Differential protein mapping of ovarian serous adenocarcinomas: Identification of potential markers for distinct tumor stage

Journal of Proteome Research

Volumn 8, Issue 3, 2009, Pages 1452-1463

  Wang, Yanfei ^a   Wu, Rong ^b   Cho, Kathleen R ^a,b   Thomas, Dafydd G ^b   Gossner, Gabrielle ^a   Liu, J Rebecca ^a   Giordano, Thomas J ^b   Shedden, Kerby A ^b   Misek, David E ^b   Lubman, David M ^a,b  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

^b UNIVERSITY OF MICHIGAN HEALTH SYSTEM   (United States)

Author keywords

2 D liquid separations; Cancer markers; Mass mapping; Ovarian cancer; Tissue microarrays; Tumor stage

Indexed keywords

ALPHA 1 ANTITRYPSIN; APOLIPOPROTEIN A1; DESMIN; DJ 1 PROTEIN; ELONGATION FACTOR 1ALPHA; FAR UPSTREAM ELEMENT BINDING PROTEIN 1; FUMARATE HYDRATASE; GALECTIN 1; HEAT SHOCK PROTEIN 22; HEAT SHOCK PROTEIN 70; HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN; HISTONE; HISTONE H2A; HISTONE H2B; HISTONE H3; HISTONE H4; LAMIN A; LAMIN C; LIPOCORTIN 1; PEROXIREDOXIN 2; PROTEIN; PYRUVATE KINASE; RIBOSOME PROTEIN; SH3 DOMAIN BINDING GLUTAMIC ACID RICH LIKE PROTEIN; TAR DNA BINDING PROTEIN; THIOREDOXIN; TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE; TUMOR MARKER; TUMOR PROTEIN; UNCLASSIFIED DRUG; VIMENTIN;

ADULT; AGED; AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CANCER GRADING; CANCER STAGING; CLINICAL ARTICLE; CONTROLLED STUDY; CYSTADENOCARCINOMA; CYTOSKELETON; GLYCOLYSIS; HUMAN; HUMAN TISSUE; IMMUNOHISTOCHEMISTRY; MOLECULAR EPIDEMIOLOGY; OVARY ADENOCARCINOMA; PH MEASUREMENT; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN EXPRESSION; PROTEIN LOCALIZATION; PROTEIN SYNTHESIS; PROTEIN TARGETING; REPRODUCIBILITY; REVERSED PHASE HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; TISSUE MICROARRAY;

AMINO ACID SEQUENCE; CYSTADENOCARCINOMA, SEROUS; FEMALE; HUMANS; IMMUNOHISTOCHEMISTRY; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR SEQUENCE DATA; OVARIAN NEOPLASMS; PROTEOME; TUMOR MARKERS, BIOLOGICAL;

EID: 65249098993     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr800820z     Document Type: Article

References (33)

