Structure and stability of (α-CD)3 aggregate and OEG at (α-CD)3 pseudorotaxane in aqueous solution: A molecular dynamics study

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 29, 2009, Pages 9762-9769

  Anconi, Cleber P A ^a   Nascimento Jr , Clebio S ^b   De Almeida, Wagner B ^b   Santos, Hélio F Dos ^a  

^a FEDERAL UNIVERSITY OF JUIZ DE FORA   (Brazil)

^b Belo Horizonte   (Brazil)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MOLECULAR DYNAMICS; VAN DER WAALS FORCES;

AQUEOUS MEDIA; AQUEOUS SOLUTIONS; ASSOCIATION ENERGIES; ASSOCIATION PROCESS; FORCE FIELDS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; MOLECULAR LEVELS; PSEUDOROTAXANES; SPATIAL ARRANGEMENTS; VAN DER WAALS;

DATA STORAGE EQUIPMENT;

EID: 67650819136     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp903166e     Document Type: Article

References (55)

1. Szejtli, J. Chem. Rev. 1998, 98, 1743-1753.
2. Harada, A. Acc. Chem. Res. 2001, 34, 456-464.
3. Connors, K. A. Chem. Rev. 1997, 97, 1325-1357.
4. Blenke, C.; Da Silva, V. J.; Junqueira, G. M. A.; De Almeida, W. B.; Dos Santos, H. F. THEOCHEM 2007, 809, 95-102.
5. Barr, L.; Dumanski, P. G.; Easton, C. J.; Harper, J. B.; Lee, K.; Lincoln, S. F.; Meyer, A. G.; Simpson, J. S. J. Inclusion Phenom. Macrocvclic Chem. 2004, 50, 19-24.
6. Dumanski, P. G.; Easton, C. J.; Lincoln, S. F.; Simpson, J. S. Aust. J. Chem. 2003, 56, 1107-1111.
7. Castro, E. A.; Barbiric, D. A. J.; Nascimento, C. S.; De Almeida, W. B.; Dos Santos, H. F.; Coscarello, E. Mol. Simul. 2006, 32, 623-631.
8. Dodziuk, H.; Ejchart, A.; Lukin, O.; Vysotsky, M. O. J. Org. Chem. 1999, 64, 1503-1507.
9. Dodziuk, H.; Kozminski, W.; Ejchart, A. Chirality 2004, 16, 90-105.
10. Lipkowitz, K. B.; Raghothama, S.; Yang, J. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1554-1562.
11. Liu, Y.; Han, B. H.; Sun, S. X.; Wada, T.; Inoue, Y. J. Org. Chem. 1999, 64, 1487-1493.
12. Shimomura, T.; Akai, T.; Abe, T.; Ito, K. J. Chem. Phys. 2002, 116, 1753-1756.
13. Yoshida, K.; Shimomura, T.; Ito, K.; Hayakawa, R. Langmuir 1999, 15, 910-913.
14. Bergamini, J. F.; Lagrost, C.; Ching, K. I. C.; Jouini, M.; Lacroix, J. C.; Aeiyach, S.; Lacaze, P. C. Synth. Met. 1999, 102, 1538-1539.
15. Ikeda, T.; Hirota, E.; Qoya, T.; Yui, N. Langmuir 2001, 17, 234-238.
16. Ikeda, T.; Lee, W. K.; Ooya, T.; Yui, N. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 14-19.
17. Ikeda, T.; Ooya, T.; Yui, N. Polym. Adv. Technol. 2000, 11, 830-836.
18. Li, G.; McGown, L. B. Science 1994, 264, 249-251.
19. Harada, A.; Kamachi, M. Macromolecules 1990, 23, 2821-2823.
20. Wenz, G.; Vonderbey, E.; Schmidt, L. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1992, 31, 783-785.
21. Komiyama, M.; Miyake, K.; Sumaoka, J.; Harada, A.; Shigekawa, H. Abs. Pap. Am. Chem. Soc. 1999, 217, U487.
22. Harada, A.; Li, J.; Suzuki, S.; Kamachi, M. Macromolecules 1993, 26, 5267-5268.
23. Harada, A.; Li, J.; Kamachi, M. Macromolecules 1994, 27, 4538-4543.
24. Harada, A.; Li, J.; Kamachi, M. Macromolecules 1993, 26, 5698-5703.
25. Nepogodiev, S. A.; Stoddart, J. F. Chem. Rev. 1998, 98, 1959-1976.
26. Wenz, G.; Han, B. H.; Muller, A. Chem. Rev. 2006, 106, 782-817.
27. Rekharsky, M. V.; Inoue, Y. Chem. Rev. 1998, 98, 1875-1917.
