 656.
34. S. Gunasekaran, G. Anbalagan, Spectrochim. Acta. Part A. Mol. Biomol. Spectrosc. 2008, 69, 1246.
35. A. G. Xyla, P. G. Koutsoukos, J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1989, 185, 3165.
36. D. Krishnamurti, Proc. Ind. Acad. Sci., A 1960, LI, 285.
37. S. Karampelas, E. Fritsch, J.-Y. Mevellec, S. Sklavounos, T. Soldatos, Eur. J. Mineral. 2009, 21, 85.
38. S. N. White, Chem. Geol. 2009, 259, 240.
39. C. G. Kontoyannis, N. V. Vagenas, Analyst 2000, 125, 251.
40. M. Veronelli, G. Zerbi, R. Stradi, J. Raman Spectrosc. 1995, 26, 683.
41. A. L. Soldati, D. E. Jacob, U. Wehrmeister, T. Hager, W. Hofmeister, J. Raman Spectrosc. 2008, 39, 525.
42. V. Schettino, F. L. Gervasio, G. Cardini, P. R. Salvi, J. Chem. Phys. 1999, 110, 3241.
43. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. Montgomery, J. A. T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian 03, Revision E01, Gaussian, Inc:Wallingford, 2004.
44. J. B. Foresman, A. Frisch, Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods, Gaussian Inc: Pittsburgh, 1996.
45. T. H. Dunning Jr., J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007.
46. A. Wilson, T. van Mourik, T. H. Dunning Jr., J. Mol. Struct. (Theochem) 1997, 388, 339.
47. T. Kupka, B. Ruscic, R. E. Botto, J. Phys. Chem. A 2002, 106, 10396.
48. T. Kupka, C. Lim, J. Phys. Chem. A 2007, 111, 1927.
49. T. Helgaker, W. Klopper, H. Koch, J. Noga, J. Chem. Phys. 1997, 106, 9639.
50. D. Feller, J. Chem. Phys. 1992, 96, 6104.
51. H. A. Bullen, S. A. Oehrle, A. F. Bennett, N. M. Taylor, H. A. Barton, Appl. Environ. Microbiol. 2008, 74, 4553.
52. J. Urmos, S. K. Sharma, F. T. Mackenzie, Am. Mineral. 1991, 76, 641.
53. C. Hedegaard, J.-F. Bardeau, D. Chateigner, J. Molluscan Stud. 2006, 72, 157.
54. F. Z. Zakaria, J. Mihály, I. Sajó, R. Katona, L. Hajba, F. A. Aziz, J. Mink, J. Raman Spectrosc. 2008, 39, 1204.
55. A. P. Scott, L. Radom, J. Phys. Chem. 1996, 100, 16502.
56. K. L. Bak, J. Gauss, P. Jorgensen, J. Olsen, T. Helgaker, J. F. Stanton, J. Chem. Phys. 2001, 114, 6548.
57. G. Herzberg, Molecular Spectra and Molecular Structure, Van Nostrand: Princeton, 1945.
58. B. Blicharska, T. Kupka, J. Mol. Struct. 2002, 613, 153.
59. H. E. Schaffer, R. R. Chance, R. J. Silbey, K. Knoll, R. R. Schrock, J. Chem. Phys. 1991, 94, 1461.
60. M. A. Schen, J. C. W. Chien, E. Perrin, S. Lefrant, E. Mulazzi, J. Chem. Phys. 1988, 89, 7615.
61. J. S. Ceballos-Ruano, T. Kupka, D. W. Nicoll, J. W. Benson, M. A. Ioannidis, C. Hansson, M. M. Pintar, J. Appl. Phys. 2002, 91, 6588.
62. V. Vongsavat, P. Winotai, S. Meejoo, Nucl. Instrum. Methods Phys. Res. B 2006, 243, 167.
63. S. Gunasekaran, G. Anbalagan, Spectrochim. Acta Part A 2008, 69, 383.