Structural analysis of phosphatidyl choline lipids and glycerol precursors

Canadian Journal of Chemistry

Volumn 87, Issue 10, 2009, Pages 1261-1267

  Goursot, Annick ^a   Mineva, Tzonka ^a   Krishnamurty, Sailaja ^b   Salahub, Dennis R ^c  

^a UNIVERSITÉ DE MONTPELLIER   (France)

^b CENTRAL ELECTROCHEMICAL RESEARCH INSTITUTE   (India)

^c UNIVERSITY OF CALGARY   (Canada)

Author keywords

Conformational analysis; Density functional theory; DFT D; DLPC; DMPC; DPPC; Glycerol; Glycerol 3 phosphate; Phosphatidylcholines

Indexed keywords

CONFORMATIONAL ANALYSIS; DFT-D; DLPC; DMPC; DPPC; PHOSPHATIDYLCHOLINES;

CONFORMATIONS; ENZYMES; GLYCEROL; ISOMERS; MOLECULAR DYNAMICS; PHOSPHOLIPIDS; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; STRUCTURAL ANALYSIS;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EID: 70350662963     PISSN: 00084042     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1139/V09-056     Document Type: Article

References (30)

1. Fagone, P.; Jackowski, S. J. Lipid Res. 2008, 50 (Suppl.), S311-S316. doi:10.1194/jlr.R800049-JLR200.PMID:18952570.
2. Kennedy, E. P. J. Biol. Chem. 1953, 201, 399.
3. Thorner, J. W.; Paulus, H. J. Biol. Chem. 1973, 248, 3922.
4. Mao, C.; Ozer, Z.; Zhou, M.; Uckun, F. M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999, 259 (3), 640-644. doi:10.1006/bbrc.1999.0816.PMID:10364471.
5. Slabas, A. R.; Simon, W. R.; Schierer, T. P.; Kroon, J.; Fawcett, T.; Hayman, M.; Gilroy, J.; Nishida, I.; Murata, N.; Rafferty, J.; Turnbull, A.; Rice, D. Biochem. Soc. Trans. 2000, 28 (6), 677-679. doi:10.1042/BST0280677. PMID:11171167.
6. Slabas, A. R.; Kroon, J. T. M.; Scheirer, T. P.; Gilroy, J. S.; Hayman, M.; Rice, D. W.; Turnbull, A. P.; Rafferty, J. B.; Fawcett, T.; Simon, W. J. J. Biol. Chem. 2002, 277 (46), 43918-43923. doi:10.1074/jbc.M206429200. (Pubitemid 36157815)
7. Turnbull, A. P.; Rafferty, J. B.; Sedelnikova, S. E.; Slabas, A. R.; Schierer, T. P.; Kroon, J. T. M.; Simon, J. W.; Fawcett, T.; Nishida, I.; Murata, N.; Rice, D. W. Structure 2001, 9 (5), 347-353. doi:10.1016/S0969- 2126(01)00595-0.PMID:11377195.
8. Agarwal, A. K.; Sukumaran, S.; Bartz, R.; Barnes, R. I.; Garg, A. J. Endocrinology 2007, 193 (3), 445-457. doi:10.1677/JOE-07-0027. (Pubitemid 47028695)
9. Hauser, H.; Pascher, I.; Sundell, S. Biochemistry 1988, 27 (26), 9166-9174. doi:10.1021/bi00426a014.PMID:3242620.
10. Hong, M.; Schmidt-Rohr, K.; Zimmermann, H. Biochemistry 1996, 35 (25), 8335-8341. doi:10.1021/bi953083i. (Pubitemid 26234938)
11. Pearson, R. H.; Pascher, I. Nature 1979, 281 (5731), 499-501. doi:10.1038/281499a0.PMID:492310.
12. Pascher, I.; Sundell, S.; Harlos, K.; Eibl, H. Biochim. Biophys. Acta 1987, 896 (1), 77-88. doi:10.1016/0005-2736(87)90358-0.PMID:3790589.
13. Krishnamurty, S.; Stefanov, M.; Mineva, T.; Bégu, S.; Devoisselle, J. M.; Goursot, A.; Zhu, R.; Salahub, D. R. J. Phys. Chem. B 2008, 112 (42), 13433-13442. doi:10.1021/jp804934d.PMID:18817435.
14. Krishnamurty, S.; Stefanov, M.; Mineva, T.; Bégu, S.; Devoisselle, J. M.; Goursot, A.; Zhu, R.; Salahub, D. R. Chem-PhysChem 2008, 9 (16), 2321-2324. doi:10.1002/cphc.200800511.PMID:18924197.
15. Köster, A. M.; Calaminici, P.; Casida, M. E.; Flores-Moreno, R.; Geudtner, G.; Goursot, A.; Heine, T.; Ipatov, A.; Janetzko, F.; Martin Del Campo, J.; Patchkovskii, S.; Reveles, J. U.; Salahub, D. R.; Vela, A. The deMon developers; Cinvestav, Mexico. 2006.
16. Zhang, Y.; Yang, W. Phys. Rev. Lett. 1998, 80 (4), 890. doi:10.1103/PhysRevLett.80.890.
17. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B Condens. Matter Mater. Phys. 1988, 37, 785.
18. Zhang, Y.; Yang, W. Phys. Rev. Lett. 1998, 80 (4), 890. doi:10.1103/PhysRevLett.80.890.
19. Goursot, A.; Mineva, T.; Kevorkyants, R.; Talbi, D. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3 (3), 755-763. doi:10.1021/ct600373f.
20. Godbout, N.; Salahub, D. R.; Andzelm, J.; Wimmer, E. Can. J. Chem. 1992, 70 (2), 560-571. doi:10.1139/v92-079.
21. Köster, A. M.; Flores-Moreno, R.; Reveles, J. U. J. Chem. Phys. 2004, 121 (2), 681. doi:10.1063/1.1759323.
22. Dunlap, B. I.; Connolly, J. W. D.; Sabin, J. R. J. Chem. Phys. 1979, 71 (12), 4993. doi:10.1063/1.438313.
23. Mintmire, W.; Dunlap, B. I. Phys. Rev. A 1982, 25 (1), 88-95. doi:10.1103/PhysRevA.25.88.
24. Reveles, J. U.; Köster, A. M. CJ. Comput. Chem. 2004, 25, 1109. doi:10.1002/jcc.20034.
25. Alberts, B.; Johnson, A.; Lewis, J.; Raff, M.; Roberts, K.; Walter, P. In Molecular biology of the cell, 5th ed.; Garland Science, Taylor & Francis Group: New York, 2008.
26. Feese, M. D.; Faber, H. R.; Bystrom, C. E.; Pettigrew, D. W.; Remington, S. J. Structure 1998, 6 (11), 1407-1418. doi:10.1016/S0969-2126(98)00140-3.PMID: 9817843.
27. Bystrom, C. E.; Pettigrew, D. W.; Branchaud, B. P.; O'Brien, P.; Remington, S. J. Biochemistry 1999, 38 (12), 3508-3518. doi:10.1021/bi982460z. PMID:10090737.
28. Grayson, P.; Tajkhorshid, E.; Schulten, K. Biophys. J. 2003, 85 (1), 36-48. doi:10.1016/S0006-3495(03)74452-X.PMID:12829462.
29. Schlick, T. Biophys. J. 2003, 85 (1), 1-4. doi:10.1016/S0006-3495(03) 74448-8.PMID:12829458.
30. Mineva, T.; Krishnamurty, S.; Goursot, A.; Salahub, D. R. Unpublished results.