Signature peptides of influenza nucleoprotein for the typing and subtyping of the virus by high resolution mass spectrometry

Analyst

Volumn 134, Issue 11, 2009, Pages 2253-2261

  Schwahn, Alexander B ^a   Wong, Jason W H ^b   Downard, Kevin M ^a  

^a UNIVERSITY OF SYDNEY   (Australia)

^b UNIVERSITY OF NEW SOUTH WALES   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

NUCLEOPROTEIN; VIRUS ANTIGEN; VIRUS PROTEIN;

ALGORITHM; AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; COMPUTER MODEL; INFLUENZA VIRUS; INFLUENZA VIRUS A H1N1; INFLUENZA VIRUS A H3N2; INFLUENZA VIRUS B; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR WEIGHT; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; SEQUENCE ALIGNMENT; VIRUS STRAIN; VIRUS TYPING;

EID: 72549092309     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b912234f     Document Type: Article

References (20)

1. World Health Organization, Fact Sheet No. 211, April 2009
2. F. Carrat A. Flahault Vaccine 2007 25 6852 6862
3. M. von Itzstein W. Y. Wu G. B. Kok M. S. Pegg J. C. Dyason B. Jin T. Van Phan M. L. Smythe H. F. White S. W. Oliver P. M. Colman J. N. Varghese D. M. Ryan J. M. Woods R. C. Bethell V. J. Hotham J. M. Cameron C. R. Penn Nature 1993 363 401 402
4. E. Garman G. Laver Curr. Drug Targets 2004 5 119 136
5. J. L. McKimm-Breschkin Treatments in Respiratory Medicine 2005 4 107 116
6. T. R. Maines X. H. Lu S. M. Erb L. Edwards J. Guarner P. W. Greer D. C. Nguyen K. J. Szretter L.-M. Chen P. Thawatsupha M. Chittaganpitch S. Waicharoen D. T. Nguyen T. Nguyen H. H. T. Nguyen J.-H. Kim L. T. Hoang C. Kang L. S. Phuong W. Lim S. Zaki R. O. Donis N. J. Cox J. M. Katz T. M. Tumpey J. Virol. 2005 79 11788 11800
7. R. J. Garten C. T. Davis C. A. Russell B. Shu S. Lindstrom A. Balish W. M. Sessions X. Xu E. Skepner V. Deyde M. Okomo-Adhiambo L. Gubareva J. Barnes C. B. Smith S. L. Emery M. J. Hillman P. Rivailler J. Smagala M. de Graaf D. F. Burke R. A. Fouchier C. Pappas C. M. Alpuche-Aranda H. López-Gatell H. Olivera I. López C. A. Myers D. Faix P. J. Blair C. Yu K. M. Keene P. D. Dotson Jr. D. Boxrud A. R. Sambol S. H. Abid K. St George T. Bannerman A. L. Moore D. J. Stringer P. Blevins G. J. Demmler-Harrison M. Ginsberg P. Kriner S. Waterman S. Smole H. F. Guevara E. A. Belongia P. A. Clark S. T. Beatrice R. Donis J. Katz L. Finelli C. B. Bridges M. Shaw D. B. Jernigan T. M. Uyeki D. J. Smith A. I. Klimov N. J. Cox Science 2009 325 197 201
8. K. E. Wright G. A. Wilson D. Novosad C. Dimock D. Tan J. M. Weber J. Clin. Microbiol. 1995 33 1180 1184
9. M. Petric L. Comanor C. A. Petti J. Infect. Dis. 2006 194 S98 S110
10. A. B. Schwahn J. W. H. Wong K. M. Downard Anal. Chem. 2009 81 3500 3506
11. J. G. Kiselar K. M. Downard Biochemistry 1999 38 14185 14191
12. B. Morrissey K. M. Downard Proteomics 2006 6 2034 2041
13. B. Morrissey M. Streamer K. M. Downard J. Virol. Methods 2007 145 106 114
14. Q. Ye R. M. Krug Y. J. Tao Nature 2006 444 1078 1082
15. C. Howson, P. Urbach, Scientific Reasoning: The Bayesian Approach, Open Court Publishing Company, Chicago, 2nd edn., 1993
16. Y. Bao P. Bolotov D. Dernovoy B. Kiryutin L. Zaslavsky T. Tatusova J. Ostell D. Lipman J. Virol. 2008 82 596 601
17. E. Ghedin N. A. Miller M. Shumway J. Zaborsky T. Feldblyum V. Subbu D. Spiro J. Sitz H. Koo P. Bolotov D. Dernovoy T. Tatusova Y. Bao K. St. George J. Taylor D. J. Lipman C. M. Fraser J. K. Taubenberger S. L. Salzberg Nature 2005 437 1162 1166
18. D. A. Benson I. Karsch-Mizrachi D. J. Lipman J. Ostell E. W. Sayers Nucleic Acids Res. 2008 36 D25 D30
19. J. D. Thompson D. G. Higgins T. J. Gibson Nucleic Acids Res. 1994 22 4673 4680
20. M. A. Larkin G. Blackshields N. P. Brown R. Chenna P. A. McGettigan H. McWilliam F. Valentin I. M. Wallace A. Wilm R. Lopez J. D. Thompson T. J. Gibson D. G. Higgins Bioinformatics 2007 23 2947 2948