Performance of the IEF-MST solvation continuum model in a blind test prediction of hydration free energies

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 27, 2009, Pages 9330-9334

  Soteras, Ignacio ^a   Forti, Flavio ^a   Orozco, Modesto ^a,b,c   Luque, F Javier ^a  

^a UNIVERSITY OF BARCELONA   (Spain)

^b INSTITUTE FOR RESEARCH IN BIOMEDICINE   (Spain)

^c BARCELONA SUPERCOMPUTING CENTER   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AROMATIC HYDROCARBONS; CONTINUUM MECHANICS; FREE ENERGY; HYDRATION;

B3LYP/6-31G; BLIND TEST; CONTINUUM MODEL; CONTINUUM SOLVATION MODELS; DATA SETS; EXPERIMENTAL DATA; GASPHASE; HF/6-31G; HYDRATION FREE ENERGIES; MULTIFUNCTIONAL COMPOUNDS; OPTIMIZED GEOMETRIES; PARAMETRIZATION; ROOT-MEAN SQUARE DEVIATION;

SOLVATION;

EID: 67650032478     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp903514u     Document Type: Article

References (35)

1. Ben-Naim, A. Solvation Thermodynamics; Plenum Press: New York, 1987.
2. Computer Simulation in Biomolecular Systems. Theoretical and Experimental Applications; van Gunsteren, W. F., Weiner, P. K., Wilkinson, A. J., Eds.; Kluwer: Dordrecht, 1997; Vol. 3.
3. Orozco, M.; Luque, F. J. Chem. Rev. 2000, 100, 4187.
4. Cramer, C. J. Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, 2nd ed.; John Wiley & Sons: Chichester, 2004.
5. Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Chem. Rev. 1999, 99, 2161.
6. Luque, F. J.; Curutchet, C.; Muñoz-Muriedas, J.; Bidon-Chanal, A.; Soteras, I.; Morreale, A.; Gelpí, J. L.; Orozco, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 18, 3827.
7. Tomasi, J.; Mennucci, B.; Cammi, R. Chem. Rev. 2005, 105, 2999.
8. Curuchet, C.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G.; Ruiz-López, M. F.; Rinaldi, D.; Orozco, M.; Luque, F. J. J. Comput. Chem. 2003, 24, 284.
9. Rinaldi, D.; Ruiz-López, M. F.; Martins Costa, M. T. C.; Rivail, J. L. Chem. Phys. Lett. 1986, 128, 177.
10. Olivares del Valle, F. J.; Aguilar, M. A. THEOCHEM 1993, 99, 25.
11. Amovilli, C. Chem. Phys. Lett. 1994, 229, 244.
12. Bernhardsson, A.; Lindh, R.; Korlström, G.; Roos, B. O. Chem. Phys. Lett. 1996, 251, 141.
13. Amovilli, C.; Mennucci, B. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 1051.
14. Borström, M.; Ninham, B. W. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 12593.
15. Curutchet, C.; Orozco, M.; Luque, F. J.; Mennucci, B.; Tomasi, J. J. Comput. Chem. 2006, 27, 1769.
16. Kelly, C. P.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 1133.
17. Marenich, A. V.; Olson, R. M.; Kelly, C. P.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 2011.
18. Klamt, A.; Jonas, V.; Burger, T.; Lohrenz, J. C. W. J. Phys. Chem. 1998, 102, 5074.
19. Dillet, V.; Rinaldi, D.; Rivail, J.-L. J. Phys. Chem. 1994, 98, 5034.
20. Tuñón, I.; Ruiz-López, M. F.; Rinaldi, D.; Bertrán, J. J. Comput. Chem. 1996, 17, 148.
21. Curutchet, C.; Orozco, M.; Luque, F. J. J. Comput. Chem. 2001, 22, 1180.
22. Soteras, I.; Curutchet, C.; Bidon-Chanal, A.; Orozco, M.; Luque, F. J. THEOCHEM 2005, 727, 29.
23. Cancès, E.; Mennucci, B.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 1997, 107, 3032.
24. Mennucci, B.; Cancès, B.; Tomasi, J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 10506.
25. Klamt, A.; Mennucci, B.; Tomasi, J.; Barone, V.; Curutchet, C.; Orozco, M.; Luque, F. J. Acc. Chem. Res., in press
26. Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Acc. Chem. Res., in press
27. Guthrie, J. P. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 4501.
28. Pierotti, R. A. Chem. Rev. 1976, 76, 717.
29. Claverie, P.; Daudey, J. P.; Langlet, J.; Pullman, B.; Piazzola, D.; Huron, M. J. J. Phys. Chem. 1978, 82, 405.
30. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; and Pople, J. A. Gaussian03, Rev. B.04; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
31. Klamt, A.; Eckert, F.; Diedenhofen, M. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 4508.
32. Marenich, A. V.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 4538.
33. Gao, J.; Luque, F. J.; Orozco, M. J. Chem. Phys. 1993, 98, 2975.
34. Orozco, M.; Luque, F. J.; Habibollahzadeh, D.; Gao, J. J. Chem. Phys. 1995, 102, 6145.
35. Gregory, J. K.; Clary, D. C.; Liu, K.; Brown, M. G.; Saykally, R. J. Science 1997, 275, 814.