28. Harada, A.; Suzuki, S.; Okada, M.; Kamachi, M. Macromolecules 1996, 29, 5611-5614.
29. Harada, A.; Li, J.; Kamachi, M. Nature 1992, 356, 325-327.
30. Harada, A.; Li, J.; Kamachi, M. Nature 1993, 364, 516-518.
31. Samitsu, S.; Araki, J.; Shimomura, T.; Ito, K. Macromolecules 2008, 41, 5385-5392.
32. Anconi, C. P. A.; Nascimento, C. S.; De Almeida, W. B.; Dos Santos, H. F. J. Inclusion. henom. Macrocylic Chem. 2008, 60, 25-33.
33. Rusa, C. C.; Fox, J.; Tonelli, A. E. Macromolecules 2003, 36, 2742-2747.
34. Okumura, Y.; Ito, K.; Hayakawa, R. Polym. Adv. Technol. 2000, 11, 815-819.
35. Fleury, G.; Brochon, C.; Schlatter, G.; Bonnet, G.; Lapp, A.; Hadziioannou, G. Soft Matter 2005, 1, 378-385.
36. Anconi, C. P. A.; Nascimento, C. S.; De Almeida, W. B.; Dos Santos, H. F. J. Braz, Chem. Soc. 2008, 19, 1033-1040.
37. Bonnet, P.; Jaime, C.; Morin-Allory, L. J. Org. Chem. 2001, 66, 689-692.
38. Miyake, K.; Yasuda, S.; Harada, A.; Sumaoka, J.; Komiyama, M.; Shigekawa, H. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 5080-5085.
39. Anconi, C. P. A.; Nascimento, C. S.; Fedoce-Lopes, J.; Dos Santos, H. F.; De Almeida, W. B. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 12127-12135.
40. Weiner, S. J.; Kollman, P. A.; Nguyen, D. T.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 1986, 7, 230-252.
41. Weiner, S. J.; Kollman, P. A.; Case, D. A.; Singh, U. C.; Ohio, C.; Alagona, G.; Profeta, S.; Weiner, P. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 765-784.
42. Mohamadi, F.; Richards, N. G. J.; Guida, W. C.; Liskamp, R.; Lipton, M.; Caufield, C.; Chang, G.; Hendrickson, T.; Still, W. C. J. Comput. Chem. 1990, 11, 440-467.
43. Harada, A. Supramol. Sci. 1996, 3, 19-23.
44. Ryckaert, J. P. Mol. Phys. 1985, 55, 549-556.
45. Case, D. A. D.; Cheatham, T. A.; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Crowley, M.; Walker, R. C.; Zhang, W.; Merz, K. M.; Wang, B.; Hayik, S.; Roitberg, A.; Seabra, G.; Kolossváry, I.; Wong, K. F.; Paesani, F.; Vanicek, J.; Wu, X.; Bronzell, S. R.; Steinbrecher, T.; Gohlke, H.; Yang, L.; Tan, C.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Mathews, D. H.; Seetin, M. G.; Sagui, C.; Babin, V.; Kollman, P. A. AMBER 10; University of California, San Francisco: San Francisco, CA, 2008.
46. Jakalian, A.; Jack, D. B.; Bayly, C. I. J. Comput. Chem. 2002, 23, 1623-1641.
47. Bonnet, P.; Jaime, C.; Morin-Allory, L. J. Org. Chem. 2002, 67, 8602-8609.
48. Nascimento, C. S.; Anconi, C. P. A.; Dos Santos, H. F.; De Almeida, W. B. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 3209-3219.
49. Maestre, I.; Bea, I.; Ivanov, P. M.; Jaime, C. Theor. Chem. Acc. 2007, 117, 85-97.
50. Manor, P. C.; Saenger, W. J. Am. Chem. Soc. 1974, 96, 3630-3639.
51. Klar, B.; Hingerty, B.; Saenger, W. Acta Crystallogr., Sect. B 1980, 36, 1154-1165.
52. Chacko, K. K.; Saenger, W. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 1708-1715.
53. Lindner, K.; Saenger, W. Acta Crystallogr., Sect. B 1982, 38, 203-210.
54. Li, S. L.; Lan, Y. Q.; Ma, J. F.; Yang, J.; Zhang, M.; Su, Z. M. Inorg. Chem. 2008, 47, 2931-2933.
55. Lo Nostra, P.; Giustini, L.; Fratini, E.; Ninham, B. W.; Ridi, F.; Baglioni, P. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 1071-1081.