Trans-bilayer ion conduction by proline containing cyclic hexapeptides and effects of amino acid substitutions on ion conducting properties

Bulletin of the Chemical Society of Japan

Volumn 83, Issue 6, 2010, Pages 683-688

  Taira, Junichi ^a,b   Osada, Satoshi ^a   Hayashi, Ryo ^a   Ueda, Toshihisa ^a   Jelokhani Niaraki, Masoud ^c   Aoyagi, Haruhiko ^d   Kodama, Hiroaki ^a  

^a SAGA UNIVERSITY   (Japan)

^b KURUME UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (Japan)

^c WILFRID LAURIER UNIVERSITY   (Canada)

^d KYUSHU NUTRITION WELFARE UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACID SUBSTITUTION; AMINO GROUP; BI-LAYER; CONFORMATIONAL CHANGE; CYCLIC PEPTIDES; EFFECTS OF AMINO ACIDS; HEXAPEPTIDES; ION CHANNEL; ION CONDUCTANCE; ION CONDUCTING PROPERTIES; ION CONDUCTION; ION-CONDUCTING; PROTECTING GROUP; SINGLE STATE; TUBE-LIKE; TURN STRUCTURE;

AMINO ACIDS; IONS; ORGANIC ACIDS;

PEPTIDES;

EID: 77953581012     PISSN: 00092673     EISSN: 13480634     Source Type: Journal    
DOI: 10.1246/bcsj.20090272     Document Type: Article

References (40)

1. M. S. Sansom, Prog. Biophys. Mol. Biol. 1991, 55, 139.
2. L. Whitmore, J. K. Chugh, C. F. Snook, B. A. Wallace, J. Pept. Sci. 2003, 9, 663.
3. G.A.Woolley, B. A.Wallace, J. Membr. Biol. 1992, 129, 109.
4. G. Baumann, P. Mueller, J. Supramol. Struct. 1974, 2, 538.
5. Mathew M.K., P. Balaram, Mol. Cell. Biochem. 1983, 50, 47.
6. J. D. Lear, Z. R. Wasserman, W. F. DeGrado, Science 1988, 240, 1177.
7. T. Iwata, S. Lee, O. Oishi, H. Aoyagi, M. Ohno, K. Anzai, Y. Kirino, G. Sugihara, J. Biol. Chem. 1994, 269, 4928.
8. Y. Higashimoto, H. Kodama, M. Jelokhani-Niaraki, F. Kato, M. Kondo, J. Biochem. 1999, 125, 705.
9. T. Hara, H. Kodama, Y. Higashimoto, H. Yamaguchi, M. Jelokhani-Niaraki, T. Ehara, M. Kondo, J. Biochem. 2001, 130, 749.
10. F. Heitz, R. Jacquier, F. Kaddari, J. Verducchi, Biophys. Chem. 1986, 23, 245.
11. F. Heitz, F. Kaddari, N. V. Mau, J. Verducchi, H. R. Seheno, R. Lazaro, Biochimie 1989, 71, 71.
12. F. Heitz, F. Kaddari, A. Heitz, H. Raniriseheno, R. Lazaro, Int. J. Pept. Protein Res. 1989, 34, 387.
13. D. T. Bong, T. D. Clark, J. R. Granja, M. R. Ghadiri, Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 988.
14. J. D. Hartgerink, T. D. Clark, M. R. Ghadiri, Chem. Eur. J. 1998, 4, 1367.
15. S. Fernandez-Lopez, H.-S. Kim, E. C. Choi, M. Delgado, J. R. Granja, A. Khasanov, K. Kraehenbuehl, G. Long, D. A. Weinberger, K. M. Wilcoxen, M. R. Ghadiri, Nature 2001, 412, 452.
16. V. Dartois, J. Sanchez-Quesada, E. Cabezas, E. Chi, C. Dubbelde, C. Dunn, J. Granja, C. Gritzen, D. Weinberger, M. R. Ghadiri, T. R. Parr, Jr., Antimicrob. Agents Chemother. 2005, 49, 3302.
17. W. S. Horne, C. M. Wiethoff, C. Cui, K. M. Wilcoxen, M. Amorin, M. R. Ghadiri, G. R. Nemerow, Bioorg. Med. Chem. 2005, 13, 5145.
18. M. Yoshizaki, N. Nishino, J. Kuwahara, N. Nishino, T. Kato, Proc. 4th IPS-7th PEM, 2nd APIPS, 2007, 1.
19. T. Hirata, F. Fujimura, Y. Horikawa, J. Sugiyama, T. Morita, S. Kimura, Pept. Sci. 2007, 88, 150.
20. E. J. Prenner, M. Kiricsi, M. Jelokhani-Niaraki, R. N. A. H. Lewis, R. S. Hodges, R. N. McElhaney, J. Biol. Chem. 2005, 280, 2002.
21. N. E. Zhou, C. M. Kay, R. S. Hodges, J. Biol. Chem. 1992, 267, 2664.
22. J. Wang, S. Osada, H. Kodama, T. Kato, M. Kondo, Bull. Chem. Soc. Jpn. 1999, 72, 533.
23. C. A. Bush, S. K. Sarkar, K. D. Kopple, Biochemistry 1978, 17, 4951.
24. L. M. Gierasch, C. M. Deber, V. Madison, C.-H. Niu, E. R. Blout, Biochemistry 1981, 20, 4730.
25. J. Wang, S. Osada, H. Kodama, M. Kondo, Bull. Chem. Soc. Jpn. 2000, 73, 1221.
26. J. Ramesh, J. K. Ghosh, C. P. Swaminathan, P. Ramasamy, A. Surolia, S. R. Skidar, K. R. K. Easwaran, J. Pept. Res. 2003, 61, 63.
27. R. A. Robinson, R. H. Stokes, Electrolyte Solutions, 2nd ed., Butterworths, London, 1970.
28. P. Läuger, Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1985, 24, 905.
29. M. R. Ghadiri, J. R. Granja, L. K. Buehler, Nature 1994, 369, 301.
30. R. Benz, P. Läuger, J. Membr. Biol. 1976, 27, 171.
31. H. Okamoto, T. Nakanishi, Y. Nagai, M. Kasahara, K. Takeda, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 2756.
32. Md. Ashrafuzzaman, O. S. Andersen, R. N. McElhaney, Biochim. Biophys. Acta 2008, 1778, 2814.
33. G. Spach, H. Duclohier, G. Molle, J.-M. Valleton, Biochimie 1989, 71, 11.
34. A. M. Feigin, J. Y. Takemoto, R. Wangspa, J. H. Teeter, J. G. Brand, J. Membr. Biol. 1996, 149, 41.
35. H. Okamoto, K. Takeda, K. Shiraishi, Phys. Rev. B 2001, 64, 115425.
36. H. Takiguchi, H. Nishikawa, S. Ando, N. Izumiya, Bull. Chem. Soc. Jpn. 1978, 51, 297.
37. H. Yamaguchi, H. Kodama, S. Osada, M. Jelokhani- Niaraki, F. Kato, M. Kondo, Bull. Chem. Soc. Jpn. 2002, 75, 1563.
38. J. Taira, M. Jelokhani-Niaraki, S. Osada, F. Kato, H. Kodama, Biochemistry 2008, 47, 3705.
39. R. Coronado, R. Latorre, Biophys. J. 1983, 43, 231.
40. M. S. P. Sansom, Eur. Biophys. J. 1993, 22, 105.