1. Bonome, T.; Lee, J. Y.; Park, D. C.; Radonovich, M.; Pise-Masison, C.; Brady, J.; Gardner, G. J.; Hao, K.; Wong, W. H.; Barrett, J. C.; Lu, K. H.; Sood, A. K.; Gershenson, D. M.; Mok, S. C.; Birrer, M. J. Cancer Res. 2005, 65, 10602-10612.
2. Jemal, A.; Siegel, R.; Ward, E.; Murray, T.; Xu, J. Q.; Smigal, C.; Thun, M. J. Cancer J. Clinicians 2006, 56, 106-130.
3. Eltabbakh, G. H.; Yadev, P. R.; Morgan, A. Gynecol. Oncol. 1999, 75, 476-479.
4. Nagele, F.; Petru, E.; Medl, M.; Kainz, C.; Graf, A. H.; Sevelda, P. Obstet. Gynecol. 1995, 86, 259-264.
5. Schwartz, D. R.; Wu, R.; Kardia, S. L. R.; Levin, A. M.; Huang, C. C.; Shedden, K. A.; Kuick, R.; Misek, D. E.; Hanash, S. M.; Taylor, J. M. G.; Reed, H.; Hendrix, N.; Zhai, Y.; Fearon, E. R.; Cho, K. R. Cancer Res. 2003, 63, 2913-2922.
6. Schaner, M. E.; Ross, D. T.; Ciaravino, G.; Sorlie, T.; Troyanskaya, O.; Diehn, M.; Wang, Y. C.; Duran, G. E.; Sikic, T. L.; Caldeira, S.; Skomedal, H.; Tu, I. P.; Hernandez-Boussard, T.; Johnson, S. W.; O'Dwyer, P. J.; Fero, M. J.; Kristensen, G. B.; Borresen-Dale, A. L.; Hastie, T.; Tibshirani, R.; van de Rijn, M.; Teng, N. N.; Longacre, T. A.; Botstein, D.; Brown, P. O.; Sikic, B. I. Mol. Biol. Cell 2003, 14, 4376-4386.
7. Schwartz, D. R.; Kardia, S. L. R.; Shedden, K. A.; Kuick, R.; Michailidis, G.; Taylor, J. M. G.; Misek, D. E.; Wu, R.; Zhai, Y. L.; Darrah, D. M.; Reed, H.; Ellenson, L. H.; Giordano, T. J.; Fearon, E. R.; Hanash, S. M.; Cho, K. R. Cancer Res. 2002, 62, 4722-4729.
8. Alaiya, A. A.; Franzen, B.; Hagman, A.; Dysvik, B.; Roblick, U. J.; Becker, S.; Moberger, B.; Auer, G.; Linder, S. Int. J. Cancer 2002, 98, 895-899.
9. Hess, V.; A'Hern, R.; Nasiri, N.; King, D. M.; Blake, P. R.; Barton, D. P. J.; Shepherd, J. H.; Ind, T.; Bridges, J.; Harrington, K.; Kaye, S. B.; Gore, M. E. J. Clin. Oncol. 2004, 22, 1040-1044.
10. Singer, G.; Kurman, R. J.; Chang, H. W.; Cho, S. K. R.; Shih, I. M. Am. J.Pathol 2002, 160, 1223-1228.
11. Seidman, J. D.; Kurman, R. J. Am. J. Surg. Pathol. 1996, 20, 13311345.
12. Sehdev, A. E. S.; Sehdev, P. S.; Kurman, R. J. Am. J. Surg. Pathol. 2003, 27, 725-736.
13. Silva, E. G.; Tornos, C. S.; Malpica, A.; Gershenson, D. M. ModernPathol. 1997, 10, 663-667.
14. Shih, I. M.; Kurman, R. J. Am. J. Pathol. 2004, 164, 1511-1518.
15. Ahmed, N.; Oliva, K. T.; Barker, G.; Hoffmann, P.; Reeve, S.; Smith, I. A.; Quinn, M. A.; Rice, G. E. Proteomics 2005, 5, 4625-4636.
16. Jones, M. B.; Krutzsch, H.; Shu, H. J.; Zhao, Y. M.; Liotta, L. A.; Kohn, E. C.; Petricoin, E. F. Proteomics 2002, 2, 76-84.
17. Kachman, M. T.; Wang, H. X.; Schwartz, D. R.; Cho, K. R.; Lubman, D. M. Anal. Chem. 2002, 74, 1779-1791.
18. Wang, H. X.; Kachman, M. T.; Schwartz, D. R.; Cho, K. R.; Lubman, D. M. Proteomics 2004, 4, 2476-2495.
19. Hamler, R. L.; Zhu, K.; Buchanan, N. S.; Kreunin, P.; Kachman, M. T.; Miller, F. R.; Lubman, D. M. Proteomics 2004, 4, 562-577.
20. Russell, P. Blausteins pathology of the femal genital tract; Spring- erVerlag: New York, 1994; pp 705-782.
21. Scully, R. E.; Yound, R. H.; Clement, P. B. Tumors ofthe Ovary, Maldeveloped Gonads, Fallopian Tube, and Broad Ligament; Armed Forces Institute of Pathology: Washington, D. C., 1998.
22. Wang, Y. F.; Wu, R.; Cho, K. R.; Shedden, K. A.; Barder, T. J.; Lubman, D. M. Mol. Cell. Proteomics 2006, 5, 43-52.
23. Keller, A.; Nesvizhskii, A. I.; Kolker, E.; Aebersold, R. Anal. Chem. 2002, 74, 5383-5392.
24. Kononen, J.; Bubendorf, L.; Kallioniemi, A.; Barlund, M.; Schraml, P.; Leighton, S.; Torhorst, J.; Mihatsch, M. J.; Sauter, G.; Kallioniemi, O. P. Nat. Med. 1998, 4, 844-847.
25. Liu, H. B.; Sadygov, R. G.; Yates, J. R. Anal. Chem. 2004, 76, 41934201.
26. Byrne, J. A.; Tomasetto, C.; Garnier, J. M.; Rouyer, N.; Mattei, M. G.; Bellocq, J. P.; Rio, M. C.; Basset, P. Cancer Res. 1995, 55, 28962903.
27. Byrne, J. A.; Balleine, R. L.; Fejzo, M. S.; Mercieca, J.; Chiew, Y. E.; Livnat, Y.; St Heaps, L.; Peters, G. B.; Byth, K.; Karlan, B. Y.; Slamon, D. J.; Harnett, P.; Defazio, A. Int. I Cancer 2005, 117, 1049-1054.
28. Rubin, M. A.; Varambally, S.; Beroukhim, R.; Tomlins, S. A.; Rhodes, D. R.; Paris, P. L.; Hofer, M. D.; Storz-Schweizer, M.; Kuefer, R.; Fletcher, J. A.; Hsi, B. L.; Byrne, J. A.; Pienta, K. J.; Collins, C.; Sellers, W. R.; Chinnaiyan, A. M. Cancer Res. 2004, 64, 3814-3822.
29. Wang, R. X.; Xu, J. C.; Saramaki, O.; Visakorpi, T.; Sutherland, W. M.; Zhou, J. G.; Sen, B.; Lim, S. D.; Mabjeesh, N.; Amin, M.; Dong, J. T.; Petros, J. A.; Nelson, P. S.; Marshall, F. F.; Zhau, H. E.; Chung, L. W. K. Cancer Res. 2004, 64, 1589-1594.
30. Balleine, R. L.; Fejzo, M. S.; Sathasivam, P.; Basset, P.; Clarke, C. L.; Byrne, J. A. Genes, Chromosomes Cancer 2000, 29, 48-57.
31. Boutros, R.; Fanayan, S.; Shehata, M.; Byrne, J. A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004, 325, 1115-1121.
32. Fraga, C. H.; True, L. D.; Kirk, D. I Urol. 1998, 159, 270-274.
33. Cuezva, J. M.; Krajewska, M.; de Heredia, M. L.; Krajewski, S.; Santamaria, G.; Kim, H.; Zapata, J. M.; Marusawa, H.; Chamorro, M.; Reed, J. C. Cancer Res. 2002, 62, 6674-6681.