Neoceratium gen. nov., a New Genus for All Marine Species Currently Assigned to Ceratium (Dinophyceae)

Protist

Volumn 161, Issue 1, 2010, Pages 35-54

  Gómez, Fernando ^a   Moreira, David ^b   López García, Purificación ^b  

^a Laboratoire d Océanographie Microbienne   (France)

^b UNIVERSITÉ PARIS SUD   (France)

Author keywords

alveolate evolution; Dinoflagellata; Neoceratium gen. nov.; new combination; resting cyst; SSU rDNA phylogeny

Indexed keywords

CERATIUM; CERATIUM CANDELABRUM; CERATIUM FURCA; CERATIUM HIRUNDINELLA; DINOPHYCEAE;

EID: 72549105493     PISSN: 14344610     EISSN: 16180941     Source Type: Journal    
DOI: 10.1016/j.protis.2009.06.004     Document Type: Article

References (86)

1. Auinger B.M., Pfandl K., and Boenigk J. Improved methodology for identification of protists and microalgae from plankton samples preserved in Lugol's iodine solution: combining microscopic analysis with single-cell PCR. Appl Environ Microbiol 74 (2008) 2505-2510
2. Balech E. El género Protoperidinium Bergh, 1881 (Peridinium Ehrenberg, 1831, partim). Revista del Museo Argentino de Ciencias Naturales "Bernardino Rivadavia" 4 (1974) 1-79
3. Balech E. On the thecal morphology of dinoflagellates with special emphasis on cingular and sulcal plates. Anales del Centro de Ciencias del Mar y Limnología de la Universidad Nacional Autónoma de México 7 (1980) 57-68
4. Balech E. Los dinoflagelados del Atlántico Sudoccidental (1988), Publ Espec Inst Español Oceanogr, Madrid
5. Bailey J.W. Notes on new species and localities of microscopical organisms. Smithsonian Contr Knowl 7 (1855) 16-31
6. Böhm A. Die adriatischen Ceratien. Bot Arch 31 (1931) 349-385
7. Bourrelly P. Notes sur les péridiniens d'eau douce. Protistologica 4 (1968) 5-14
8. Chun C. Aus den Tiefen des Weltmeeres (1900), Gustav Fischer, Jena
9. Claparède E., and Lachmann J. Études sur les infusoires et les rhizopodes. Mémoires de l′Institut National Genevois 6 (1859) 261-482
10. Cleve P.T. Plankton from the southern Atlantic and southern Indian Ocean. Öfvers Kungliga Vetenskaps-Akademiens Förhand 8 (1900) 919-938
11. Daday E von. Systematische Übersicht der Dinoflagellaten des Golfes von Neapel. Természetrajzi Füzetek 11 (1888) 98-104
12. Dodge J.D., and Crawford R.M. The morphology and fine structure of Ceratium hirundinella (Dinophyceae). J Phycol 6 (1970) 137-149
13. Duff R.J., Ball H., and Lavrentyev P.J. Application of combined morphological-molecular approaches to the identification of planktonic protists from environmental samples. J Eukaryot Microbiol 55 (2008) 306-312
14. Dujardin F. Histoire naturelle des zoophytes. Infusoires, comprenant la physiologie et la classification de ces animaux et la manière de les étudier à l′aide du microscope (1841), Libraire encyclopedique de Roret, Paris
15. Ehrenberg C.G. Dritter Beitrag zur Erkenntnis großer Organisation in der Richtung des kleinsten Raumes. Abhandlungen der Königlichen Akademie der Wissenschaften zu Berlin 1833 (1834) 145-336
16. Ehrenberg C.G. Das Leuchten des Meeres. Neue Beobachtungen nebst Übersicht der Hauptmomente der geschichtlichen Entwicklung dieses merkwürdigen Phänomens. Abhandlungen der Königlichen Akademie der Wissenschaften zu Berlin 1834 (1835) 411-575
17. Ehrenberg C.G. Die Infusionsthierchen als vollkommene Organismen (1838), Voss, Leipzig
