Molecular mechanics force field for octahedral organometallic compounds with inclusion of the trans influence

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 5, Issue 3, 2009, Pages 530-539

  Tubert Brohman, Ivan ^a   Schmid, Maurus ^a   Meuwly, Markus ^a  

^a UNIVERSITY OF BASEL   (Switzerland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 65249180639     PISSN: 15499618     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct800392n     Document Type: Article

References (45)

1. Strassner, T.; Taige, M. A. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 848-855.
2. Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225-11236.
3. Weiner, S. J.; Kollman, P. A.; Case, D. A.; Singh, U. C.; Ghio, C.; Alagona, G.; Profeta, S.; Weiner, P. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 765-784.
4. Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187-217.
5. Freddolino, P. L.; Arkhipov, A. S.; Larson, S. B.; McPherson, A.; Schulten, K. Structure 2006, 14, 437-449.
6. Comba, P.; Remenyi, R. Coord. Chem. ReV. 2003, 238-239, 9-20.
7. Boeyens, J. C. A.; Comba, P. Coord. Chem. ReV. 2001, 212, 3-10.
8. Comba, P.; Zimmer, M. J. Chem. Educ. 1996, 73, 108-110.
9. Bernhardt, P. V.; Comba, P. Inorg. Chem. 1992, 31, 2638-2644.
10. Comba, P. Coord. Chem. ReV. 1993, 123, 1-48.
11. Landis, C. R.; Root, D. M.; Cleveland, T. ReV. Comput. Chem. 1995, 6, 73-148.
12. Zimmer, M. Chem. ReV. 1995, 95, 2629-2649.
13. Norrby, P. O.; Brandt, P. Coord. Chem. ReV. 2001, 212, 79- 109.
14. White, D. P.; Douglass, W. Molecular Mechanics Modeling of Organometallic Catalysts. In Computational Organometallic Chemistry; Cundari, T. R., Ed.; Marcel Dekker:2001; pp 237-274.
15. Donoghue, P. J.; Helquist, P.; Norrby, P.-O.; Wiest, O. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1313-1323.
16. Comba, P.; Zimmer, M. Inorg. Chem. 1994, 33, 5368-5369.
17. Deeth, R. J. Coord. Chem. ReV. 2001, 212, 11-34.
18. Danielsson, J.; Meuwly, M. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1083-1093.
19. Roseblade, S. J.; Pfaltz, A. Acc. Chem. Res. 2007, 40, 1402- 1411.
20. Lightfoot, A.; Schnider, P.; Pfaltz, A. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1998, 37, 2897-2899.
21. Pfaltz, A.; Blankenstein, J.; Hilgraf, R.; Hormann, E.; McIntyre, S.; Menges, F.; Schonleber, M.; Smidt, S. P.; Wustenberg, B.; Zimmermann, N. AdV. Synth. Catal. 2003, 345, 33- 44.
22. Kaellstroem, K.; Munslow, I.; Andersson, P. G. Chem. Eur. J. 2006, 12, 3194-3200.
23. Cui, X.; Burgess, K. Chem. ReV. 2005, 105, 3272-3296.
24. Mazet, C.; Smidt, S. P.; Meuwly, M.; Pfaltz, A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 14176-14181.
25. Root, D. M.; Landis, C. R.; Cleveland, T. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 4201-4209.
26. Cleveland, T.; Landis, C. R. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6020-6030.
27. Landis, C. R.; Cleveland, T.; Firman, T. K. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 2641-2649.
28. Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A., III; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024-10035.
29. Piquemal, J.-P.; Williams-Hubbard, B.; Fey, N.; Deeth, R. J.; Gresh, N.; Giessner-Prettre, C. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1963-1970.
30. Deeth, R. J. Inorg. Chem. 2007, 46, 4492-4503.
31. Pidcock, A.; Richards, R. E.; Venanzi, L. M. J. Chem. Soc. A 1966, 1707, 1710.
32. Coe, B. J.; Glenwright, S. J. Coord. Chem. ReV. 2000, 203, 5-80.
33. Steele, W. V. Annu. Rep. Prog. Chem., Sect. A Inorg. Chem. 1975, 71, 103-118.
34. Brandt, P.; Norrby, T.; Aakermark, B.; Norrby, P.-O. Inorg. Chem. 1998, 37, 4120-4127.
35. Weinhold, F.; Landis, C. R. Valency and Bonding: A Natural Bond Orbital Donor-Acceptor PerspectiVe; Cambridge University Press: 2005; pp 473-474.
36. Harvey, J. N.; Heslop, K. M.; Orpen, A. G.; Pringle, P. G. Chem. Commun.(Cambridge, U.K.) 2003, 278, 279.
37. Pearson, R. G. Inorg. Chem. 1973, 12, 712-713.
38. Allen, F. H. Acta Crystallogr., Sect. B: Struct. Sci. 2002, 58, 380-388.
39. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652.
40. Frisch, M. J. ; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, ReVision B.01.
41. Glendening, E. D.; Reed, A. E.; Carpenter, J. E.; Weinhold, F. NBO Version 3.1.
42. Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 270-283.
43. MacKerell, A. D., Jr.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E., III; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616.
44. Reed, A. E.; Weinstock, R. B.; Weinhold, F. J. Chem. Phys. 1985, 83, 735-746.
45. Barrios-Landeros, F.; Pfaltz, A. Ir-catalyzed enantioselective hydrogenation of imines: Catalytic intermediates and mechanistic study. Presented at the 23rd International Conference on Organometallic Chemistry, Rennes, France, 2008.