Enhanced binding of a non-hydrogen bond ligand to DNA by introducing an apurine/apyrimidine site

Chinese Journal of Chemistry

Volumn 27, Issue 6, 2009, Pages 1117-1122

  Shao, Yong ^a   Niu, Zhenjiang ^a   Chen, Jianrong ^a   Zhang, Liangke ^b  

^a ZHEJIANG NORMAL UNIVERSITY   (China)

^b CHONGQING MEDICAL UNIVERSITY   (China)

Author keywords

Apurine apyrimidine site; Binding specificity; DNA; Molecular recognition; Non hydrogen bond ligand

Indexed keywords

EID: 67651165496     PISSN: 1001604X     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cjoc.200990186     Document Type: Article

References (31)

1. Palchaudhuri, R.; Hergenrother, P. J. Curr. Opin. Biotechnol. 2007, 18, 497.
2. Lhomme, J.; Constant, J. F.; Demeunynck, M. Biopolymers 1999, 52, 65.
3. Atamna, H.; Cheung, I.; Ames, B. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000, 97, 686.
4. Zeglis, B. M.; Boland, J. A.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 7530.
5. Sankaran, N. B.; Nishizawa, S.; Seino, T.; Yoshimoto, K.; Teramae, N. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 1563.
6. Behmoaras, T.; Helene, C. A. Nature 1981, 292, 858.
7. Strekowski, L.; Wilson, B. Mutat. Res. 2007, 623, 3.
8. Yoshimoto, K.; Nishizawa, S.; Minagawa, M.; Teramae, N. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8982.
9. Constant, J. F.; Demeunynck, M. In Small Molecule DNA and RNA Binders, Wiley-VCH, Weinheim, 2003.
10. Martelli, A.; Jourdan, M.; Constant, J. F.; Demeunynck, M.; Dumy, P. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006, 16, 154.
11. Benner, K.; Granzhan, A.; Ihmels, H.; Viola, G. Eur. J. Org. Chem. 2007, 4721.
12. Tang, P.; Juang, C. L.; Harbison, G. S. Science 1990, 249, 70.
13. Ihmels, H.; Otto, D. Top. Curr. Chem. 2005, 258, 161.
14. Kalnik, M. W.; Chang, C. N.; Johnson, F.; Grollman, A. P.; Patel, D. J. Biochemistry 1989, 28, 3373.
15. Vesnaver, G.; Chang, C. N.; Eisenberg, M.; Grollman, A. P.; Breslauer, K. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1989, 86, 3614.
16. Oikawa, S.; Tada-Oikawa, S.; Kawanishi, S. Biochemistry 2001, 40, 4763.
17. Seidel, C. A. M.; Schulz, A.; Sauer, M. H. M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 5541.
18. Lukin, M.; Santos, C. Chem. Rev. 2006, 106, 607.
19. Thomes, J. C.; Weill, G.; Daune, M. Biopolymers 1969, 8, 647.
20. Owczarzy, R.; Dunietz, I.; Behlke, M. A.; Klotz, I. M.; Walder, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003, 100, 14840.
21. Nakano, S.; Fujimoto, M.; Hara, H.; Sugimoto, N. Nucl. Acids Res. 1999, 27, 2957.
22. Baase, W. A.; Johnson, W. C. Jr. Nucl. Acids Res. 1979, 6, 797.
23. Shao, Y.; Morita, K.; Dai, Q.; Nishizawa, S.; Teramae, N. Electrochem. Commun. 2008, 10, 438.
24. Withka, J. M.; Wilde, J. A.; Bolton, P. H.; Mazumder, A.; Gerlt, J. A. Biochemistry 1991, 30, 9931.
25. Garbett, N. C.; Ragazzon, P. A.; Chaires, J. B. Nat. Protoc. 2007, 2, 3166.
26. Tinoco, I.; Woody, R. W. Jr. J. Chem. Phys. 1963, 38, 1317.
27. Eriksson, M.; Norden, B. Methods Enzymol. 2001, 340, 68.
28. Scatchard, G. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1949, 51, 660.
29. Chambron, J.; Daune, M.; Sadron, C. Biochim. Biophys. Acta 1966, 123, 306.
30. Klotz, I. M.; Hunston, D. L. Biochemistry 1971, 10, 3065.
31. Ellerton, N. F.; Isenberg, I. Biopolymers 1969, 8, 767.