18. Ehrenberg C.G. Charakteristik von 274 neuen Arten von Infusorien per Bekanntm. Bericht über die zur Bekanntmachung geeigneten Verhandlungen der Königlichen Preussischen Akademie der Wissenschaften zu Berlin 1840 (1840) 197-219
19. Ehrenberg C.G. Über die neuerlich bei Berlin vorgekommenen neuen Formen des mikroskopischen Lebens. Bericht über die zur Bekanntmachung geeigneten Verhandlungen der Königlichen Preussischen Akademie der Wissenschaften zu Berlin 1853 (1853) 183-194
20. Ehrenberg C.G. Mikrogeologie: Das Erden und Felsen schaffende Wirken des unsichtbar kleinen selbständigen Lebens auf der Erde (1854), Voss, Leipzig
21. Ehrenberg C.G. Die das Funkeln und Aufblitzen des Mittelmeers bewirkenden unsichtbar kleinen Lebensformen. Berichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin Festschrift (1873) 1-4
22. Edgar R.C. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Res 32 (2004) 1792-1797
23. Entz G. Beiträge zur Kenntnis der Peridineen. II. resp. VII. Studien an Süßwasser-Ceratien. (Morphologie, Variation, Biologie.). Arch Protistenkd 58 (1927) 344-440
24. Farr E.R., Leussink J.A., and Stafleu F.A. ndex Nominum Genericorum (Plantarum), 3 vols. Bohn, Scheltema and Holkana (1979), Junk Publishers, Utrecht, The Hague
25. Gómez F. Checklist of Mediterranean free-living dinoflagellates. Bot Mar 46 (2003) 215-242
26. Gómez F. A list of dinoflagellates in the world's oceans. Acta Bot Croat 64 (2005) 129-212
27. Gómez F., López-García P., and Moreira D. Molecular phylogeny of the ocelloid-bearing dinoflagellates Erythropsidinium and Warnowia (Warnowiaceae, Dinophyceae). J Eukaryot Microbiol 56 5 (2009) 10.1111/j.1550-7408.2009.00420.x
28. Gourret P. Sur les Péridiniens du Golfe de Marseille. Annales du Musée d'Histoire Naturelle de Marseille: Zoologie, Tome 1, Mém 8 (1883) 1-114
29. Graham H. Studies in the morphology, taxonomy, and ecology of the Peridiniales. Scient Res Cruise VII Carnegie 1928-1929, Biol ser 3 (1942) 1-129
30. Graham H., and Bronikovsky N. The genus Ceratium in the Pacific and North Atlantic oceans. Scient Res Cruise VII Carnegie 1928-1929, Biol ser 5 (1944) 1-209
31. Gran H.H. Das Plankton des Norwegischen Nordmeeres. Rep Norw Fish Mar Invest 2 5 (1902) 1-222
32. Halim Y. Microplankton des eaux Egyptiennes. Le genre Ceratium Schrank (Dinoflagellés). Rapp Comm int Mer Medit 17 (1963) 495-502
33. Hasle G.R., and Nordli E. Form variation in Ceratium fusus and tripos populations in cultures and from the sea. Avh Norske Videnskaps-Akademi i Oslo I. Mat Naturv Klasse 4 (1951) 1-25
34. Jacobson D.M. A brief history of dinoflagellate feeding research. J Eukaryot Microbiol 46 (1999) 376-381
35. Jeong H.J., Yeong D.Y., Seong K.A., Kim J.H., Park J.Y., Kim S., Lee S.H., Ha J.H., and Yih W.H. Feeding by the mixotrophic red-tide dinoflagellates Gonyaulax polygramma: mechanisms, prey species, effects of prey concentration, and grazing impact. Aquat Ecol Microb 38 (2005) 249-257
36. Jobb G., von Haeseler A., and Strimmer K. TREEFINDER: a powerful graphical analysis environment for molecular phylogenetics. BMC Evol Biol 4 (2004) 18
37. Jørgensen E. Die Ceratien. Eine kurze Monographie der Gattung Ceratium Schrank. Int Revue ges Hydrogr 4 (1911) 1-124
38. Jørgensen E (1920) Mediterranean Ceratia Report of the Danish oceanographic expedition to the Mediterranean. Vol 2 (Biol.) J. 1: 1-110
39. Karsten G. Das Phytoplankton des Atlantischen Ozeans. Wissenschaftliche Ergebnisse der deutschen Tiefsee-Expedition auf dem Dampfer Valdivia 1898-1899 2 (1906) 137-219
40. Karsten G. Das indische Phytoplankton. Wissenschaftliche Ergebnisse der deutschen Tiefsee-Expedition auf dem Dampfer Valdivia 1898-1899 2 (1907) 221-548
41. Kofoid C.A. The plates of Ceratium with a note on the unity of the genus. Zool Anz 32 (1907) 177-183
42. Kofoid C.A. Dinoflagellata of the San Diego region, III. Descriptions of new species. California Univ Publ Zool 3 (1907) 299-340
43. Kofoid C.A. Exuviation, autotomy and regeneration in Ceratium. Univ Calif Publ Zool 4 (1908) 345-386
44. Kofoid C.A. Mutations in Ceratium. Bull Mus Comp Zool Harvard Coll 52 (1909) 213-257
45. Lartillot N., and Philippe H. A Bayesian mixture model for across-site heterogeneities in the amino-acid replacement process. Mol Biol Evol 21 (2004) 1095-1109
46. Lemmermann E. Beiträge zur Kenntnis der Planktonalgen. X. Ber Deutsch Bot Ges 18 (1900) 306-310
47. Lin S., Zhang H., Hou Y., Miranda L., and Bhattacharya D. Development of a dinoflagellate-oriented PCR primer set leads to detection of picoplanktonic dinoflagellates from Long Island Sound. Appl Environ Microbiol 72 (2006) 5626-5630
48. Loeblich Jr. A.R., and Loeblich III A.R. Index to the genera, subgenera, and the sections of the Pyrrhophyta. Stud Trop Oceanogr 3 (1966) 1-94
49. Logares R., Shalchian-Tabrizi K., Boltovskoy A., and Rengefors K. Extensive dinoflagellate phylogenies indicate infrequent marine-freshwater transitions. Mol Phylogen Evol 45 (2007) 887-903
50. López-García P., Rodríguez-Valera F., Pedrós-Alió C., and Moreira D. Unexpected diversity of small eukaryotes in deep-sea Antarctic plankton. Nature 409 (2001) 603-607
51. Meave del Castillo M.E., Zamudio M.E., Okolodkov Y.B., and Salgado I.H. Ceratium balechii sp. nov. (Dinophyceae: Gonyaulacales) del Pacífico Mexicano. Hidrobiológica 13 (2003) 75-91
52. Müller O.F. Animalcula Infusoria Fluviatilis et Marina (1786), Havniae et Lipsiae, Copenhagen
53. Nitzsch C.L. Beitrag zur Infusionenkunde oder Naturbeschreibung der Zerkarien und Bazillarien. Neue Schriften der Naturforschenden Gesellschaft zu Halle 3 (1817) 1-128
54. Ostenfeld C.H. Phytoplankton from the sea around the Faeröes. Botany of the Faeröes II (1903), Det Nordiske Forlag, Copenhagen 558-612
55. Ostenfeld C.H., and Schmidt J. Plankton fra det Røde Hav og Adenbugten. Videnskabelige Meddelser fra dansk Naturhistorisk Forening i Kjobenhaven 25 (1901) 141-182
56. Paulsen O. XVIII Peridiniales. In: Brandt K., and Apstein C. (Eds). Nordisches Plankton (1908), Linsius und Tischer, Kiel 1-124
57. Pavillard J. Recherches sur la flore pélagique de l′étang de Thau. Thèse doctor, Fac Sci Paris, Montpellier (1905) 1-116
58. e Note). Bull Soc Bot Fr 54 (1907) 225-231
59. Pavillard J. Recherches sur les péridiniens du Golfe du Lion. Trav Inst Bot Univ Montpellier et Stat. Zool Cette, Trav sér mixte, Mém 4 (1916) 1-73
60. er de Monaco. Bull Inst Océanogr Monaco 558 (1930) 1-12
61. Philippe H. MUST, a computer package of management utilities for sequences and trees. Nucleic Acids Res 21 (1993) 5264-5272
62. Popovski J., and Pfiester L.A. Dinophyceae (Dinoflagellida). In: Ettl H., Gärtner G., Gerloff J., Heynig H., and Mollenhauer D. (Eds). Süßwasserflora von Mitteleuropa. Band 6 (1990), Gustav Fischer Verlag, Stuttgart 88-218
63. Rampi L. Ricerche sul fitoplancton del Mare Ligure. 4. I Ceratium delle acque di San Remo (parte II). Nuovo G Bot Ital 49 (1942) 221-236
64. Saitou N., and Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol Biol Evol 4 (1987) 406-442
65. Saldarriaga J.F., Taylor F.J.R., Cavalier-Smith T., Menden-Deuer S., and Keeling P.J. Molecular data and the evolutionary history of dinoflagellates. Eur J Protistol 40 (2004) 85-111
66. Saunders G.W., Hill D.R., Sexton J.P., and Andersen R.A. Small-subunit ribosomal RNA sequences from selected Dinoflagellates: testing classical evolutionary hypotheses with molecular systematic methods. In: Bhattacharya D. (Ed). Origins of Algae and their Plastids (1997), Springer, Wien, New York 237-259
67. Schiller J (1937) Dinoflagellatae (Peridinineae) in monographischer Behandlung. In Rabenhorst L (ed) Kryptogamen-Flora von Deutschland, Österreichs und der Schweiz. Akad Verlag, Leipzig. Vol. 10 (3): Teil 2 (1-4), pp 1-589
68. Schrank F von Paula. Mikroskopische Wahrnehmungen. Der Naturforscher 27 (1793) 26-37
69. Schrank F von Paula, (1802) Favna Boica. Durchgedachte Geschichte der in Baiern einheimischen und zahmen Tiere. 2. Band, zweite Abteilung. W. Krüll, Ingolstadt
70. Schröder B. Das Phytoplankton des Golfes von Neapel. Mitteilungen aus der Zoologischen Station zu Neapel 14 (1900) 1-38
71. Schröder B. Beiträge zur Kenntnis des Phytoplanktons warmer Meere. Vierteljahrsschrift der Naturforschenden Gesellschaft in Zürich 51 (1906) 319-377
72. Schröder B. Phytoplankton von Westindien. Ber Deutsch Bot Ges 27 (1909) 210-214
73. Schütt F. Die Peridinien der Plankton-Expedition. Ergebnisse der Plankton-Expedition Humboldt-Stiftung 4 (1895) 1-170
74. Sournia A. Le genre Ceratium (Péridinien planctonique) dans le canal du Mozambique. Contribution à une révision mondiale. Vie et Milieu sér A 18 (1968) 375-499
75. Sournia A. Quatre nouveaux dinoflagellés du plancton marin. Phycologia 11 (1972) 71-74
76. Sournia A. Classification et nomenclature de divers dinoflagellés marins (Dinophyceae). Phycologia 23 (1984) 345-355
77. Sournia A. Atlas du Phytoplancton Marin. Introduction Cyanophycées, Dictyochophycées, Dinophycées et Raphidophycées (1986), Editions du CNRS, Paris
78. Steemann Nielsen E. Untersuchungen über die Verbreitung, Biologie und Variation der Ceratien im südlichen Stillen Ozean. Dana Report No. 4 (1934) 1-67
79. Steidinger K.A., and Williams J. Dinoflagellates. Mem Hourglass cruises, mar Res Lab, Florida Dept nat Res, St. Petersburg 2 (1970) 1-251
80. Steidinger K.A., and Tangen K. Dinoflagellates. In: Tomas C.R. (Ed). Identifying Marine Phytoplankton (1997), Academic Press, San Diego 387-584
81. Temponeras M., Kristiansen J., and Moustaka-Gouni M. A new Ceratium species (Dinophyceae) from Lake Doïrani, Macedonia Greece. Hydrobiologia 424 (2000) 101-108
82. Vanhöffen E. Das Genus Ceratium. Zool Anz 19 499 (1896) 133-134
83. Wall D., and Evitt W.R. A comparison of the modern genus Ceratium Schrank, 1793, with certain Cretaceous marine dinoflagellates. Micropaleontology 24 (1975) 14-44
84. Wetherbee R. The fine structure of Ceratium tripos, a marine armored dinoflagellate: I. The cell covering (theca). J Ultrastruct Res 50 (1975) 58-64
85. Wood E.J.F. Dinoflagellates in the Australian region. II. Recent collections. CSIRO, Aust Div Fish Oceanogr, Techn paper 14 (1963) 1-55
86. Zhang H., Bhattacharya D., and Lin S. Phylogeny of dinoflagellates based on mitochondrial cytochrome b and nuclear small subunit rDNA sequence comparisons. J Phycol 41 (2005) 411-420